Examkin

Soru

Zorluk: Çok zorGolgi Aygıtı ve Veziküler Trafik

Hücre içi veziküler trafik ve protein hedeflenmesi süreçleri moleküler düzeyde incelendiğinde; endoplazmik retikulum (ER) rezidüel proteinlerinin geri kazanımı, post-translasyonel modifikasyonların lokalizasyonu ve vezikül kılıf proteinlerinin fonksiyonları ile ilgili aşağıdaki ifadelerden hangisi doğrudur?

  1. KDEL reseptörü, Golgi aygıtı ve ERGIC'deki asidik ortamda ligandına yüksek afinite ile bağlanarak kaçan ER proteinlerini COP-I vezikülleriyle retrograd olarak geri taşırken, ER'nin nötr pH'sında ligandını serbest bırakır.Cevap
  2. B
    Lizozomal enzimlerin hedeflenmesinde kritik olan mannoz-6-fosfat (M6P) etiketinin eklenmesi süreci trans-Golgi ağında (TGN) başlar ve veziküller COP-II aracılığıyla erken endozomlara yönlendirilir.
  3. C
    Proteinlerin OO-bağlı glikozilasyonu granüllü endoplazmik retikulumda (GER) başlayıp Golgi'nin cis-cisternasında tamamlanırken, sülfasyon işlemleri sadece ara (medial) cisternada gerçekleşir.
  4. D
    COP-II vezikülleri, Golgi'nin trans yüzünden ER'ye doğru gerçekleşen retrograd taşımadan sorumluyken; COP-I vezikülleri plazma membranına gidecek olan salgı veziküllerinin tomurcuklanmasını sağlar.
  5. E
    Mannoz-6-fosfat reseptörleri (MPR), lizozomal enzimleri nötr pH'lı trans-Golgi ağında bağlar ve asidik pH'lı lizozom içerisinde enzimlerin aktivasyonunu sağlamak üzere kalıcı olarak depolanır.

Cevap

KDEL reseptörü, Golgi/ERGIC'deki asidik ortamda ligandını bağlayıp COP-I ile geri taşırken, ER'nin nötr ortamında serbest bırakır.
Doğru ifade, KDEL reseptör sisteminin moleküler mantığını tam olarak açıklar. ER'den kaçan çözünür proteinler, cis-Golgi ve ERGIC (ER-Golgi Intermediate Compartment) bölgelerindeki daha düşük (asidik) pH nedeniyle KDEL reseptörlerine sıkıca bağlanır. Bu reseptör-ligand kompleksi, COP-I kılıf proteinleri aracılığıyla tomurcuklanan veziküllere dahil edilerek ER'ye geri taşınır. ER lümenindeki nötr pH ortamında reseptörün konformasyonu değişir, afinitesi azalır ve protein serbest bırakılır.

Adım Adım Çözüm

1
ER proteinlerinin geri kazanım mekanizmasını analiz et.
ER'ye özgü proteinler (örn. BiP, PDI) yanlışlıkla Golgi'ye giderse, C-terminallerindeki KDEL sinyali tanınmalıdır.
Hücre içi homeostaz için organele özgü proteinlerin geri kazanılması şarttır.
2
KDEL reseptörünün pH bağımlılığını değerlendir.
Golgi (pH ~6.2-6.5) asidiktir ve reseptörün ligand afinitesini artırır. ER (pH ~7.2) nötrdür ve afiniteyi düşürür.
Farklı kompartmanlardaki proton konsantrasyonu, reseptör konformasyonunu değiştirerek yükleme ve boşaltma döngüsünü kontrol eder.
3
Veziküler taşıma yönünü ve kılıf proteinini belirle.
Golgi'den ER'ye doğru olan taşıma 'retrograd'dır ve COP-I (Coat Protein I) kompleksi tarafından yönetilir.
COP-II anterograd (ER -> Golgi), COP-I retrograd trafikten sorumludur.

Anahtar Kavram

Golgi-ER arası veziküler trafik ve KDEL reseptörünün pH-bağımlı çalışma prensibi.
Bu soruyu puanla

Konular

Golgi Aygıtı ve Veziküler Trafik

Bu konudan daha fazla soru