Question

Difficulty: Very hardHücre Zarı Yapısı ve Bileşenleri

Hücre zarı proteinlerinin izolasyonunda kullanılan yöntemler, proteinlerin zarla olan etkileşim tipine göre farklılık gösterir. Yapılan bir deneysel çalışmada; izole edilen bir proteinin yüksek iyonik şiddetli çözeltilerle (1MNaCl1 M NaCl) veya ekstrem pHpH değişimleriyle (pH11pH 11) zardan ayrılmadığı, ancak deterjan kullanımıyla zardan sökülebildiği saptanmıştır. Ayrıca bu proteinin sadece hücre dışı ortamla temas halinde olduğu ve fosfolipaz C muamelesiyle hücre yüzeyinden serbest kaldığı gözlenmiştir.

Buna göre, bu proteinin yapısal özellikleri ve zarla olan ilişkisiyle ilgili aşağıdaki ifadelerden hangisi doğrudur?

  1. A
    Polipeptit zinciri lipid çift katmanını boydan boya geçen bir transmembran proteindir.
  2. B
    Zarın sitoplazmik yüzeyinde bulunan ve hücre iskeletine kovalent olmayan bağlarla tutunan bir periferal proteindir.
  3. Bir lipid çapası (glikozilfosfatidilinozitol) aracılığıyla zara tutunmuş bir integral proteindir.Answer
  4. D
    Sadece zayıf elektrostatik etkileşimlerle zarın dış yüzeyine tutunmuş bir periferal proteindir.
  5. E
    Amino asit zinciri üzerinden palmitoilasyon yoluyla iç yaprağa sabitlenmiş bir proteindir.

Answer

İncelenen protein, bir glikozilfosfatidilinozitol (GPI) çapası aracılığıyla zara tutunmuş bir integral proteindir.
Deterjan kullanımı gerektirmesi bu proteinin bir 'integral protein' olduğunu gösterir; çünkü sadece iyonik şiddet veya pH değişimiyle (periferal proteinler gibi) zardan ayrılamamaktadır. Hücre zarının dış yüzeyinde bulunması ve fosfolipaz C (PLC) enzimi ile serbest bırakılabilmesi, bu proteinin spesifik olarak bir glikozilfosfatidilinozitol (GPI) çapası ile zara tutunduğunu kanıtlar. PLC enzimi, bu çapayı oluşturan fosfatidilinozitol halkasını parçalayarak proteini yüzeyden ayırır.

Step-by-Step Solution

1
Ekstraksiyon yöntemlerinin analizi
Proteinin yüksek tuz veya pH ile ayrılmaması, periferal bir protein olmadığını gösterir.
Periferal proteinler yüzeyel elektrostatik bağlarla tutunur ve iyonik şiddet artışıyla koparlar.
2
Deterjan gereksiniminin değerlendirilmesi
Deterjanla ekstrakte edilebilmesi, proteinin integral membran proteini sınıfına girdiğini doğrular.
İntegral proteinlerin zardan ayrılması için lipid çift katmanının hidrofobik etkileşimlerinin bozulması gerekir.
3
Enzimatik duyarlılığın kontrolü
Fosfolipaz C (PLC) muamelesiyle serbest kalması, proteinin bir lipid çapasına bağlı olduğunu gösterir.
PLC, fosfatidilinozitol bağlarını kopararak GPI çapalı proteinleri yüzeyden salar.
4
Lokalizasyonun birleştirilmesi
Dış yüzey yerleşimi GPI çapası ile tam uyumludur.
GPI çapalı proteinler hücre zarının sadece dış yaprağında (outer leaflet) sentezlenir ve bulunur.

Key Concept

Membran proteinlerinin zara tutunma mekanizmaları ve izolasyon karakteristikleri
Rate this question