Examkin

Protein Sentezi (Translasyon)

24 questions

Question 1Question →

Hücrelerde protein sentezi (translasyon) süreci, mRNA üzerindeki genetik bilginin okunmasıyla gerçekleşir. Polipeptit zincirinin sentezini sonlandıran ve herhangi bir amino asit kodlamayan durdurucu (terminationtermination) kodonlardan biri aşağıdakilerden hangisidir?

Show answer & explanation

Answer: UAGUAG

Answer

UAGUAG kodonu, protein sentezini sonlandıran üç durdurucu kodondan biridir.
Protein sentezinde polipeptit zincirinin uzaması, ribozomun A bölgesine UAAUAA, UAGUAG veya UGAUGA durdurucu kodonlarından birinin gelmesiyle sona erer. Bu kodonlar herhangi bir amino asit kodlamadıkları için tRNAtRNA yerine salınım faktörleri tarafından tanınırlar. Dolayısıyla 'UAGUAG' ifadesi doğru yanıttır.

Step-by-Step Solution

1
Durdurucu kodonların tanımlanması
UAAUAA, UAGUAG ve UGAUGA kodonları durdurucu kodonlardır.
Bu kodonlar amino asit kodlamazlar.
2
Kodonun işlevinin belirlenmesi
Durdurucu kodonlara salınım faktörleri (releasefactorsrelease factors) bağlanır.
Bu bağlanma, polipeptit zincirinin ribozomdan ayrılmasını sağlar.

Key Concept

Durdurucu kodonlar (nonsensenonsense kodonlar), translasyonu sonlandırır ve amino asit karşılığı bulunmaz.

Hints

1
Durdurucu kodonlar, amino asit kodlamadıkları için 'anlamsız' (nonsensenonsense) kodonlar olarak da bilinirler.
2
Toplam üç adet durdurucu kodon vardır: UAAUAA, UAGUAG ve UGAUGA.

Practice More

Durdurucu kodonlara bağlanan salınım faktörlerinin (eRF1eRF1, eRF3eRF3) mekanizmasını inceleyebilirsiniz.
Estimated Time:45s
Question 2Question →

Ökaryotik hücrelerde gerçekleşen protein sentezi (translasyon) sürecindeki peptid bağı oluşumu (transpeptidasyon) reaksiyonu ile ilgili aşağıdaki ifadelerden hangisi doğrudur?

Show answer & explanation

Answer: Peptidil transferaz enzim aktivitesi, 28S28S rRNArRNA tarafından sağlanan bir ribozim etkisidir.

Answer

Peptidil transferaz enzim aktivitesi, 28S28S rRNArRNA tarafından sağlanan bir ribozim etkisidir.
Doğru ifade, peptidil transferaz aktivitesinin ökaryotik hücrelerde 28S28S rRNArRNA (prokaryotlarda 23S23S rRNArRNA) tarafından sağlanan bir ribozim özelliği olduğunu belirtmektedir. Bu reaksiyon sırasında dışarıdan enerji girişi olmaz; enerji, aminoaçil-tRNAtRNA’daki yüksek enerjili bağdan karşılanır.

Step-by-Step Solution

1
Reaksiyonun hücresel konumunu belirleyin.
Peptid bağı oluşumu ribozomun büyük alt biriminde (60S60S) gerçekleşir.
Katalitik merkez olan peptidil transferaz bölgesi büyük alt birimde yer alır.
2
Katalizör mekanizmasını analiz edin.
Bu bir protein enzimi değil, bir rRNArRNA (28S28S) tarafından yürütülen ribozim aktivitesidir.
Ribozomun evrimsel süreçte bir ribozim olarak geliştiği ve peptid bağı oluşumunun rRNArRNA katalizli olduğu bilinmektedir.
3
Enerji gereksinimini değerlendirin.
Transpeptidasyon basamağında serbest GTPGTP veya ATPATP tüketilmez.
Enerji, amino asidin tRNAtRNA'ya bağlandığı aktivasyon basamağında harcanan ATPATP sayesinde ester bağında depolanmıştır.

Key Concept

Peptidil Transferaz ve Ribozim Kavramı
Estimated Time:1m 15s
Question 3Question →

Protein sentezi (translasyon) sürecindeki moleküler basamaklar, enerji kullanımı ve inhibitörlerin etki mekanizmalarıyla ilgili aşağıdaki ifadelerden hangisi yanlıştır?

Show answer & explanation

Answer: Tetrasiklinler, prokaryotik ribozomun 50S50S alt birimine bağlanarak aminoaçil-tRNA'ların A bölgesine girişini ve böylece polipeptit zincirinin uzamasını engeller.

Answer

Tetrasiklinler prokaryotik ribozomun 50S50S alt birimine değil, 30S30S alt birimine bağlanarak etki gösterirler.
Tetrasiklin grubu antibiyotikler, prokaryotik ribozomun küçük alt birimi olan 30S30S yapısına bağlanırlar. Bu bağlanma, aminoaçil-tRNA'nın ribozom üzerindeki A (akseptör) bölgesine girişini fiziksel olarak engeller ve polipeptit zincirinin uzamasını (elongasyon) durdurur. İfadedeki 50S50S bilgisi hatalıdır; 50S50S alt birimine bağlanan temel inhibitörler kloramfenikol, makrolidler (eritromisin vb.) ve linkozamitlerdir.

Step-by-Step Solution

1
Amino asit aktivasyonu enerjisini değerlendir.
Doğru.
ATP→AMPATP \rightarrow AMP dönüşümü iki yüksek enerjili bağ tüketimi anlamına gelir.
2
Uzama faktörlerinin (EF−Tu/EF−TsEF-Tu/EF-Ts) döngüsünü kontrol et.
Doğru.
EF−TsEF-Ts, EF−TuEF-Tu için gerekli olan guanin nükleotid değişim faktörüdür.
3
Protein sentezi inhibitörlerinin ribozomal alt birim özgüllüğünü hatırla.
Hatalı bilgi saptandı.
Tetrasiklinler ve aminoglikozitler 30S30S alt birimine bağlanırken; kloramfenikol, makrolidler ve klindamisin 50S50S alt birimine bağlanır.
4
Fusidik asit ve Puromisin mekanizmalarını doğrula.
Doğru.
Fusidik asit translokasyon sonrası ayrılmayı engeller, Puromisin ise her iki hücre tipinde de erken terminasyon yapar.

