Soru

Zorluk: OrtaProtein Sentezi (Translasyon)

Prokaryotik ve ökaryotik hücrelerde gerçekleşen protein sentezi (translasyon) mekanizması, süreçte harcanan enerji kaynakları ve inhibitörlerin etki özellikleri dikkate alındığında, aşağıdakilerden hangisi yanlıştır?

  1. A
    Amino asitlerin aktivasyonu (aminoaçil-tRNAtRNA sentezi) sırasında bir molekül ATPATP, AMPAMP ve PPiPP_i’ye parçalandığı için toplam 2 adet yüksek enerjili fosfat bağı harcanır.
  2. B
    Uzama (elongasyon) evresinde, her bir aminoaçil-tRNAtRNA’nın ribozomun AA bölgesine uygun kodon-antikodon eşleşmesiyle yerleşebilmesi için GTPGTP hidrolizi gereklidir.
  3. Protein sentezini sonlandıran durdurucu kodonlar (UAAUAA, UAGUAG, UGAUGA), polipeptit zincirine eklenecek son bir amino asidi taşıyan özgül tRNAtRNA’lar tarafından tanınır.Cevap
  4. D
    Peptidil transferaz enzim aktivitesi ile peptid bağı oluşumu için doğrudan bir dışsal GTPGTP veya ATPATP hidrolizine ihtiyaç duyulmaz; enerji aminoaçil-tRNAtRNA’daki ester bağından sağlanır.
  5. E
    Tetrasiklin grubu antibiyotikler, bakteriyel ribozomun 30S alt birimine bağlanarak aminoaçil-tRNAtRNA’nın AA bölgesine girişini fiziksel olarak engellerler.

Cevap

Durdurucu kodonlar amino asit kodlamaz ve tRNA'lar yerine salınım faktörleri (RF) tarafından tanınır.
Durdurucu kodonlar (UAAUAA, UAGUAG, UGAUGA) herhangi bir amino asit kodlamazlar. Bu kodonlar ribozomun AA bölgesine geldiğinde, tRNA'lar yerine protein yapısındaki salınım faktörleri (prokaryotlarda RF1,RF2RF-1, RF-2, ökaryotlarda eRFeRF) bu kodonları tanır ve polipeptit zincirinin PP bölgesindeki tRNAtRNA’dan ayrılmasını sağlayarak sentezi bitirir.

Adım Adım Çözüm

1
Enerji gereksinimlerini değerlendir.
Aktivasyon (2 Pi), A bölgesine bağlanma (1 GTP) ve translokasyon (1 GTP) enerji harcayan basamaklardır.
Protein sentezi yüksek enerji maliyetli bir anabolik süreçtir.
2
Peptid bağı oluşum mekanizmasını incele.
Peptidil transferaz aktivitesi sırasında GTP harcanmaz.
Gereken enerji aktivasyon basamağında tRNA-amino asit arasındaki ester bağında depolanmıştır.
3
Terminasyon (sonlanma) basamağını analiz et.
Durdurucu kodonlar tRNA'lar tarafından tanınmaz.
Normal biyolojik süreçte durdurucu kodonlara karşılık gelen bir tRNA bulunmaz; süreci protein yapısındaki salınım faktörleri sonlandırır.

Anahtar Kavram

Translasyon Enerjetiği ve Terminasyon Faktörleri

Alternatif Yöntem

Toplam enerji hesabını hatırlamak: Bir proteinin sentezi için gereken toplam enerji 4n4n kuralı ile hesaplanır (n = aa sayısı). Bu hesapta her bir aa için 2 aktivasyon, 1 giriş (entry) ve 1 translokasyon enerjisi temel alınır.
Tahmini Süre:1m 15s
Bu soruyu puanla