Question

Difficulty: HardOksidatif Fosforilasyon ve Kemiozmotik Teori

Mitokondriyal iç zarda yer alan FoF1F_oF_1-ATP sentazın işleyişi sırasında, kemiozmotik enerjinin (proton-motif kuvvet) mekanik enerjiye (rotasyonel enerji) dönüşümü aa ve cc alt birimleri arasındaki etkileşimle gerçekleşir. Bu mekanizmanın moleküler detayları göz önüne alındığında, protonların taşınımı ile ilgili aşağıdaki ifadelerden hangisi doğrudur?

  1. İntermembran aralıktaki protonlar aa alt birimindeki yarı kanala girerek cc halkasındaki aspartat kalıntılarını protonlar; bu nötralizasyon aspartatın hidrofobik membran fazına geçişine ve halkanın dönmesine izin verir.Answer
  2. B
    Protonlar cc halkasının merkezinde bulunan hidrofilik bir kanaldan doğrudan matrikse akar ve bu akış pervaneye benzer bir tork oluşturarak halkayı döndürür.
  3. C
    aa alt birimindeki korunmuş arginin kalıntısı, protonlanmış (yüksüz) aspartat kalıntılarını elektrostatik olarak iterek cc halkasının saat yönünde dönmesini sağlar.
  4. D
    Protonların aa alt birimindeki hareketi, F1F_1 parçasındaki γ\gamma (gama) alt biriminin doğrudan protonlanmasına neden olur ve bu durum katalitik bölgelerde ATP sentezini tetikler.

Answer

Protonların intermembran aralıktan gelerek c halkasındaki aspartat kalıntılarını protonlaması ve bu sayede halkanın lipid tabakası içinde dönmesini açıklamaktır.
Doğru ifadede belirtildiği üzere, FoF_o motoru bir 'Brownian ratchet' prensibiyle çalışır. Protonların aa alt birimindeki intermembran aralığa bakan kanaldan girip cc halkasındaki aspartat/glutamat kalıntılarını protonlayarak nötrleştirmesi, bu kalıntıların lipid fazına girmesine imkan tanır. Bu sayede kemiozmotik gradyan mekanik rotasyona dönüşür.

Step-by-Step Solution

1
Protonun aa alt birimine girişi
İntermembran aralıktaki yüksek konsantrasyonlu protonlar aa alt biriminin sitozolik yarı kanalına girer.
Kemiozmotik gradyan protonları düşük pH'lı bölgeden kanala doğru iter.
2
cc alt birimindeki Aspartat kalıntısının protonlanması
cc alt birimindeki negatif yüklü aspartat kalıntısı protonu alarak nötr hale gelir.
Negatif yüklü aspartat hidrofobik membran içine giremez; nötralizasyon bu engeli ortadan kaldırır.
3
Rotasyonun gerçekleşmesi
Nötralize olan cc alt birimi lipid tabakasına doğru dönerken, bir başka cc birimi matriks kanalı hizasına gelir.
Termal hareketler (Brownian motion) sayesinde nötrleşen birimin membrana girmesiyle halka döner.
4
Protonun matrikse salınması
Matriks kanalına ulaşan protonlu aspartat, aa alt birimindeki Arginin kalıntısı ile etkileşime girer ve protonu matriks yarı kanalına bırakır.
Düşük proton konsantrasyonlu matriks ve Arginin'in elektrostatik etkisi protonun ayrılmasını sağlar.

Key Concept

Brownian Ratchet Mekanizması ve Fo Sektörü Rotasyonu

Alternative Method

Binding Change Mechanism (Boyer) ile Fo rotasyonu arasındaki ilişkiyi düşünerek, Fo'daki rotasyonun F1'deki gama alt birimini döndürdüğünü ve bunun beta alt birimlerindeki L (Loose), T (Tight) ve O (Open) konformasyonlarını değiştirdiğini hatırlamak çözümde eleme yapmayı kolaylaştırır.
Estimated Time:2m 0s
Rate this question