Question

Difficulty: HardEnzimlerin Yapısal Özellikleri ve Sınıflandırma

Glikoliz yolağında 2-fosfogliserat molekülünden bir su molekülü çıkararak yüksek enerjili bir bileşik olan fosfoenolpiruvat (PEP) sentezini katalizleyen enolaz enzimi, aktif bölge stabilitesi ve katalitik aktivite için mutlaka Mg2+Mg^{2+} iyonlarına gereksinim duyar. Enzimin inaktif protein kısmı (apoenzim) ile bu metal iyonunun (kofaktör) birleşmesiyle oluşan fonksiyonel yapıya 'holoenzim' adı verilir.

Katalizlediği reaksiyon mekanizması (su ayrılması yoluyla çift bağ oluşumu) dikkate alındığında, enolaz enzimi IUBMB (International Union of Biochemistry and Molecular Biology) sınıflamasına göre aşağıdaki enzim gruplarının hangisinde yer alır?

  1. A
    Oksidoredüktaz (EC 1)
  2. B
    Transferaz (EC 2)
  3. C
    Hidrolaz (EC 3)
  4. Liyaz (EC 4)Answer
  5. E
    Ligaz (EC 6)

Answer

Enolaz enzimi, bir eliminasyon reaksiyonu ile su açığa çıkarıp çift bağ oluşturduğu için Liyazlar (EC 4) sınıfında yer alır.
Liyazlar grubu, oksidasyon veya hidroliz mekanizmalarını kullanmadan bağları parçalayarak çift bağ oluşumuna (veya tersi yönde çift bağa grup eklenmesine) neden olan enzimleri içerir. Enolaz, 2-fosfogliseratın 2. ve 3. karbonları arasından su çıkararak (eliminasyon) bir çift bağ (PEP) oluşturduğu için tipik bir liyaz (hidro-liyaz) örneğidir.

Step-by-Step Solution

1
Reaksiyon tipini belirle.
2-fosfogliserat → Fosfoenolpiruvat + H2OH_2O
Reaksiyonda suyun bir ürün olarak ayrıldığı (dehidrasyon) ve PEP yapısında bir çift bağ oluştuğu görülmektedir.
2
Enerji ve redoks gereksinimini kontrol et.
ATP kullanılmaz, NAD/FAD değişimi yoktur.
Bu durum enzimin Ligaz (EC 6) veya Oksidoredüktaz (EC 1) olamayacağını gösterir.
3
IUBMB sınıflandırma kurallarını uygula.
Liyaz (EC 4) sınıfı.
Hidroliz veya oksidasyon içermeyen bağ kopmaları ve çift bağ oluşumları tipik olarak liyazların (spesifik olarak hidratazlar/dehidratazlar) özelliğidir.

Key Concept

Liyazlar (EC 4), bir çift bağa grup eklenmesini veya bir gruptan (su, amonyak, CO2CO_2) çift bağ oluşumuyla ayrılmasını katalizleyen enzim sınıfıdır.

Hints

1
Enzimin ismindeki 'sentaz' veya 'hidrataz' gibi ekler genellikle hangi ana sınıfa işaret eder?
2
Reaksiyonda suyun substrat mı yoksa ürün mü olduğuna dikkat edin.
3
Çift bağ oluşumu veya çift bağın doyurulması (oksidasyon-redüksiyon olmadan) EC 4 sınıfının karakteristik özelliğidir.

Practice More

Fumaraz (fumarat hidrataz) ve akonitaz gibi diğer TCA döngüsü enzimlerinin sınıflarını liyaz mekanizması üzerinden inceleyebilirsiniz.
Estimated Time:1m 30s
Rate this question