Key Concept

Ribozomal İnhibitörler ve Translasyon Enerjetiği
Question 4Question →

Selenosistein, protein sentezi sırasında standart genetik kodun dışına çıkılarak polipeptid zincirine dahil edilen ve '21. amino asit' olarak bilinen özel bir yapı taşıdır. Ökaryotik hücrelerde bir proteinin yapısına selenosistein eklenebilmesi için mRNAmRNA üzerinde gerçekleşmesi gereken yapısal ve işlevsel olaylar değerlendirildiğinde, aşağıdakilerden hangisinin gerçekleşmesi zorunludur?

Show answer & explanation

Answer: mRNAmRNA’nın 3' transle edilmeyen bölgesinde (3'-UTR) bulunan SECIS (Selenocysteine Insertion Sequence) elementinin özgül proteinler tarafından tanınması

Answer

Selenosistein inkorporasyonu için mRNA'nın 3'-UTR bölgesindeki SECIS elementinin varlığı ve bu bölgeye bağlanan proteinlerin eEFSec faktörü aracılığıyla selenosistein-tRNA'yı ribozoma getirmesi zorunludur.
Selenosistein protein sentezine dahil edilirken, mRNA üzerinde normalde bir 'dur' sinyali olan UGA kodonu kullanılır. Bu kodonun durdurma yerine selenosistein eklenmesi için okunması (recoding), mRNA'nın 3' transle edilmeyen bölgesinde (3'-UTR) bulunan SECIS (Selenocysteine Insertion Sequence) adı verilen özel bir ilmek yapısı sayesinde gerçekleşir. Bu yapıya bağlanan SBP2 proteini ve selenosisteine özgü uzama faktörü (eEFSec), selenosistein yüklü tRNA'yı ribozoma getirir.

Step-by-Step Solution

1
Kodon tayini
UGAUGA kodonunun belirlenmesi
Selenosistein, normalde durdurucu bir kodon olan UGAUGA kodonuna karşılık protein zincirine girer.
2
tRNAtRNA yükleme mekanizmasının analizi
Serin yüklü tRNA[Ser]SectRNA^{[Ser]Sec} oluşumu
Önce tRNAtRNA’ya serin yüklenir, ardından bu serin tRNAtRNA üzerinde selenosisteine dönüştürülür.
3
Sinyal dizisinin (SECIS) konumunun belirlenmesi
3'-UTR bölgesindeki SECIS ilmiğinin aktivasyonu
UGAUGA’nın durdurucu olarak değil de selenosistein olarak okunması için mRNAmRNA’nın 3' ucundaki SECIS yapısı ve buna bağlanan SBP2SBP2 proteini gereklidir.
4
Translasyonel uzama faktörü ile etkileşim
eEFSeceEFSec faktörünün tRNAtRNA’yı ribozoma getirmesi
Özgül uzama faktörü eEFSeceEFSec, SECIS yapısı ile koordine çalışarak selenosistein-tRNAtRNA’yı ribozomun A bölgesine taşır.

Key Concept

Selenosistein (21. amino asit) kotranslasyonel inkorporasyon mekanizması: UGA kodonu + 3'-UTR SECIS elementi + eEFSec.

Hints

1
Selenosistein inkorporasyonu için normal bir durdurucu kodonun 'yeniden programlanması' gerekir.
2
Bu 'yeniden programlama' sinyali mRNA'nın translasyonu sonlandıran bölgesinden sonraki (3') kısımlarda gizlidir.

Practice More

Prokaryotlarda SECIS elementinin konumu ile ökaryotlardaki farkını (prokaryotlarda kodlama bölgesi içindedir) incelemek konuyu pekiştirecektir.
Estimated Time:2m 0s
Question 5Question →

Ökaryotik hücrelerde protein sentezinin elongasyon (uzama) evresinde, ribozomun mRNAmRNA üzerinde bir kodon ilerlemesini (translokasyon) sağlayan faktörün inaktivasyonu translasyonu durdurur. *Corynebacterium diphtheriae* tarafından üretilen difteri toksini, aşağıdaki faktörlerden hangisini NAD+NAD^+ kullanarak post-translasyonel bir modifikasyon olan ADP-ribozilasyonu ile kalıcı olarak inaktive eder?

Show answer & explanation

Answer: eEF−2eEF-2 (Ökaryotik Elongasyon Faktörü 2)

Answer

Difteri toksini, ökaryotik translasyonun elongasyon basamağında görevli olan eEF−2eEF-2 faktörünü ADP-ribozilasyonu ile inaktive eder.
Difteri toksini, ökaryotik hücrelerde translasyonun elongasyon (uzama) evresinde görev yapan eEF−2eEF-2 faktörünü hedef alır. Toksin, NAD+NAD^+ molekülünden gelen ADP-riboz grubunu eEF−2eEF-2 üzerindeki 'difthamid' adı verilen modifiye bir histidin kalıntısına aktararak (ADP-ribozilasyonu) faktörü kalıcı olarak inaktive eder. Bu durum ribozomun translokasyon yapmasını engeller ve protein sentezi durur.

Step-by-Step Solution

1
Toksinin etki ettiği hücresel süreci belirle.
Difteri toksini protein sentezini (translasyon) inhibe eder.
Toksinin patofizyolojik etkisinin temelinde translasyon blokajı yatar.
2
Toksinin biyokimyasal etki mekanizmasını tanımla.
NAD+NAD^+ kullanılarak gerçekleştirilen ADP-ribozilasyonu modifikasyonu.
Bu modifikasyon, hedef proteinin yapısını değiştirerek görev yapmasını engeller.
3
Translokasyon basamağında görevli olan spesifik hedef faktörü seç.
eEF−2eEF-2 (prokaryotlardaki karşılığı EF-G'dir).
Ribozomun mRNA üzerinde kaymasını (translokasyon) sağlayan temel faktör eEF−2eEF-2'dir.

Key Concept

Difteri toksini, ökaryotik elongasyon faktörü 2'yi (eEF−2eEF-2) ADP-ribozilasyonu yoluyla inaktive ederek protein sentezini durdurur.

Practice More

Pseudomonas ekzotoksini A'nın mekanizması ile difteri toksini mekanizmasının benzerliğini ve Şiga toksininin ribozomal RNA (28S rRNA) üzerindeki farklı etkisini karşılaştırın.
Estimated Time:1m 30s
Question 6Question →

Ökaryotik hücrelerde protein sentezinin uzama (elongasyon) evresinde, peptidil-tRNAtRNA’nın ribozomun AA bölgesinden PP bölgesine kaymasını (translokasyon) sağlayan GTPGTP-bağımlı faktör ve bu faktörü ADPADP-ribozilasyon mekanizması ile geri dönüşümsüz olarak inaktive eden ekzotoksin aşağıdakilerin hangisinde birlikte verilmiştir?

