Soru

Zorluk: ZorGlikozaminoglikanlar ve Glikoproteinler

Glikoproteinlerin NN-glikozilasyon sürecinde, dolikol pirofosfat (DolPPDol-PP) üzerinde sentezlenen öncül "core" oligosakkarit (Glc3Man9GlcNAc2Glc_3Man_9GlcNAc_2) yapısının oluşumu ve ER lümenindeki proteine aktarımı ile ilgili aşağıdakilerden hangisi doğrudur?

  1. Dolikol üzerine ilk iki NN-asetilglukozamin ve ilk beş mannoz birimi sitozolik yüzde eklenirken, öncül yapı lümene döndükten sonra diğer mannoz ve glukozlar eklenir.Cevap
  2. B
    Öncül oligosakkarit yapısındaki tüm mannoz ve glukoz birimleri, doğrudan GDPGDP veya UDPUDP formundaki şeker-nükleotidler aracılığıyla ER lümeninde eklenir.
  3. C
    Dolikol pirofosfata bağlı oligosakkarit zincirinin sentezi tamamen sitozolde tamamlanır ve ardından ER lümenindeki proteine tek bir adımda aktarılır.
  4. D
    Tünikamisin, sentezi tamamlanmış oligosakkarit yapısının asparjin kalıntısına aktarılmasını sağlayan oligosakkaril transferaz enzimini inhibe eder.
  5. E
    Oligosakkarit zincirinin proteine aktarımı sonucunda, dolikol molekülü doğrudan dolikol monofosfat (DolPDol-P) olarak serbest bırakılır.

Cevap

Dolikol üzerine ilk iki NN-asetilglukozamin ve ilk beş mannoz birimi sitozolik yüzde eklenirken, yapı lümene döndükten sonra diğer şekerler eklenir.
Glikoproteinlerin NN-glikozilasyonunda, 'core' oligosakkarit sentezi dolikol fosfat üzerinde başlar. İlk iki GlcNAcGlcNAc ve ilk beş mannoz birimi sitozoldeki UDPGlcNAcUDP-GlcNAc ve GDPManGDP-Man kullanılarak sitozolik yüzde eklenir. Ardından bu yapı ER lümenine 'flip' (tersyüz) edilir. Lümen tarafında sentezin geri kalanı (4 ManMan ve 3 GlcGlc) dolikol-fosfata bağlı şekerler (DolPManDol-P-Man ve DolPGlcDol-P-Glc) kullanılarak tamamlanır.

Adım Adım Çözüm

1
Dolikol döngüsünün başlangıç konumunu belirle.
Süreç ER membranındaki dolikol fosfat üzerine sitozolik yüzde şeker eklenmesiyle başlar.
Şeker-nükleotidlerin (UDPGlcNAcUDP-GlcNAc, GDPManGDP-Man) çoğu sitozolde sentezlendiği için ilk basamaklar buradadır.
2
Oligosakkarit zincirinin lümene geçiş (flipping) noktasını tespit et.
2 GlcNAcGlcNAc ve 5 ManMan eklendikten sonra dolikol-oligosakkarit yapısı lümen tarafına döner.
Proteine aktarım ER lümeninde gerçekleşeceği için sentezin sonu ve transfer lümen tarafında olmalıdır.
3
Lümen tarafındaki şeker kaynaklarını tanımla.
Lümen içinde eklenen diğer 4 ManMan ve 3 GlcGlc, dolikol-P-şeker formundadır.
Lümen içine yüklü şeker-nükleotidler doğrudan giremez, dolikol taşıyıcıları kullanılır.

Anahtar Kavram

N-glikozilasyon sentezinin ER membranı üzerindeki asimetrik (iki fazlı) ilerleyişi ve dolikol döngüsü.

İpuçları

1
Dolikol pirofosfat sentezinin nerede başlayıp nerede bittiğini ve 'flipping' olayının önemini düşünün.
2
Lümen içinde şeker eklenirken doğrudan şeker-nükleotidlerin (UDP/GDPUDP/GDP) kullanılıp kullanılamayacağını hatırlayın.
3
Tünikamisin ve basiltrasin gibi inhibitörlerin dolikol döngüsünün tam olarak hangi basamaklarını etkilediğini analiz edin.

Daha Fazla Pratik

I-cell hastalığında mannoz-6-fosfat sinyalinin glikoproteinlerin hedeflenmesindeki rolünü inceleyin.
Tahmini Süre:2m 0s
Bu soruyu puanla