Genel Viroloji

Virüslerin yapısal bileşenleri, biyokimyasal özellikleri ve replikasyon stratejileri dikkate alındığında; zarflı virüslerle ilgili aşağıdaki ifadelerden hangisi doğrudur?

Viral replikasyon dinamikleri üzerine yapılan bir çalışmada, bir hücre kültüründe yüksek enfeksiyon çokluğu ($MOI$) ile inokülasyon yapıldığında, birkaç pasaj sonra üretilen enfektif virüs partikülü sayısının (plak oluşturan birimler) dramatik şekilde düştüğü, ancak toplam fiziksel partikül sayısının yüksek seyrettiği gözlenmiştir. Yapılan genomik analizlerde, yeni oluşan partiküllerin büyük bir kısmının viral genomda geniş delesyonlara sahip olduğu ve bu 'defektif interferan' ($DI$) partiküllerinin ancak sağlam bir yardımcı virüs varlığında çoğalabildiği belirlenmiştir.

Bu durum ve 'Von Magnus fenomeni' ile ilgili aşağıdaki ifadelerden hangisi doğrudur?

Viral yapısal bileşenler ve replikasyon stratejileri arasındaki genel kurallar dikkate alındığında; helikal (sarmal) kapsid simetrisine sahip olan negatif polariteli tek iplikçikli RNA ($ssRNA(-)$) virüsleri için aşağıdakilerden hangisi her zaman doğrudur?

Viral replikasyon stratejileri ve Baltimore sınıflandırma prensipleri dikkate alındığında; DNA genomuna sahip olan, ancak replikasyon döngüsü sırasında bir 'pre-genomik RNA' ara basamağı üzerinden revers transkripsiyon (RNA bağımlı DNA polimeraz) yapan ve bu süreçte DNA sentezini başlatmak için bir konak hücresi molekülü yerine kendi viral proteinini (protein primer) kullanan virüs aşağıdakilerden hangisidir?

Virüslerin sınıflandırılmasında kullanılan Baltimore sistemine göre bazı virüsler, genomlarını replike etmek için alışılagelmişin dışında enzimler ve ara basamaklar kullanırlar. Bu kapsamda; kısmi çift iplikli dairesel DNA ($dsDNA$) genomuna sahip olan ve replikasyon döngüsü sırasında revers transkriptaz aktivitesi gösteren bir virüsün çoğalma stratejisi ile ilgili aşağıdakilerden hangisi doğrudur?

Viroloji laboratuvarında gerçekleştirilen 'tek basamaklı çoğalma eğrisi' (one-step growth curve) deneyleri ve virüslerin genel replikasyon stratejileri dikkate alındığında, aşağıdaki ifadelerden hangisi doğrudur?

Viral replikasyon döngüsünde genomun polaritesi ve yapısı, protein sentezinin nasıl başlayacağını belirleyen temel faktördür. Negatif polariteli tek iplikli RNA ((-)ssRNA) genomuna sahip virüsler, genomlarını doğrudan mRNA olarak kullanamadıkları için enfeksiyonun başlangıcında konak hücre proteinlerini sentezlemek üzere bir ara basamağa ihtiyaç duyarlar.

Buna göre, enfeksiyonu başlatmak için virion içerisinde mutlaka 'RNA bağımlı RNA polimeraz' (RdRp) enzimi taşıması gereken virüs ailesi aşağıdakilerden hangisidir?

Viral replikasyon stratejileri ve genom organizasyonları dikkate alındığında; negatif polariteli tek iplikli RNA ($-ssRNA$) genomuna sahip virüslerin, enfeksiyonun başlangıcında konak hücreye virion içerisinde hazır bir RNA bağımlı RNA polimeraz ($RdRp$) enzimi getirmek zorunda olmalarının temel nedeni aşağıdakilerden hangisidir?

Virüslerin yapısal özellikleri ve replikasyon stratejileri Baltimore sınıflamasına göre değerlendirildiğinde; genomu mRNA ile aynı polaritede (pozitif polariteli tek iplikli RNA) olmasına rağmen, konak hücreye giriş yaptıktan sonra genomu doğrudan ribozomlara bağlanarak translasyonu başlatamayan ve replikasyon döngüsü için virion içerisinde RNA-bağımlı DNA polimeraz enzimi taşımak zorunda olan virüs ailesi aşağıdakilerden hangisidir?

Viral replikasyon döngüsünde, viral genomun kapsidden ayrılmasıyla ($uncoating$) başlayan ve konak hücre içerisinde ilk yeni infeksiyöz virüs partiküllerinin sentezlenip saptanabilir hale gelmesine kadar geçen evre aşağıdakilerden hangisidir?