Show answer & explanation

Answer: eEF−2eEF-2 - Difteri toksini

Answer

Translokasyonu sağlayan faktör eEF−2eEF-2’dir ve bu faktörü ADPADP-ribozilasyon ile inhibe eden ajan Difteri toksinidir.
Protein sentezinin uzama evresinde, her bir peptid bağı oluşumundan sonra ribozomun bir sonraki kodona kayması gerekir. Ökaryotlarda bu işlemi eEF−2eEF-2 (Prokaryotlarda EF−GEF-G) faktörü GTPGTP harcayarak gerçekleştirir. Difteri toksini, bu faktörün yapısındaki özel bir amino asit olan diftamid bölgesine ADPADP-riboz grubu ekleyerek onu işlevsiz hale getirir. Bu durum hücrede protein sentezinin tamamen durmasına ve hücre ölümüne yol açar.

Step-by-Step Solution

1
Ökaryotik translasyonda translokasyon basamağını yürüten proteini belirle.
Ökaryotik Uzama Faktörü 2 (eEF−2eEF-2).
Ribozomun mRNAmRNA üzerinde bir kodon ilerlemesi için eEF−2eEF-2 ve GTPGTP hidrolizi gereklidir.
2
Bu faktörün spesifik inhibitörünü ve etki mekanizmasını hatırla.
Difteri toksini (ve Pseudomonas Ekzotoksin A).
Difteri toksini, eEF−2eEF-2 molekülündeki diftamid kalıntısına NAD+NAD^+ kullanarak ADPADP-riboz grubu ekler (ADPADP-ribozilasyon).
3
Verilen seçenekler arasında doğru eşleştirmeyi seç.
eEF−2eEF-2 ve Difteri toksini eşleşmesi doğrudur.
Diğer seçeneklerde ya başlatma/sonlanma faktörleri ya da farklı etki mekanizmasına sahip toksinler yer almaktadır.

Key Concept

Ökaryotik protein sentezinde eEF−2eEF-2, GTPGTP enerjisini kullanarak translokasyonu gerçekleştirir ve Difteri toksini tarafından ADPADP-ribozilasyon yoluyla inhibe edilir.

Practice More

Prokaryotik ve ökaryotik translasyon faktörlerinin isimsel karşılıklarını ve hangi antibiyotiğin hangi ribozomal alt birime bağlandığını tekrar ediniz.
Estimated Time:1m 30s
Question 7Question →

Ökaryotik hücrelerde protein sentezinin uzama (elongation) evresindeki faktör etkileşimleri, enerji kullanımı ve inhibitör mekanizmaları ile ilgili aşağıdaki ifadelerden hangisi yanlıştır?

Show answer & explanation

Answer: eEF−2eEF-2 faktörü, ribozomun mRNA üzerinde bir kodon ilerlemesi (translokasyon) için gerekli olan enerjiyi ATP hidrolizinden sağlar.

Answer

eEF-2 faktörü, translokasyon aşamasında mRNA üzerinde bir kodon ilerlemesi için ATP değil, GTP hidrolizini kullanır.
Doğru yanıt olan seçenek, translokasyon sırasında ATP kullanıldığını iddia ettiği için yanlıştır. Ökaryotik elongasyon faktörü 2 (eEF−2eEF-2), tıpkı prokaryotlardaki dengi olan EF−GEF-G gibi, ribozomun mRNA üzerinde 5' →\rightarrow 3' yönünde bir kodon kayması (translokasyon) için GTP hidrolizinden gelen enerjiyi kullanır.

Step-by-Step Solution

1
Uzama evresinin her bir döngüsünde harcanan enerji kaynaklarını belirle.
Her bir amino asit için 2 GTP (biri A bölgesine giriş, biri translokasyon için) harcanır.
Protein sentezindeki tüm uzama ve sonlanma basamakları GTPase aktivitesi gösteren faktörler tarafından kontrol edilir.
2
eEF-2 faktörünün nükleotid özgüllüğünü kontrol et.
eEF-2 bir GTPase'dir.
ATP sadece amino asit aktivasyonu (tRNA şarj edilmesi) ve ökaryotik başlatma sırasında mRNA tarama (scanning) basamağında doğrudan kullanılır.

Key Concept

Ökaryotik translasyonun elongasyon basamağında GTP nükleotidinin temel enerji kaynağı olması.

Practice More

Protein sentezi için harcanan net yüksek enerjili bağ sayısını (ATP ve GTP toplamı) 100 amino asitlik bir örnek üzerinden tekrar hesaplayın.
Estimated Time:1m 40s
Question 8Question →

Ökaryotik hücrelerde protein sentezinin başlama (inisiasyon) aşamasında gerçekleşen mRNAmRNA’nın taranması (scanning) ve başlangıç kompleksinin oluşumu süreci ile ilgili aşağıdaki ifadelerden hangisi doğrudur?

Show answer & explanation

Answer: mRNAmRNA’nın 5' kep (cap) yapısı eIF4FeIF4F kompleksinin bir parçası olan eIF4EeIF4E tarafından tanınırken, mRNAmRNA üzerindeki sekonder yapıların çözülerek AUGAUG kodonunun taranması için ATPATP hidrolizi gereklidir.

Answer

Ökaryotik translasyon inisiyasyonunda kep yapısı eIF4EeIF4E tarafından tanınır ve eIF4AeIF4A helikaz aktivitesiyle mRNAmRNA'yı taramak için ATPATP harcar.
Ökaryotik hücrelerde translasyonun başlaması için eIF4FeIF4F kompleksi gereklidir. Bu kompleksin eIF4EeIF4E alt birimi 5' kep yapısına bağlanır. eIF4AeIF4A ise bir ATPATP bağımlı RNA helikazdır; mRNAmRNA’daki sekonder yapıları (saç tokası yapıları vb.) çözerek 40S40S ribozomal alt biriminin AUGAUG başlangıç kodonunu bulana kadar mRNAmRNA üzerinde ilerlemesini (scanningscanning) sağlar.

Step-by-Step Solution

1
Ökaryotik başlama faktörlerinin (eIFeIF) görevlerini analiz et.
eIF4FeIF4F kompleksi (4E,4A,4G4E, 4A, 4G) mRNAmRNA’nın 5' ucuna bağlanır.
Protein sentezinin başlayabilmesi için mRNAmRNA’nın ribozom tarafından tanınması gerekir.
2
Tarama (scanning) sürecindeki enerji kaynağını belirle.
eIF4AeIF4A helikazı ATPATP kullanarak mRNAmRNA’nın ikincil yapılarını çözer.
Ribozomun AUGAUG kodonuna ulaşabilmesi için mRNAmRNA üzerindeki düğümlerin açılması gerekir.
3
Prokaryotik ve ökaryotik farkları değerlendir.
Prokaryotlar Shine−DalgarnoShine-Dalgarno kullanırken, ökaryotlar scanningscanning yapar.
İki sistem arasındaki temel mekanik fark budur.

