Soru

Zorluk: Çok zorProtein Sentezi (Translasyon)

Ökaryotik hücrelerde protein sentezinin başlama (inisiyasyon) evresi, prokaryotlardan farklı olarak oldukça karmaşık bir regülasyon ve enerji kullanımı döngüsüne sahiptir. Olgun bir mRNAmRNA'nın 55' ucuna bağlanan pre-inisiyasyon kompleksinin, uygun başlama kodonunu (AUGAUG) bulana kadar 535' \rightarrow 3' yönünde ilerlediği 'tarama (scanning)' süreciyle ilgili aşağıdaki ifadelerden hangisi doğrudur?

  1. Tarama süreci sırasında mRNAmRNA üzerindeki ikincil yapıların (hairpin) açılması için gerekli olan helikaz aktivitesi eIF4A tarafından yürütülür ve bu basamakta enerji kaynağı olarak ATPATP hidroliz edilir.Cevap
  2. B
    43S43S pre-inisiyasyon kompleksinin mRNAmRNA üzerine yüklenmesi için gerekli olan enerji, eIF2 faktörüne bağlı olan ATPATP molekülünün hidrolizi ile sağlanır.
  3. C
    Başlama kodonunun tanınmasından sonra eIF5B aracılığıyla 60S60S alt biriminin komplekse katılması sırasında enerji kaynağı olarak ATPATP tüketilir.
  4. D
    Ökaryotik başlama faktörü eIF4E, mRNAmRNA'nın 33'-poli(A) kuyruğuna bağlanarak kompleksin halkasallaşmasını (circularization) sağlar.
  5. E
    Prokaryotlardaki Shine-Dalgarno dizisinin karşılığı olan Kozak dizisi, 40S40S ribozomal alt birimindeki 18S18S rRNArRNA ile doğrudan baz eşleşmesi yaparak başlama kodonunu belirler.

Cevap

Tarama süreci sırasında ikincil yapıların açılması için eIF4A tarafından ATPATP hidroliz edilmesi doğrudur.
Ökaryotik translasyon inisiyasyonunda, 43S43S pre-inisiyasyon kompleksi mRNA'ya yüklendikten sonra başlama kodonunu bulmak için mRNA boyunca ilerler. Bu süreçte mRNA'nın sahip olduğu ikincil yapılar (hairpins), eIF4F kompleksinin bir parçası olan eIF4A tarafından çözülür. eIF4A bir RNA helikazdır ve bu yapıları bozmak için ATPATP hidrolizinden gelen enerjiyi kullanır.

Adım Adım Çözüm

1
eIF4F kompleksinin bileşenlerini analiz et
eIF4F kompleksi eIF4E (cap-binding), eIF4A (RNA helikaz) ve eIF4G (iskelet protein) birimlerinden oluşur.
Ökaryotik mRNA'nın taranması için cap yapısının tanınması ve ikincil yapıların çözülmesi gerekir.
2
Tarama (scanning) mekanizmasındaki enerji kaynağını belirle
eIF4A, mRNA üzerindeki stem-loop gibi yapıları açmak için ATPATP hidroliz eder.
Translasyonun çoğu basamağı GTPGTP kullansa da, tarama evresi karakteristik olarak ATPATP bağımlıdır.
3
Diğer inisiyasyon basamaklarındaki enerji kullanımını kontrol et
eIF2 (tRNA taşıma) ve eIF5B (alt birim birleşmesi) faktörleri GTPGTP kullanır.
GTPaz aktivitesi translasyon faktörleri için standart bir enerji dönüşüm mekanizmasıdır.

Anahtar Kavram

Ökaryotik Translasyon İnisiyasyonunda eIF4F ve ATP Bağımlı Tarama (Scanning)

Daha Fazla Pratik

eIF2-alfa fosforilasyonunun (açlık, stres durumlarında) protein sentezini nasıl global olarak inhibe ettiğini inceleyiniz.
Tahmini Süre:2m 0s
Bu soruyu puanla