Examkin

Soru

Zorluk: ZorRNA Sentezi (Transkripsiyon)

Prokaryotik hücrelerde gen ifadesinin ilk basamağı olan transkripsiyonun başlatılması süreci karmaşık konformasyonel değişiklikleri içerir. RNA polimeraz holoenziminin promoter dizilerine bağlanmasıyla başlayan ve transkripsiyonun kararlı bir şekilde devam ettiği "uzama" (elongation) fazına geçişi kapsayan süreçle ilgili aşağıdaki ifadelerden hangisi doğrudur?

  1. σ\sigma (sigma) faktörünün kompleksten ayrılması, RNA polimerazın promoter bölgesinden kurtularak (promoter klirensi) uzama fazına geçmesini sağlayan temel mekanizmadır.Cevap
  2. B
    RNA polimerazın çekirdek (core) enzimi, −10-10 ve −35-35 promoter dizilerini yüksek özgüllükle tanıyarak DNA'ya doğrudan bağlanma yeteneğine sahiptir.
  3. C
    Transkripsiyon sırasında yeni sentezlenen RNA zinciri 3′→5′3' \rightarrow 5' yönünde büyürken, kalıp DNA zinciri 5′→3′5' \rightarrow 3' yönünde okunur.
  4. D
    Rifampisin, promoter klirensi aşamasını başarıyla tamamlamış ve uzama fazına geçmiş olan RNA polimerazın katalitik aktivitesini doğrudan inhibe eder.
  5. E
    Promoter bölgesindeki çift sarmallı DNA'nın açılarak "açık kompleks" oluşturulması, prokaryotlarda ökaryotlardaki gibi mutlaka ATP hidrolizi gerektiren bir helikaz aktivitesi ile gerçekleşir.

Cevap

Sigma faktörünün ayrılması, RNA polimerazın promoter bölgesinden kurtulup uzama fazına geçmesini sağlayan olaydır.
Prokaryotik transkripsiyonun başlatılması sırasında, σ\sigma faktörü promoter bölgesindeki −10-10 ve −35-35 dizilerini tanıyarak enzimi doğru yere bağlar. Transkripsiyon başladıktan sonra, yaklaşık 10 nükleotitlik bir RNA zinciri sentezlendiğinde σ\sigma faktörü kompleksten ayrılır. Bu ayrılma, RNA polimerazın promoter dizilerine olan sıkı bağının gevşemesini ve enzimin DNA üzerinde kayarak 'uzama' fazına geçmesini sağlar (promoter klirensi).

Adım Adım Çözüm

1
Prokaryotik RNA polimeraz yapısını analiz et.
Holoenzim (çekirdek enzim + sigma faktörü) ve çekirdek enzim (α2ββ′ω\alpha_2\beta\beta'\omega) ayrımını yap.
Promoter tanıma ve bağlanma için sigma faktörü şarttır.
2
Transkripsiyon başlatılma basamaklarını değerlendir.
Kapalı kompleks oluşumu, açık kompleks (DNA açılması) oluşumu ve abortif transkripsiyon evrelerini belirle.
Başlangıçta sentezlenen kısa parçalar salınır (abortif transkripsiyon).
3
Promoter klirensi ve uzama geçişini incele.
Sigma faktörünün kompleksten ayrıldığını ve çekirdek enzimin kararlı uzama fazına geçtiğini doğrula.
Sigma faktörü ayrılmadan enzim promoter dizilerinden tam olarak kopamaz ve uzama fazına geçemez.
4
İnhibitör mekanizmasını (Rifampisin) kontrol et.
Rifampisin'in sadece başlatma aşamasında etkili olduğunu, uzama fazına geçmiş enzime dokunmadığını saptan.
Rifampisin beta alt birimine bağlanarak büyüyen RNA zincirinin yolunu fiziksel olarak kapatır.

Anahtar Kavram

Sigma Faktörü ve Transkripsiyon Döngüsü

Daha Fazla Pratik

Ökaryotik RNA polimeraz II'nin karboksi-terminal ucunun (CTD) fosforillenmesi ile promoter klirensi arasındaki ilişkiyi incelemek, bu konunun ökaryotik karşılığını anlamanızı sağlar.
Tahmini Süre:1m 40s
Bu soruyu puanla

Konular

RNA Sentezi (Transkripsiyon)

Bu konudan daha fazla soru