Key Concept

Ökaryotik Translasyon İnisiyasyonu ve Enerji Kullanımı
Estimated Time:1m 50s
Question 9Question →

Ökaryotik hücrelerde selenosistein (Sec) amino asidinin translasyonel olarak polipeptit zincirine dahil edilmesi süreci; görev alan özgül moleküler bileşenler, enerji tüketimi ve inhibitör etkileşimleri açısından standart protein sentezi mekanizmalarından belirgin farklılıklar gösterir. Bu özel translasyonel süreçle ilgili aşağıdaki ifadelerden hangisi yanlıştır?

Show answer & explanation

Answer: UGAUGA kodonunun durdurucu sinyal yerine selenosistein girişi olarak okunmasını sağlayan SECIS elementi, ökaryotik mRNA'larda kodlayan bölgenin (ORF) hemen önündeki 5' UTR bölgesinde konumlanır.

Answer

SECIS elementinin ökaryotik mRNA'larda 5' UTR bölgesinde bulunduğu ifadesi yanlıştır; bu yapı ökaryotlarda 3' UTR'de yer alır.
Doğru yanıt olan seçenek, SECIS (Selenocysteine Insertion Sequence) elementinin ökaryotik mRNA'lardaki konumunu hatalı vermektedir. Prokaryotlarda SECIS dizisi kodlanan bölgenin (ORF) içinde UGAUGA kodonunun hemen yanında bulunurken, ökaryotlarda bu yapı her zaman stop kodonunun çok uzağında, 3' UTR (3' çevrilmeyen bölge) içerisinde yer alır. Bu yapısal fark, ökaryotik ribozomun UGAUGA kodonunu selenosistein olarak okuması (recoding) için eEFSec faktörünü uygun şekilde konumlandırır.

Step-by-Step Solution

1
tRNA Yükleme Aşaması
Seril-tRNA sentetaz, ATPATP kullanarak serini tRNA[Ser]SectRNA^{[Ser]Sec} üzerine yükler.
Selenosistein için özgül bir sentetaz enzimi bulunmaz.
2
Modifikasyon ve Enerji Tüketimi
PSTK enzimi serini fosforiller (1ATP1 ATP), ardından selenofosfat sentetaz ile aktif selenofosfat (2∼P2 \sim P bağı) eklenerek selenosistein oluşur.
Amino asit tRNA üzerinde sentezlenir.
3
Kod Değişimi (Recoding) ve Konum Analizi
Ribozom UGAUGA kodonuna geldiğinde, 3' UTR'deki SECIS yapısı eEFSec faktörünü A bölgesine çağırır.
Ökaryotlarda SECIS'in 3' UTR'de olması, sistemin durdurucu kodonu tanımasını sağlar.
4
Elongasyon ve İnhibitör Kontrolü
eEFSec faktörü GTPGTP harcayarak tRNA'yı A sitesine yerleştirir; bu süreç eEF2'yi etkileyen Difteri toksininden etkilenmez.
Difteri toksini sadece translokasyon (kayma) adımını katalize eden eEF2'yi ADP-riboziller.

Key Concept

Ökaryotlarda selenosistein (21. AA) birleşimi; özel bir tRNA (tRNA[Ser]SectRNA^{[Ser]Sec}), özel bir elongasyon faktörü (eEFSeceEFSec) ve mRNA 3' UTR bölgesindeki SECIS elemanı varlığında gerçekleşir.

Practice More

Selenosistein sentezindeki enerji maliyetini, standart bir amino asidin (4 yüksek enerjili bağ) maliyetiyle karşılaştırarak metabolik yükü analiz edin.
Estimated Time:3m 0s
Question 10Question →

Hücrede gerçekleşen protein sentezi (translasyon) süreci, oldukça yüksek enerji maliyeti olan bir biyosentez yoludur. Bu sürecin farklı basamaklarında farklı nükleotidler enerji kaynağı olarak kullanılır. Buna göre, translasyon sürecinde gerçekleşen aşağıdaki olaylardan hangisinde yüksek enerjili guanozin trifosfat (GTPGTP) hidrolizi doğrudan bir gereklilik değildir?

Show answer & explanation

Answer: Amino asitlerin spesifik tRNAtRNA’lara bağlanarak aminoaçil-tRNAtRNA oluşturması

Answer

Amino asitlerin spesifik tRNA’lara bağlanarak aminoaçil-tRNA oluşturması basamağında GTP değil, ATP kullanılır.
Amino asitlerin tRNA'lara bağlanması (aminoaçil-tRNA sentezi), aminoaçil-tRNA sentetaz enzimi tarafından katalizlenen ve ATP'nin AMP ve pirofosfata (PPiPP_i) hidroliz edildiği bir reaksiyondur. Bu basamak, translasyonun ribozom dışındaki 'aktivasyon' aşamasıdır ve GTP gerektirmez.

Step-by-Step Solution

1
Amino asit aktivasyonu (şarj edilme) basamağını incele.
Amino asit + ATP + tRNA →\rightarrow Aminoaçil-tRNA + AMP + 2Pi reaksiyonu gerçekleşir.
Aminoaçil-tRNA sentetaz enzimi, amino asidi aktive etmek için ATP'yi AMP ve PPi'ye parçalar.
2
Translasyonun inisiasyon, elongasyon ve terminasyon evrelerini karşılaştır.
Bu üç ana evrede görev alan faktörler (eIF-2, eEF-1, eEF-2, RF-3) GTPaz aktivitesine sahiptir.
Ribozom üzerindeki konformasyonel değişiklikler ve faktörlerin ayrılması için GTP enerjisi gereklidir.

Key Concept

Protein sentezinde enerji kullanımı: Amino asit aktivasyonu ATP, translasyon döngüsü (başlama, uzama, bitiş) GTP bağımlıdır.
Question 11Question →

Prokaryotik hücrelerde protein sentezi (translasyon) süreci, bu süreçte görev alan faktörler ve süreci inhibe eden ajanlarla ilgili aşağıdaki ifadelerden hangisi doğrudur?

Show answer & explanation

Answer: Linezolid, 50S alt birimindeki 23S rRNA'ya bağlanarak 70S inisiyasyon kompleksinin oluşumunu inhibe eder.

Answer

Linezolid'in 50S alt birimine bağlanarak 70S inisiyasyon kompleksinin oluşumunu engellemesi doğru bir ifadedir.
Linezolid, oksazolidinon sınıfı bir antibiyotik olup 50S ribozomal alt biriminin 23S rRNA kısmına bağlanır. Bu bağlanma, 30S inisiyasyon kompleksinin 50S alt birimi ile birleşerek fonksiyonel 70S kompleksini oluşturmasını fiziksel olarak engeller. Bu, protein sentezinin en erken aşamalarından biridir.

