Examkin

Soru

Zorluk: Çok zorDNA Replikasyonu

Ökaryotik ve prokaryotik DNA replikasyonu süreçleri, benzer temel mekanizmalara sahip olsalar da replikasyon çatalındaki protein organizasyonu ve enzim polariteleri açısından önemli farklılıklar gösterirler.

Buna göre, replikasyon çatalında görev alan enzimlerin fonksiyonel ve yapısal özellikleri ile ilgili aşağıdaki ifadelerden hangisi doğrudur?

  1. Ökaryotik replikasyonda görev alan MCM2-7 helikaz kompleksi, kalıp DNA üzerinde 3′→5′3' \rightarrow 5' yönünde ilerleyerek kesintisiz (leading) zincir üzerinde hareket eder.Cevap
  2. B
    Prokaryotlardaki DNA polimerizasyonundan sorumlu ana enzim kompleksinin ϵ\epsilon (epsilon) alt birimi, ökaryotik DNA polimeraz ϵ\epsilon ile aynı katalitik işlevi görerek nükleotid eklenmesinden sorumludur.
  3. C
    Replikasyonun başlangıcında görev alan primaz enzimi, kalıp DNA zincirini 3′→5′3' \rightarrow 5' yönünde okuyarak deoksiribonükleotidlerden oluşan kısa başlatıcı diziler sentezler.
  4. D
    DNA topoizomeraz II (DNA giraz), prokaryotlarda replikasyon çatalının önünde oluşan negatif süperkıvrımları ATP harcayarak ortadan kaldırır.
  5. E
    Ökaryotlarda DNA polimeraz α\alpha, primaz aktivitesiyle sentezlenen RNA primerini uzatırken sahip olduğu 3′→5′3' \rightarrow 5' ekzonükleaz aktivitesi sayesinde hata düzeltme yapar.

Cevap

Ökaryotik replikasyonda görev alan MCM2-7 helikaz kompleksi, kalıp DNA üzerinde 3′→5′3' \rightarrow 5' yönünde ilerleyerek kesintisiz (leading) zincir üzerinde hareket eder.
Doğru ifade, ökaryotik helikazın (MCM2-7) 3′→5′3' \rightarrow 5' yönünde ve kesintisiz zincir (leading strand) kalıbı üzerinde hareket ettiğini belirtmektedir. Bu durum prokaryotik sistemdeki DnaB helikazının tam tersidir (5′→3′5' \rightarrow 3' ve lagging strand kalıbı).

Adım Adım Çözüm

1
Prokaryotik ve ökaryotik helikazların polaritelerini karşılaştırın.
Prokaryotik DnaB helikazı 5′→3′5' \rightarrow 3' yönünde (kesintili zincir kalıbında), ökaryotik MCM2-7 ise 3′→5′3' \rightarrow 5' yönünde (kesintisiz zincir kalıbında) hareket eder.
Replikasyon çatalının fiziksel organizasyonu bu polarite farkına göre düzenlenmiştir.
2
İsimlendirme benzerliği olan ϵ\epsilon birimlerini analiz edin.
Prokaryotik ϵ\epsilon bir alt birimdir ve ekzonükleaz yapar; ökaryotik Pol ϵ\epsilon ise tam bir polimerazdır ve sentez yapar.
Nomenklatür benzerliği fonksiyonel özdeşlik anlamına gelmez.
3
DNA Polimeraz α\alpha'nın proofreading yeteneğini kontrol edin.
Pol α\alpha hata düzeltme yeteneği olmayan nadir replikatif polimerazlardandır.
Primer sentezi sonrası Pol δ\delta veya ϵ\epsilon ile yer değiştirmesinin (polymerase switching) nedenlerinden biri budur.

Anahtar Kavram

Replikasyon Çatalı Enzim Polaritesi ve Ökaryotik-Prokaryotik Farkları
Bu soruyu puanla

Konular

DNA Replikasyonu

Bu konudan daha fazla soru