Examkin

Soru

Zorluk: Çok zorEndoplazmik Retikulum (GER ve DER)

Endoplazmik retikulumun (ER) granüllü (GER) ve düz (DER) bölümleri, hücrenin fonksiyonel gereksinimlerine göre birbirine dönüşebilen ancak morfolojik olarak belirgin farklılıklar gösteren yapılardır. Bu iki bölgenin mimari organizasyonunu ve membran geometrisini belirleyen moleküler unsurlar hakkında aşağıdakilerden hangisi doğrudur?

  1. A
    CLIMP-63 proteinleri, DER tübüllerinin lümeninde birleşerek tübüler yapının çökmesini engelleyen iç iskeleti oluşturur.
  2. B
    Sec61 translokon kompleksi, polipeptid sentezi yapmadığı zamanlarda DER bölgelerine göç ederek membranı büküp sarnıç yapılarını tübüllere dönüştürür.
  3. Retikülon ailesi proteinleri ve DP1, ER membranına kama gibi saplanarak yüksek kavis oluşturur ve tübüler ağ yapısının (DER) sürekliliğini sağlar.Cevap
  4. D
    Dolişol fosfat, GER membranının sitozolik yüzünde asimetrik bir genişleme yaratarak sarnıç yapılarının yassılaşmasını sağlayan ana yapısal lipiddir.
  5. E
    DER morfolojisi, lümen içindeki kalsiyum bağlayıcı proteinlerin (kalsekestrin) oluşturduğu polimerlerin membranı dışa doğru itmesiyle pasif olarak şekillenir.

Cevap

Retikülon ailesi proteinleri ve DP1, ER membranında yüksek eğrilik (kavis) oluşturarak tübüler ağ yapısının (DER) şekillenmesini ve stabilize edilmesini sağlar.
Doğru yanıt olan seçenek, ER morfolojisinin moleküler temelini açıklar. Retikülonlar ve DP1 (veya REEP ailesi), ER membranının dış yaprağına kama şeklinde girerek membranda dışbükey bir eğrilik oluşturur. Bu yüksek eğrilik, ER'nin tübüler ağ (DER) formunu almasını sağlar. Bu proteinlerin eksikliğinde tübüler ağ yapısı bozulur ve ER sadece sarnıç yapılarından ibaret kalır.

Adım Adım Çözüm

1
ER morfolojik birimlerini tanımla.
ER, yassı sarnıçlar (sheets - GER) ve tübüler ağ (tubules - DER) olmak üzere iki temel formda bulunur.
Morfolojik farkın protein düzeyindeki temelini anlamak için bu ayrım gereklidir.
2
Membran eğriliği (curvature) mekanizmasını analiz et.
Tübüler yapıların oluşması için membranın keskin bir şekilde bükülmesi gerekir.
Geometrik olarak tübüller, sarnıçlara göre çok daha yüksek membran eğriliğine sahiptir.
3
Bükücü proteinleri (shaping proteins) belirle.
Retikülonlar (Reticulons) ve DP1 proteinleri, 'kama' (wedge) mekanizması ile membranı bükerek tübülleri oluşturur.
Bu proteinler tübüler DER bölgelerinde zenginleşmiş markers molekülleridir.
4
Sarnıç yapısını koruyan proteinlerle karşılaştır.
CLIMP-63 gibi proteinler sarnıçların yassı ve paralel kalmasını sağlarken, retikülonlar tübül oluşumunu sağlar.
GER ve DER arasındaki morfolojik ayrım bu spesifik protein dağılımı ile korunur.

Anahtar Kavram

ER morfolojisi; sarnıç yapısını stabilize eden proteinler (CLIMP-63) ile tübüler yapıyı oluşturan proteinler (Retikülonlar ve DP1) arasındaki dengeyle belirlenir.

Daha Fazla Pratik

ER-associated degradation (ERAD) mekanizmasında görev alan proteinlerin GER ve DER arasındaki dağılımını inceleyiniz.

Alternatif Yöntem

ER morfolojisini hatırlarken; 'granüllü' kısmın (GER) yassı kitap sayfaları (sheets), 'düz' kısmın (DER) ise dallanan borular (tubules) şeklinde olduğunu ve boru şeklini vermek için membran bükücü (retikülon) proteinlere ihtiyaç duyulduğunu kodlayabilirsiniz.
Tahmini Süre:2m 30s
Bu soruyu puanla

Konular

Endoplazmik Retikulum (GER ve DER)

Bu konudan daha fazla soru