Step-by-Step Solution

1
Prokaryotik inisiyasyon faktörlerinin (IF) rollerini ve bağlandıkları bölgeleri analiz et.
IF-1 ve IF-3 30S alt birimine bağlanır; IF-2 ise GTP bağımlı olarak fMet-tRNA'yı getirir.
İnisiyasyonun doğru gerçekleşmesi için alt birimlerin ayrık kalması ve uygun enerji kaynağının (GTP) kullanılması gerekir.
2
mRNA-ribozom etkileşimini (Shine-Dalgarno) değerlendir.
Shine-Dalgarno dizisi, 30S alt birimindeki 16S rRNA ile baz eşleşmesi yapar.
Bu etkileşim, başlatıcı kodonun (AUG) P bölgesine doğru şekilde yerleşmesini sağlar.
3
Antibiyotik mekanizmalarını karşılaştır.
Linezolid, 50S alt birimine bağlanarak 30S kompleksinin 50S ile birleşip 70S oluşturmasını engeller.
Bu mekanizma, çoğu antibiyotiğin elongasyon (uzama) evresini etkilemesinden farklı olarak inisiyasyon evresine özgüdür.

Key Concept

Prokaryotik translasyon inisiyasyonu ve Linezolid etki mekanizması

Practice More

Ökaryotik translasyon inisiyasyonunda görev alan eIF-2'nin fosforilasyon ile düzenlenmesi ve eIF-2B'nin (GEF) rolünü inceleyiniz.
Estimated Time:1m 15s
Question 12Question →

Hücresel stres koşullarında (amino asit açlığı, viral enfeksiyon veya katlanmamış protein yanıtı gibi), spesifik kinazlar tarafından ökaryotik başlatma faktörü 22'nin alfa alt biriminin (eIF2αeIF2\alpha) Serin 5151 pozisyonundan fosforillenmesi, global protein sentezini hızla durdurur.

eIF2αeIF2\alpha fosforilasyonunun bu süreçteki temel moleküler mekanizması aşağıdakilerden hangisidir?

Show answer & explanation

Answer: Guanin nükleotid değişim faktörü (GEFGEF) olan eIF2BeIF2B molekülünü yüksek afinite ile bağlayarak sekestre etmesi

Answer

Fosforillenmiş eIF2αeIF2\alpha, guanin nükleotid değişim faktörü olan eIF2BeIF2B molekülünü yüksek afinite ile bağlayarak sekestre eder.
Protein sentezinin başlatılmasında eIF2−GTPeIF2-GTP formu kritik bir rol oynar. Her başlatma döngüsü sonunda GTPGTP hidroliz edilir ve eIF2−GDPeIF2-GDP oluşur. Bu GDPGDP'nin tekrar GTPGTP ile yer değiştirmesi için eIF2BeIF2B (GEFGEF) gereklidir. Hücresel stres anında aktive olan kinazlar eIF2αeIF2\alpha'yı fosforillediğinde, bu molekül eIF2BeIF2B'ye çok sıkı bağlanarak onu hapseder. Hücrede eIF2BeIF2B miktarı eIF2eIF2 miktarından çok daha az olduğu için, eIF2eIF2'nin küçük bir kısmının bile fosforillenmesi tüm eIF2BeIF2B havuzunu kurutarak protein sentezini global olarak durdurur.

Step-by-Step Solution

1
eIF2eIF2'nin normal döngüsünü analiz edin.
eIF2−GTPeIF2-GTP, başlatıcı tRNAtRNA'yı ribozoma taşır ve işlem sonunda eIF2−GDPeIF2-GDP formuna dönüşür.
Yeni bir başlatma döngüsü için GDPGDP'nin GTPGTP ile yer değiştirmesi gerekir.
2
eIF2BeIF2B faktörünün rolünü belirleyin.
eIF2BeIF2B, bir guanin nükleotid değişim faktörü (GEFGEF) olarak çalışır.
eIF2−GDPeIF2-GDP formundan GDPGDP'nin ayrılmasını ve GTPGTP bağlanmasını katalizler.
3
Fosforilasyonun etkisini değerlendirin.
eIF2αeIF2\alpha fosforillendiğinde, eIF2BeIF2B'ye olan afinitesi yaklaşık 100100 kat artar.
Bu durum eIF2BeIF2B'nin fosforillenmiş eIF2eIF2 tarafından 'tuzaklanmasına' (sequestrationsequestration) yol açar.
4
Sonucu belirleyin.
eIF2BeIF2B hücrede sınırlı miktardadır; sekestre edilmesi eIF2−GTPeIF2-GTP rejenerasyonunu durdurur.
eIF2−GTPeIF2-GTP kalmadığı için protein sentezi başlatılamaz.

Key Concept

Entegre Stres Yanıtı (IntegratedIntegrated StressStress ResponseResponse) ve eIF2BeIF2B sekestrasyonu

Practice More

İnhibitör etkili difteri toksini ve ekzotoksin A'nın hedef aldığı elongasyon faktörü eEF2eEF2 üzerindeki difthamiddifthamid modifikasyonunu inceleyiniz.
Estimated Time:2m 0s
Question 13Question →

Ökaryotik hücrelerde gerçekleşen protein sentezi (translasyon) mekanizması ve bu süreci etkileyen faktörlerle ilgili aşağıdaki ifadelerden hangisi doğrudur?

Show answer & explanation

Answer: Difteri toksini, ökaryotik elongasyon faktörü 2’yi (eEF−2eEF-2) ADPADP-ribozilleyerek translokasyon basamağını inhibe eder.

Answer

Ökaryotik elongasyon faktörü 2'nin (eEF−2eEF-2) difteri toksini tarafından ADPADP-ribozillenerek inhibe edilmesi doğru bir ifadedir.
Ökaryotik hücrelerde protein sentezinin uzama (elongasyon) evresinde görev alan eEF−2eEF-2 faktörü, ribozomun bir sonraki kodona kaymasını (translokasyon) sağlar. Difteri toksini ve *Pseudomonas* eksotoksini A, bu faktörü ADPADP-ribozilasyonu ile inaktive ederek protein sentezini durdurur.

