Soru

Zorluk: OrtaDeoksiribonükleotid Sentezi

Ribonükleotidlerin deoksiribonükleotidlere indirgenmesini sağlayan ribonükleotid redüktaz (RNRRNR) enzim sisteminin allosterik regülasyonu ve çalışma prensibi ile ilgili olarak aşağıdakilerden hangisi doğrudur?

  1. A
    Substrat olarak ribonükleozid trifosfat (rNTPrNTP) formlarını kullanarak doğrudan dNTPdNTP sentezler.
  2. B
    dATPdATP, enzimin genel aktivite bölgesine bağlanarak katalitik hızı ve VmaxV_{max} değerini artırır.
  3. ATPATP, enzimin genel aktivite bölgesine bağlanarak enzimi katalitik olarak aktif forma geçirir.Cevap
  4. D
    Reaksiyon sırasında oksitlenen tiyoredoksin, herhangi bir ara basamak olmadan doğrudan NADPHNADPH tarafından indirgenir.
  5. E
    Hidroksiüre kullanımı, enzimin aktif bölgesindeki radikali stabilize ederek deoksiribonükleotid üretimini hızlandırır.

Cevap

Ribonükleotid redüktaz enziminin genel aktivite bölgesine bağlanan ATP, enzimi aktive ederek ribonükleotidlerden deoksiribonükleotid sentezini başlatır.
Ribonükleotid redüktaz enzimi iki ana düzenleyici bölgeye sahiptir. Genel aktivite bölgesine ATPATP bağlanması enzimi aktif hale getirirken, dATPdATP bağlanması tüm katalitik aktiviteyi durdurur. Bu durum hücredeki toplam deoksiribonükleotid havuzunun dengelenmesini sağlar.

Adım Adım Çözüm

1
Substrat seviyesini kontrol et
Substratın ribonükleozid difosfatlar (ADP,GDP,CDP,UDPADP, GDP, CDP, UDP) olduğu belirlendi.
Enzim sadece difosfat formları üzerinde etkilidir.
2
Allosterik düzenleyiciyi belirle
Genel aktivite bölgesine ATPATP bağlanmasının aktivasyon, dATPdATP bağlanmasının inhibisyon yaptığı tespit edildi.
Hücredeki enerji durumu (ATPATP) sentezi uyarırken, aşırı ürün birikimi (dATPdATP) sistemi kapatır.
3
Redoks döngüsünü incele
Elektron akışının NADPHNADPH \rightarrow Tiyoredoksin Redüktaz \rightarrow Tiyoredoksin \rightarrow Ribonükleotid Redüktaz şeklinde olduğu doğrulandı.
Enzimin aktif bölgesindeki sülfhidril gruplarının (SHSH) sürekli yenilenmesi gerekir.

Anahtar Kavram

Ribonükleotid redüktaz (RNRRNR), ATPATP ile aktive olan ve dATPdATP ile inhibe edilen, substrat olarak NDPNDP kullanan ve elektron vericisi olarak tiyoredoksine ihtiyaç duyan kritik bir enzimdir.
Bu soruyu puanla