Yeni izole edilen bir hayvan virüsünün replikasyon stratejisini ve yapısal özelliklerini belirlemek amacıyla yürütülen çalışmalarda şu bulgular saptanmıştır:

I. Virüsten saflaştırılan genomik nükleik asidin duyarlı konak hücrelere tek başına aktarılması (transfeksiyon) sonucunda yeni virionların üretilmediği görülmüştür.
II. Replikasyon döngüsünün en erken evresinde, viral bir enzim tarafından gerçekleştirilen ve hücresel transkripsiyon inhibitörlerinden etkilenmeyen bir RNA sentezinin gerçekleştiği izlenmiştir.
III. Virüs partiküllerinin eter ve kloroform gibi lipid çözücü maddelerle muamele edildikten sonra infektivitelerini tamamen kaybettiği belirlenmiştir.

Bu verilere dayanarak, söz konusu virüsün yapısal organizasyonu ile ilgili aşağıdaki ifadelerden hangisi doğrudur?

Viroloji laboratuvarında incelenen bir virüsün; lipid çözücülere (eter, kloroform vb.) karşı dirençli olduğu, ikozahedral kapsid simetrisi sergilediği ve tek iplikli DNA ($ssDNA$) genomuna sahip olduğu saptanmıştır. Ayrıca bu virüsün replikasyonunu gerçekleştirebilmek için konak hücrenin $S$ fazına girmesine ihtiyaç duyduğu belirlenmiştir.

Bu özelliklere sahip virüs ailesi aşağıdakilerden hangisidir?

Virüslerin morfogenez (olgunlaşma) ve tomurcuklanma süreçleri, viral genomun replike olduğu bölgeye ve yapısal proteinlerin birikim yerine göre farklı hücre içi membran sistemlerinde gerçekleşebilir. Hayvan virüslerinin büyük bir kısmı plazma membranından tomurcuklanırken, sınırlı sayıda virüs ailesi zarfını hücre çekirdeğinin iç zarından kazanır. Buna göre, elektron mikroskobunda çekirdek iç zarından (iç nükleer membran) tomurcuklanarak zarf kazandığı gözlenen virüs aşağıdakilerden hangisidir?

Virüslerin genel yapısal özellikleri, kapsid simetri prensipleri ve replikasyon stratejileri dikkate alındığında, aşağıdaki ifadelerden hangisi yanlıştır?

Viral genomların transkripsiyon ve replikasyon stratejileri, nükleik asit tipine ve kapsid organizasyonuna göre farklılık gösterir. Çift iplikli RNA ($dsRNA$) genomuna sahip olan virüsler, konak hücrenin bu yapıyı doğrudan haberci RNA ($mRNA$) olarak kullanamaması ve sitoplazmada dsRNA'yı tanıyan immün sensörlerin bulunması nedeniyle özgün bir mekanizma geliştirmişlerdir.

Buna göre; segmentli dsRNA genomuna sahip, zarfsız ve çift katmanlı ikozahedral kapsid yapısındaki bir virüsün replikasyon döngüsüyle ilgili aşağıdakilerden hangisi doğrudur?

Virüslerin genel yapısal özellikleri incelendiğinde, bazı virüs gruplarının nükleokapsidini çevreleyen ve "zarf" (envelope) olarak adlandırılan ek bir tabaka bulundurduğu görülür. Zarflı virüslerin bu yapıyı kazanma süreçleri ve yapının içeriği dikkate alındığında, viral zarf ile ilgili aşağıdaki ifadelerden hangisi doğrudur?

Segmentli, çift iplikli RNA ($dsRNA$) genomuna sahip, ikozahedral simetrili ve zarfsız bir virüsün replikasyon stratejisi incelendiğinde; viral mRNA sentezi ve genom replikasyonu süreçleri ile ilgili aşağıdaki ifadelerden hangisi doğrudur?

Hayvanları enfekte eden ve helikal kapsid simetrisine sahip olan virüslerin tamamı zarflı bir yapıya sahiptir. Bu virüslerden genomu negatif polariteli tek iplikli RNA ($-$ ssRNA) olanların enfeksiyon süreci incelendiğinde, replikasyonun başlaması için bazı spesifik biyokimyasal gereksinimler olduğu görülür. Bu gruptaki virüslerin replikasyon döngüsü ve yapısal organizasyonu ele alındığında, aşağıdakilerden hangisi doğrudur?

Virüslerin biyolojik özelliklerine göre, bazı RNA virüsleri genomlarını doğrudan mesajcı RNA (mRNA) olarak kullanarak protein sentezini başlatabilirken, bazıları konak hücrenin bu işi yapacak enzimi bulunmadığı için mRNA sentezleyebilmek amacıyla virionlarında hazır enzim taşımak zorundadır.

Buna göre, aşağıdaki virüslerden hangisinin konak hücre içinde enfeksiyonu başlatabilmek için 'RNA bağımlı RNA polimeraz' (RdRp) enzimini beraberinde virion içinde taşıması gerekmez?