Step-by-Step Solution

1
Aktivasyon enerjisinin değerlendirilmesi
Amino asit + ATPATP + tRNA→tRNA \rightarrow Aminoasil-tRNAtRNA + AMPAMP + PPiPP_i reaksiyonu gerçekleşir.
Bu basamakta ATPATP'nin iki yüksek enerjili bağı harcanır.
2
Terminasyon mekanizmasının analizi
Durdurucu kodonlar (Stop kodonları) protein kodlamaz ve tRNAtRNA tarafından tanınmaz.
Salınım faktörleri (Release Factors) süreci sonlandırır.
3
İnhibitör etkisinin incelenmesi
Difteri toksini, eEF−2eEF-2 faktörünü modifiye ederek ribozomun translokasyon (kayma) yeteneğini bozar.
Bu, ökaryotik protein sentezinin elongasyon evresini spesifik olarak durdurur.

Key Concept

Ökaryotik translasyonun elongasyon evresi, enerji gereksinimleri ve toksinler (Difteri toksini) aracılığıyla inhibisyonu.
Question 14Question →

Ökaryotik bir hücre sitozolünde, 50 amino asit uzunluğunda bir polipeptit zincirinin sentezlenmesi planlanmaktadır. Bu sürecin inisiyasyon (mRNA tarama/scanning basamağı hariç), elongasyon ve terminasyon evrelerinde tüketilen toplam yüksek enerjili fosfat bağı (P∼PP \sim P) sayısı ile translasyonu 60S ribozomal alt birimine bağlanarak inhibe eden ajanın eşleştirilmesi aşağıdakilerin hangisinde doğru verilmiştir?

Show answer & explanation

Answer: 201 - Sikloheksimid

Answer

Ökaryotik hücrede 50 amino asitlik polipeptit sentezi için 201 yüksek enerjili bağ harcanır ve bu süreci 60S birimine bağlanarak Sikloheksimid inhibe eder.
Sentezlenen her bir amino asit için aktivasyon basamağında 2 ATP eşdeğeri (P∼PP \sim P) harcanır (50×2=10050 \times 2 = 100). İnisiyasyon aşamasında eIF2 ve eIF5B tarafından 2 GTP tüketilir. Uzama evresinde ilk metiyonin hariç 49 amino asidin her biri için 2 GTP (toplam 98) ve terminasyonda eRF3 için 1 GTP kullanılır. Toplamda 201 P∼PP \sim P harcanır. Sikloheksimid, ökaryotik 60S alt birimine bağlanarak peptidil transferazı inhibe eden spesifik bir ajandır.

Step-by-Step Solution

1
Amino asit aktivasyonu (tRNA şarjı) enerjisini hesapla.
100 P∼PP \sim P bağı.
Her bir amino asit için 1 ATP, AMP'ye dönüşür. AMP oluşumu ve takiben PPiPP_i hidrolizi 2 yüksek enerjili bağa eşdeğerdir (50×2=10050 \times 2 = 100).
2
İnisiyasyon (başlangıç) evresindeki enerji tüketimini belirle.
2 GTP.
Ökaryotlarda Met-tRNA'nın getirilmesi (eIF2-GTP) için 1 GTP ve büyük alt birimin birleşmesi (eIF5B-GTP) için 1 GTP harcanır.
3
Uzama (elongation) evresindeki enerji tüketimini hesapla.
98 GTP.
İlk amino asit P-sitesinde olduğu için kalan 49 amino asidin her biri için; A-sitesine giriş (eEF1A-GTP) ve translokasyon (eEF2-GTP) olmak üzere 2 GTP harcanır (49×2=9849 \times 2 = 98).
4
Terminasyon (sonlanma) evresi enerjisini ekle.
1 GTP.
Salınım faktörlerinin (eRF3) aktivitesi için 1 GTP hidroliz edilir.
5
Toplam enerjiyi bul ve inhibitörü belirle.
Toplam 201; İnhibitör: Sikloheksimid.
100+2+98+1=201100 + 2 + 98 + 1 = 201. Sikloheksimid ökaryotik 60S (peptidil transferaz) inhibitörüdür.

Key Concept

Ökaryotik translasyonda enerji bilançosu (4n+14n+1) ve spesifik inhibitör mekanizmaları.

Practice More

Prokaryotik translasyonda EF-G ve ökaryotik translasyonda eEF2'nin benzer işlevlerini (translokasyon) ve bunların Difteri toksini gibi ajanlarla etkileşimini tekrar ediniz.
Estimated Time:2m 30s
Question 15Question →

Protein sentezi sürecinde, genetik bilginin sadakatle (fidelityfidelity) aktarılabilmesi için her bir amino asidin kendisine uygun olan doğru tRNAtRNA molekülüne bağlanması zorunludur. Aminoasil-tRNAtRNA sentetaz enzimlerinin, belirli bir amino asidi doğru tRNAtRNA'ya bağlarken tanıdığı ve "ikinci genetik kod" olarak tanımlanan temel belirleyici bölgeler aşağıdakilerin hangisinde bulunur?

Show answer & explanation

Answer: tRNAtRNA molekülünün akseptör kolu ve antikodon ilmiği

Answer

Aminoasil-tRNA sentetazlar tarafından tanınan bölgeler olan tRNA'nın akseptör kolu ve antikodon ilmiğidir.
Aminoasil-tRNA sentetaz enzimleri, her bir amino asidi kendisine karşılık gelen doğru tRNA'ya bağlamakla görevlidir. Bu enzimin tRNA'yı tanımasını sağlayan temel bölgeler, tRNA'nın 3' ucundaki akseptör kolu ve antikodon döngüsüdür. Bu spesifik tanıma kurallarına, genetik kodun (mRNA-tRNA eşleşmesi) ötesinde bir sadakat sağladığı için "ikinci genetik kod" adı verilir.

Step-by-Step Solution

1
Aminoasil-tRNA sentetaz (ARS) enzimlerinin fonksiyonunu analiz et.
ARS enzimleri, spesifik bir amino asidi ATP kullanarak ilgili tRNA'nın 3' ucuna (ester bağı ile) bağlar.
Translasyonun doğruluğu, doğru amino asidin doğru tRNA'ya takılmasına bağlıdır.
2
"İkinci genetik kod" kavramını tanımla.
Bu kavram, ARS enziminin bir tRNA'yı diğerlerinden ayırt etmesini sağlayan nükleotid dizilerini ifade eder.
Hücrede 20 çeşit amino asit için en az 20 çeşit ARS bulunur ve her biri kendi tRNA'larını tanımalıdır.
3
tRNA üzerindeki yapısal tanınma bölgelerini belirle.
ARS enzimleri tRNA'nın hem 3' akseptör kolunu hem de antikodon ilmiğini fiziksel olarak kavrar ve buradaki spesifik bazları kontrol eder.
Bu iki bölge, tRNA'nın kimliğini belirleyen en kritik yapısal elementlerdir.

