Lizozomal enzimlerin Golgi aygıtında diğer sekretuvar proteinlerden ayırt edilerek mannoz-6-fosfat ile işaretlenmesi, hücre içi hedefleme açısından kritik bir basamaktır. Bu süreçte görev alan N-asetilglukozamin (GlcNAc) fosfotransferaz enzimi, lizozomal enzimleri diğer glikoproteinlerden hangi moleküler özelliğine göre tanır?
- Protein yüzeyindeki üç boyutlu sinyal yaması (signal patch) yapısıCevap
- BN-terminal uçtaki hidrofobik sinyal peptidi dizisi
- CC-terminal uçtaki KDEL amino asit dizisi
- DOligosakkarit zincirindeki terminal siyalik asit varlığı
- ETrans-Golgi ağındaki klatrin adaptör proteinlerine bağlanma afinitesi
Cevap
GlcNAc-fosfotransferaz enzimi, lizozomal enzimleri yüzeylerindeki üç boyutlu sinyal yaması (signal patch) sayesinde tanır.
Lizozomal hidrolazların Golgi aygıtında özgül olarak tanınması, proteinin amino asit dizisindeki lineer bir sinyalden ziyade, proteinin tersiyer yapısında (katlanmış halinde) bir araya gelen amino asitlerin oluşturduğu 'sinyal yaması' (signal patch) sayesinde gerçekleşir. GlcNAc-fosfotransferaz enzimi bu üç boyutlu yapıyı tanır ve sadece bu yapıya sahip proteinlere fosfat grubu ekler. Bu mekanizma, lizozomal enzimlerin diğer salgı proteinlerinden (örneğin albümin, immünoglobulinler) ayırt edilmesini sağlar.
Adım Adım Çözüm
Anahtar Kavram
Sinyal Yaması (Signal Patch) ile Tanıma
İpuçları
1
Bu tanıma işlemi, proteinin amino asit dizisindeki düz bir sırayı değil, proteinin üç boyutlu katlanmış halini gerektirir.
2
İşaretleme enzimi olan fosfotransferaz, proteinin yüzeyindeki özel bir 'yama' bölgesine bağlanır.
3
Cevap, 'sinyal peptidi' (lineer) ile 'sinyal yaması' (konformasyonel) arasındaki farkta gizlidir.
Daha Fazla Pratik
M6P sinyali oluşturulamazsa (GlcNAc-fosfotransferaz eksikliği) hangi hastalığın gelişeceğini ve klinik tablosunu (I-hücre hastalığı) gözden geçiriniz.
Tahmini Süre:1m 30s