Soru

Zorluk: Çok zorProtein Sentezi (Translasyon)

Ökaryotik bir hücre sitozolünde, 50 amino asit uzunluğunda bir polipeptit zincirinin sentezlenmesi planlanmaktadır. Bu sürecin inisiyasyon (mRNA tarama/scanning basamağı hariç), elongasyon ve terminasyon evrelerinde tüketilen toplam yüksek enerjili fosfat bağı (PPP \sim P) sayısı ile translasyonu 60S ribozomal alt birimine bağlanarak inhibe eden ajanın eşleştirilmesi aşağıdakilerin hangisinde doğru verilmiştir?

  1. A
    200 - Kloramfenikol
  2. 201 - SikloheksimidCevap
  3. C
    151 - Sikloheksimid
  4. D
    201 - Streptomisin
  5. E
    200 - Sikloheksimid

Cevap

Ökaryotik hücrede 50 amino asitlik polipeptit sentezi için 201 yüksek enerjili bağ harcanır ve bu süreci 60S birimine bağlanarak Sikloheksimid inhibe eder.
Sentezlenen her bir amino asit için aktivasyon basamağında 2 ATP eşdeğeri (PPP \sim P) harcanır (50×2=10050 \times 2 = 100). İnisiyasyon aşamasında eIF2 ve eIF5B tarafından 2 GTP tüketilir. Uzama evresinde ilk metiyonin hariç 49 amino asidin her biri için 2 GTP (toplam 98) ve terminasyonda eRF3 için 1 GTP kullanılır. Toplamda 201 PPP \sim P harcanır. Sikloheksimid, ökaryotik 60S alt birimine bağlanarak peptidil transferazı inhibe eden spesifik bir ajandır.

Adım Adım Çözüm

1
Amino asit aktivasyonu (tRNA şarjı) enerjisini hesapla.
100 PPP \sim P bağı.
Her bir amino asit için 1 ATP, AMP'ye dönüşür. AMP oluşumu ve takiben PPiPP_i hidrolizi 2 yüksek enerjili bağa eşdeğerdir (50×2=10050 \times 2 = 100).
2
İnisiyasyon (başlangıç) evresindeki enerji tüketimini belirle.
2 GTP.
Ökaryotlarda Met-tRNA'nın getirilmesi (eIF2-GTP) için 1 GTP ve büyük alt birimin birleşmesi (eIF5B-GTP) için 1 GTP harcanır.
3
Uzama (elongation) evresindeki enerji tüketimini hesapla.
98 GTP.
İlk amino asit P-sitesinde olduğu için kalan 49 amino asidin her biri için; A-sitesine giriş (eEF1A-GTP) ve translokasyon (eEF2-GTP) olmak üzere 2 GTP harcanır (49×2=9849 \times 2 = 98).
4
Terminasyon (sonlanma) evresi enerjisini ekle.
1 GTP.
Salınım faktörlerinin (eRF3) aktivitesi için 1 GTP hidroliz edilir.
5
Toplam enerjiyi bul ve inhibitörü belirle.
Toplam 201; İnhibitör: Sikloheksimid.
100+2+98+1=201100 + 2 + 98 + 1 = 201. Sikloheksimid ökaryotik 60S (peptidil transferaz) inhibitörüdür.

Anahtar Kavram

Ökaryotik translasyonda enerji bilançosu (4n+14n+1) ve spesifik inhibitör mekanizmaları.

Daha Fazla Pratik

Prokaryotik translasyonda EF-G ve ökaryotik translasyonda eEF2'nin benzer işlevlerini (translokasyon) ve bunların Difteri toksini gibi ajanlarla etkileşimini tekrar ediniz.
Tahmini Süre:2m 30s
Bu soruyu puanla