Key Concept

İkinci Genetik Kod (Aminoasil-tRNA Sentetaz Özgüllüğü)

Hints

1
Amino asitlerin tRNA'ya bağlanması, ribozomun dışındaki bir aktivasyon basamağıdır.
2
Bu enzimler, tRNA'nın mRNA ile eşleşecek kısmını ve amino asidin asıl takılacağı kolu kontrol eder.
3
Akseptör kol amino asidin bağlandığı yerdir, antikodon ise tRNA'nın kimliğini belirleyen en önemli kısımdır.

Practice More

Aminoasil-tRNA sentetazların 'proofreading' (düzeltme) aktivitesini ve bu aktivitenin translasyon hata oranını nasıl düşürdüğünü inceleyebilirsiniz.
Estimated Time:1m 30s
Question 16Question →

Protein sentezi inhibitörleri üzerine yapılan bir biyokimyasal çalışmada; incelenen bir ajanın hem prokaryotik 70S70S hem de ökaryotik 80S80S ribozomlarında etkili olduğu, yapısal olarak aminoaçil-tRNA'nın 3′3' ucuna benzerlik gösterdiği ve ribozomun A bölgesine yerleşerek polipeptit zincirinin vaktinden önce (prematür) sonlanmasına neden olduğu saptanmıştır. Bu özelliklere sahip olan protein sentezi inhibitörü aşağıdakilerden hangisidir?

Show answer & explanation

Answer: Puromisin

Answer

Puromisin; aminoaçil-tRNA yapısını taklit ederek hem prokaryot hem de ökaryotlarda peptidil transferaz reaksiyonuna katılan ve polipeptit zincirinin erken salınmasına yol açan inhibitördür.
Puromisin, yapısı itibariyle bir aminoaçil-tRNA'nın (özellikle tirozin taşıyan tRNA) 3′3' ucuna çok benzer. Ribozomun A bölgesine girer ve peptidil transferaz enzimi aracılığıyla P bölgesindeki büyüyen polipeptit zincirini üzerine alır. Ancak puromisin ribozoma sıkıca tutunamaz ve 'peptidil-puromisin' şeklinde kompleksten ayrılarak sentezin vaktinden önce durmasına (prematür terminasyon) neden olur. Hem prokaryotik hem de ökaryotik ribozomlarda bu mekanizmayla etki gösterir.

Step-by-Step Solution

1
İnhibitörün hedef spektrumunu belirle.
Hem 70S70S (prokaryot) hem de 80S80S (ökaryot) ribozomlarını etkiliyor.
Çoğu antibiyotik seçicidir, ancak puromisin her iki sistemde de etkilidir.
2
Yapısal benzerliği analiz et.
Aminoaçil-tRNA'nın 3′3' ucuna (tirozil-tRNA benzeri) benzerlik.
Bu benzerlik ajanın ribozomun A bölgesine girmesini sağlar.
3
Etki mekanizmasını tanımla.
P bölgesindeki büyüyen zincir A bölgesindeki inhibitöre aktarılır ve peptidil-puromisin kompleksi oluşarak ribozomdan ayrılır.
Bu durum protein sentezinin prematür terminasyonuna (erken sonlanma) yol açar.

Key Concept

Puromisin, aminoaçil-tRNA (spesifik olarak tirozil-tRNA) analoğu olarak davranan ve türler arası ayrım yapmadan protein sentezini sonlandıran tek önemli inhibitördür.
Estimated Time:1m 15s
Question 17Question →

Ökaryotik hücrelerde protein sentezinin başlama (inisiyasyon) evresi, prokaryotlardan farklı olarak oldukça karmaşık bir regülasyon ve enerji kullanımı döngüsüne sahiptir. Olgun bir mRNAmRNA'nın 5′5' ucuna bağlanan pre-inisiyasyon kompleksinin, uygun başlama kodonunu (AUGAUG) bulana kadar 5′→3′5' \rightarrow 3' yönünde ilerlediği 'tarama (scanning)' süreciyle ilgili aşağıdaki ifadelerden hangisi doğrudur?

Show answer & explanation

Answer: Tarama süreci sırasında mRNAmRNA üzerindeki ikincil yapıların (hairpin) açılması için gerekli olan helikaz aktivitesi eIF4A tarafından yürütülür ve bu basamakta enerji kaynağı olarak ATPATP hidroliz edilir.

Answer

Tarama süreci sırasında ikincil yapıların açılması için eIF4A tarafından ATPATP hidroliz edilmesi doğrudur.
Ökaryotik translasyon inisiyasyonunda, 43S43S pre-inisiyasyon kompleksi mRNA'ya yüklendikten sonra başlama kodonunu bulmak için mRNA boyunca ilerler. Bu süreçte mRNA'nın sahip olduğu ikincil yapılar (hairpins), eIF4F kompleksinin bir parçası olan eIF4A tarafından çözülür. eIF4A bir RNA helikazdır ve bu yapıları bozmak için ATPATP hidrolizinden gelen enerjiyi kullanır.

Step-by-Step Solution

1
eIF4F kompleksinin bileşenlerini analiz et
eIF4F kompleksi eIF4E (cap-binding), eIF4A (RNA helikaz) ve eIF4G (iskelet protein) birimlerinden oluşur.
Ökaryotik mRNA'nın taranması için cap yapısının tanınması ve ikincil yapıların çözülmesi gerekir.
2
Tarama (scanning) mekanizmasındaki enerji kaynağını belirle
eIF4A, mRNA üzerindeki stem-loop gibi yapıları açmak için ATPATP hidroliz eder.
Translasyonun çoğu basamağı GTPGTP kullansa da, tarama evresi karakteristik olarak ATPATP bağımlıdır.
3
Diğer inisiyasyon basamaklarındaki enerji kullanımını kontrol et
eIF2 (tRNA taşıma) ve eIF5B (alt birim birleşmesi) faktörleri GTPGTP kullanır.
GTPaz aktivitesi translasyon faktörleri için standart bir enerji dönüşüm mekanizmasıdır.

Key Concept

Ökaryotik Translasyon İnisiyasyonunda eIF4F ve ATP Bağımlı Tarama (Scanning)

Practice More

eIF2-alfa fosforilasyonunun (açlık, stres durumlarında) protein sentezini nasıl global olarak inhibe ettiğini inceleyiniz.
Estimated Time:2m 0s
Question 18Question →

Ökaryotik hücrelerde protein sentezinin başlatılması (inisiasyon) hızı, başlatma faktörlerinin çeşitli mekanizmalarla regülasyonu sayesinde kontrol edilir. Hücrede amino asit eksikliği veya viral enfeksiyon gibi stres durumlarında, aşağıdaki faktörlerden hangisinin α\alpha-alt biriminin spesifik bir kinaz tarafından fosforillenmesi, protein sentezinin küresel olarak baskılanmasına yol açar?

