Retrovirüsler

HIV ($Human \ Immunodeficiency \ Virus$) infeksiyonunda, virüsün kapsid ($core$) yapısını oluşturan ve erken tanıda kanda antijenemi testi ile saptanabilen majör protein aşağıdakilerden hangisidir?

İnsan immün yetmezlik virüsü ($HIV-1$) replikasyon döngüsünde; viral genomun revers transkripsiyonu tamamlandıktan sonra oluşan ön-entegrasyon kompleksinin ($PIC$) nükleer porlardan aktif taşınmasında görev alan ve aynı zamanda enfekte hücreyi hücre döngüsünün $G_2$ fazında durdurarak viral transkripsiyon için optimal koşulları sağlayan aksesuar protein hangisidir?

Retrovirüs replikasyon döngüsünde, virion içerisindeki $RNA$ genomu kalıp olarak kullanılarak çift iplikli proviral $DNA$ sentezlenir. Bu süreçte görev alan revers transkriptaz enziminin, sentezlenen ilk $DNA$ ipliğine bağlı kalan kalıp $RNA$ molekülünü parçalayarak uzaklaştıran spesifik aktivitesi aşağıdakilerden hangisidir?

$HIV-1$ replikasyon döngüsünde, proviral $DNA$'dan viral $RNA$ sentezi sırasında $RNA$ polimeraz II'nin promotör bölgesinde duraksamasını ($pausing$) engelleyerek transkripsiyonel elongasyonun (uzama) verimliliğini yaklaşık 1000 kat artıran temel mekanizma aşağıdakilerden hangisidir?

İnsan immün yetmezlik virüsü ($HIV-1$) tarafından sentezlenen ve enfekte hücrelerin yüzeyindeki $MHC\ Sınıf\ I$ moleküllerinin internalizasyonunu tetikleyerek sitotoksik $T$ lenfositlerin ($CTL$) immün denetiminden kaçışı sağlayan aksesuar protein aşağıdakilerden hangisidir?

$HTLV-1$ ($Human \ T-cell \ Lymphotropic \ Virus \ type \ 1$) enfeksiyonu sonucunda gelişen Erişkin T-hücreli Lösemi ($ATL$) patogenezinde, viral Tax proteini merkezi bir rol oynar. Tax proteininin T-lenfositlerde onkojenik transformasyona yol açan ve bu hücrelerin kontrolsüz proliferasyonunu sağlayan temel moleküler mekanizması aşağıdakilerden hangisidir?

$HTLV-1$ (Human T-cell Lymphotropic Virus Type 1), onkojenik bir retrovirüs olup erişkin T-hücreli lösemi/lenfoma (ATL) tablosundan sorumludur. Bu virüsün replikasyonunda ve patogenezinde kritik rol oynayan, konak hücredeki $IL-2$ ve $IL-2R$ gibi hücresel genlerin ekspresyonunu transaktivasyon mekanizmasıyla artırarak kontrolsüz T-hücre proliferasyonunu tetikleyen viral protein aşağıdakilerden hangisidir?

Retrovirüsler ailesinde yer alan İnsan immün yetmezlik virüsü tip 2 ($HIV-2$), biyolojik özellikler açısından tip 1 ($HIV-1$) ile benzerlik gösterse de aksesuar gen içeriği bakımından önemli farklılıklara sahiptir. Özellikle miyeloid seriden hücrelerde (makrofajlar, dendritik hücreler) revers transkripsiyonun etkin bir şekilde gerçekleşebilmesi için hücresel bir kısıtlayıcı faktör olan $SAMHD1$’in (steril alfa motif ve $HD$ domain içeren protein 1) ortadan kaldırılması gerekmektedir.

Buna göre, $HIV-2$ genomu tarafından kodlanan ve $SAMHD1$ proteinini proteazomal yıkıma yönlendirerek virüsün miyeloid hücrelerde replikasyonuna olanak sağlayan aksesuar protein aşağıdakilerden hangisidir?

Retrovirüs ailesinden $HIV-1$, hedef hücreye giriş yapmak için $CD4$ reseptörünün yanı sıra kemokin reseptörlerini koreseptör olarak kullanır. Bazı bireylerde bu kemokin reseptörlerinden birini kodlayan genin her iki alelinde meydana gelen 32 baz çiftlik bir delesyon ($\Delta 32$), $HIV-1$ infeksiyonuna karşı belirgin bir direnç sağlar. Bu mutasyonun etkilediği ve virüsün hücreye girişinde görev alan koreseptör aşağıdakilerden hangisidir?

