TCA döngüsünde, süksinil-KoA'nın süksinata dönüştürüldüğü ve substrat düzeyinde fosforilasyonun gerçekleştiği basamağı katalizleyen süksinil-KoA sentetaz (süksinat tiyokinaz) enzimi, IUBMB (International Union of Biochemistry and Molecular Biology) sınıflamasına göre hangi ana grupta yer alır ve bu enzimin katalitik mekanizmasında aşağıdaki yapısal özelliklerden hangisi gözlenir?
- Ligazlar (EC 6) — Aktif merkezde geçici olarak fosforillenen bir histidin kalıntısının bulunmasıCevap
- BOksidoredüktazlar (EC 1) — Reaksiyon sırasında NAD+ koenziminin indirgenerek NADH üretmesi
- CTransferazlar (EC 2) — Fosfat grubunun transferi için piridoksal fosfat (PLP) kofaktörüne ihtiyaç duyulması
- DHidrolazlar (EC 3) — Yüksek enerjili tiyoester bağının su katılımı ile hidrolitik olarak koparılması
- ELiyazlar (EC 4) — Reaksiyon sırasında biyotin kofaktörü kullanılarak karbondioksit eklenmesi
Cevap
Süksinil-KoA sentetaz bir ligazdır (EC 6) ve katalitik mekanizmasında aktif merkezindeki bir histidin kalıntısı geçici olarak fosforillenir.
Süksinil-KoA sentetaz (süksinat tiyokinaz), nükleozid trifosfat (GTP/ATP) enerjisi ile ilişkili bir bağ oluşumunu katalizlediği için bir ligazdır. Katalitik döngüsü sırasında inorganik fosfat, süksinil-fosfat ara bileşiğinden enzimin aktif merkezindeki bir histidin kalıntısına aktarılır ve burada geçici bir yüksek enerjili fosfohistidin bağı oluşur. Bu, TUS düzeyinde sorgulanan ileri düzey bir yapısal-mekanistik detaydır.
Adım Adım Çözüm
Anahtar Kavram
Süksinil-KoA sentetazın ligaz sınıflaması ve fosfohistidin içeren üç basamaklı katalitik mekanizması.
Daha Fazla Pratik
Diğer 'sentetaz' isimli enzimlerin (örneğin glutamin sentetaz, asetil-KoA sentetaz) de ligaz sınıfında olduğunu ve ATP/GTP gereksinimini inceleyiniz.
Tahmini Süre:2m 0s