Show answer & explanation

Answer: eIF2eIF2

Answer

eIF2eIF2 (ökaryotik başlatma faktörü 2)
Doğru cevap olan faktör, ökaryotik hücrelerde başlatıcı Met−tRNAimetMet-tRNA_i^{met}'yi GTPGTP ile birleşerek 40S40S ribozomal alt birimine taşıyan üçlü (ternary) kompleksi oluşturur. Hücresel stres (açlık, viral enfeksiyon, ısı şoku) durumunda, spesifik kinazlar bu faktörün α\alpha-alt birimini fosforiller. Bu modifikasyon, faktörün tekrar aktif hale gelmesi için gereken GDP−GTPGDP-GTP değişimini gerçekleştiren eIF2BeIF2B (guanin nükleotid değişim faktörü) proteinini etkisiz hale getirir ve böylece hücrede protein sentezi genel olarak durur.

Step-by-Step Solution

1
Protein sentezinin hangi evresinin regüle edildiğini belirle.
Soru, başlatma (inisiasyon) evresindeki global regülasyondan bahsetmektedir.
Protein sentezi kontrolünün en önemli basamağı başlatma evresidir.
2
α\alpha-alt birimi fosforillenen spesifik faktörü hatırla.
eIF2eIF2 faktörü, α\alpha, β\beta ve γ\gamma olmak üzere üç alt birimden oluşur.
Stres durumunda (örn. HEIHEI, PKRPKR kinazları) eIF2αeIF2\alpha fosforillenir.
3
Fosforilasyonun biyokimyasal sonucunu analiz et.
Fosforillenmiş eIF2eIF2, nükleotid değişim faktörü olan eIF2BeIF2B’ye çok sıkı bağlanarak onu tutuklar.
GDPGDP’nin GTPGTP ile yer değiştirememesi, başlatıcı Met−tRNAimetMet-tRNA_i^{met}'nin ribozoma taşınmasını durdurur.

Key Concept

Ökaryotik Translasyon Regülasyonu ve eIF2eIF2 Fosforilasyonu

Practice More

İnsülin sinyalizasyonunun eIF4EeIF4E ve 4E−BP4E-BP üzerindeki etkilerini inceleyerek anabolik regülasyon farkını öğrenebilirsiniz.
Estimated Time:1m 0s
Question 19Question →

Ökaryotik hücrelerde protein sentezinin başlama (inisiyasyon) evresinde, 43S pre-inisiyasyon kompleksinin mRNA üzerindeki 5' başlık (cap) yapısına bağlandıktan sonra uygun başlatıcı AUG kodonunu bulana kadar mRNA boyunca ilerlemesini sağlayan "tarama" (scanning) mekanizması için gerekli olan enerji aşağıdakilerin hangisinden karşılanır?

Show answer & explanation

Answer: ATP hidrolizi

Answer

Ökaryotik translasyonda tarama (scanning) işlemi için gerekli enerji ATP hidrolizinden sağlanır.
Doğru cevap olan seçenek, ökaryotik translasyonun ayırt edici özelliklerinden birini ifade eder. Prokaryotlarda ribozom doğrudan Shine-Dalgarno dizisine bağlanırken, ökaryotlarda 5' uçtan başlayarak AUG kodonuna kadar ilerleme (scanning) gerçekleşir. Bu tarama işlemi sırasında mRNA'daki sekonder yapıların açılması için eIF4A helikazı görev yapar ve bu enzim enerjisini ATP hidrolizinden alır.

Step-by-Step Solution

1
İnisiyasyon kompleksinin mRNA'ya bağlanmasını değerlendir.
43S pre-inisiyasyon kompleksi eIF4F yardımıyla 5' cap yapısına bağlanır.
Sentezin başlayabilmesi için ribozomun mRNA'ya tutunması gerekir.
2
mRNA üzerindeki AUG kodonunun aranması sürecini incele.
Ribozom AUG'ye ulaşmak için mRNA üzerindeki sekonder yapıları (hairpin vb.) çözerek ilerler.
mRNA düz bir şerit değildir; sekonder yapıların açılması helikaz aktivitesi gerektirir.
3
Helikaz aktivitesi için gereken enerji kaynağını belirle.
eIF4A (bir RNA helikazıdır) bu süreçte ATP hidrolizini kullanır.
Ökaryotik translasyonu prokaryotik olandan ayıran temel farklardan biri, tarama işlemi için ATP gereksinimidir.

Key Concept

Ökaryotik translasyon inisiyasyonunda eIF4A helikaz aktivitesi ATP bağımlıdır.
Question 20Question →

Hücrede gerçekleşen protein sentezi (translasyon) sürecinin uzama (elongasyon) aşamasında; peptidil-tRNAtRNA’nın A bölgesinden P bölgesine taşınmasını ve ribozomun mRNAmRNA üzerinde bir kodon ilerlemesini sağlayan 'translokasyon' basamağında doğrudan kullanılan enerji kaynağı aşağıdakilerden hangisidir?

Show answer & explanation

Answer: GTPGTP

Answer

Translasyonun uzama aşamasındaki translokasyon basamağında enerji kaynağı olarak GTPGTP kullanılır.
Protein sentezinin elongasyon (uzama) döngüsünde, ribozomun bir sonraki kodona doğru hareket etmesi (translokasyon) için uzama faktörleri (prokaryotlarda EF−GEF-G, ökaryotlarda eEF−2eEF-2) görev yapar. Bu faktörler birer GTPGTP azdır ve GTPGTP molekülünü hidroliz ederek elde ettikleri enerjiyi ribozomun yapısal değişimini ve hareketini sağlamak için kullanırlar.

Step-by-Step Solution

1
Protein sentezindeki enerji gerektiren basamakları sınıflandır.
Aminoasit aktivasyonu için ATPATP, başlangıç ve uzama (aminoaçil-tRNAtRNA bağlanması ve translokasyon) basamakları için GTPGTP kullanılır.
Farklı enzimler ve faktörler farklı yüksek enerjili fosfat bağlarını tercih eder.
2
Translokasyon basamağına özgü faktörü ve enerji kaynağını belirle.
Ökaryotlarda eEF−2eEF-2 (prokaryotlarda EF−GEF-G) faktörü GTPGTP hidroliz ederek ribozomu kaydırır.
Translokasyon, mekanik bir hareket gerektirir ve bu hareket uzama faktörlerinin GTPGTP az aktivitesi ile tetiklenir.

Key Concept

Translasyon Sürecinde Enerji Kullanımı
Estimated Time:45s
Page 1 / 2Next
Protein Sentezi (Translasyon) Practice Questions — TUS - Tıpta Uzmanlık Sınavı | Examkin