$HIV-1$ replikasyon döngüsünde, hem yeni sentezlenen viral partiküllerin konak hücre yüzeyinden salınmasını (budding) engelleyen kısıtlayıcı bir faktör olan **Tetherin ($BST-2$) proteinini antagonize eden, hem de konak hücrenin ana reseptörü olan $CD4$** moleküllerini endoplazmik retikulumda ($ER$) yakalayarak proteazomal yıkıma (ERAD yoluyla) uğratan viral yardımcı (accessory) protein aşağıdakilerden hangisidir?

$HIV-1$ replikasyon döngüsünde, konak hücrede bulunan ve sitidin deaminaz aktivitesi gösteren $APOBEC3G$ ($Apolipoprotein \ B \ mRNA-editing \ enzyme, \ catalytic \ polypeptide-like \ 3G$) enzimi, yeni sentezlenen virionların içine paketlenerek bir sonraki enfeksiyon döngüsünde viral $DNA$ sentezi sırasında sitidinden urasile ($dC \rightarrow dU$) dönüşüme ve dolayısıyla öldürücü hipermutasyonlara neden olur. $HIV-1$, bu doğal antiviral savunma mekanizmasını etkisiz hale getirmek için hangi aksesuar proteinini kullanarak $APOBEC3G$'yi ubikitin-proteazom sistemi üzerinden yıkıma uğratır?

İnsan immün yetmezlik virüsü ($HIV-1$) enfeksiyonunun patogenezinde, virüsün konak hücreye girişi için $CD4$ reseptörüne ek olarak bir koreseptöre bağlanması zorunludur. Enfeksiyonun geç evrelerinde ortaya çıkan, $T$-lenfosit tropizmi gösteren ve sinsityum oluşturan ($SI$) suşlar, erken evredeki makrofaj-tropik suşlardan farklı bir koreseptör kullanır. Buna göre, $HIV-1$ enfeksiyonunun progresyonu ile ilişkili olan ve $T$-hücre tropizmi gösteren bu suşların kullandığı koreseptör aşağıdakilerden hangisidir?

$HIV-1$ replikasyon döngüsünde, viral genoma ait tam boy ($9\ kb$) ve tek kırpılmış ($4\ kb$) $mRNA$’ların nükleustan sitoplazmaya taşınması için $RRE$ ($Rev\ Response\ Element$) dizisine bağlanarak görev yapan regülatör protein aşağıdakilerden hangisidir?

$HIV-1$ replikasyonunda görev alan yardımcı (accessory) proteinlerden biri olan Nef'in, konak hücrenin bağışıklık yanıtından kaçışındaki temel mekanizması aşağıdakilerden hangisidir?

Retroviridae ailesi içerisinde yer alan Human T-cell Lymphotropic Virus Type 1 (HTLV-1), erişkin T-hücreli lösemi/lenfoma (ATL) ve HTLV-1 ile ilişkili miyelopati (HAM/TSP) etkenidir. HIV-1'den farklı olarak doğrudan onkojenik potansiyele sahip olan bu virüsün replikasyonunda görev alan; hem viral LTR bölgesini transkripsiyonel olarak aktive eden hem de konak hücrede $IL-2$, $IL-2R$ ve $NF-\kappa B$ genlerinin ekspresyonunu artırarak kontrolsüz T-hücre proliferasyonuna yol açan düzenleyici protein aşağıdakilerden hangisidir?

Retrovirüs replikasyonunda, revers transkripsiyon sonucu sitoplazmada sentezlenen çift iplikli proviral $DNA$’nın konak hücre çekirdeğine taşınmasını ve konak hücre genomuna kalıcı olarak eklenmesini sağlayan viral enzim aşağıdakilerden hangisidir?

$HTLV-1$ enfeksiyonu sırasında sentezlenen; $IL-2$ ve $IL-2R\alpha$ ($CD25$) gen ekspresyonunu artırarak otokrin T-hücre proliferasyonunu uyaran, $NF-\kappa B$ sinyal yolunu aktive eden ve $p53$ ile $p16^{INK4a}$ gibi tümör baskılayıcı proteinlerin fonksiyonunu inhibe ederek malign transformasyona yol açan viral protein aşağıdakilerden hangisidir?

$HIV-1$ enfeksiyonunun erken döneminde (akut faz), virüsün makrofajları ve bellek T hücrelerini enfekte etmesini sağlayan (M-tropik) ve konak hücre yüzeyinde bulunan temel koreseptör aşağıdakilerden hangisidir?

HIV-1 enfeksiyonu sırasında, konak hücrede bulunan sitozin deaminaz ($APOBEC3G$) enziminin viral genomda hipermutasyonlara yol açmasını engelleyerek virüsün enfektif kalmasını sağlayan aksesuar gen aşağıdakilerden hangisidir?