Question

Difficulty: Very hardRNA Sentezi (Transkripsiyon)

Ökaryotik hücrelerde mRNAmRNA sentezi sırasında α\alpha-amanitin'e yüksek duyarlılık gösteren RNARNA polimeraz IIII’nin karboksi-terminal domaini (CTDCTD), transkripsiyonun farklı aşamalarında dinamik fosforilasyon kalıpları sergiler. Transkripsiyonel başlangıç kompleksinin oluşumunu takiben, enzimin promotörün yaklaşık 206020-60 nükleotid ilerisinde duraksadığı (promoterpromoter proximalproximal pausingpausing) bilinmektedir. Bu duraksamayı ortadan kaldırarak transkripsiyonun üretken uzama (productiveproductive elongationelongation) aşamasına geçmesini sağlayan, CTDCTD üzerindeki serin 2 (Ser2Ser2) kalıntılarını fosforilleyen ve aynı zamanda ekleme (splicingsplicing) faktörlerinin katılımını koordine eden temel protein kompleksi aşağıdakilerden hangisidir?

  1. PTEFbP-TEFb (Pozitif Transkripsiyonel Uzama Faktörü b)Answer
  2. B
    TFIIHTFIIH (Transkripsiyon Faktörü II H)
  3. C
    NELFNELF (Negatif Uzama Faktörü)
  4. D
    DSIFDSIF (DRBDRB SensitivitySensitivity InducingInducing FactorFactor)
  5. E
    TFIISTFIIS (Transkripsiyon Faktörü II S)

Answer

Transkripsiyonun duraksama aşamasından üretken uzama aşamasına geçişi sağlayan ve CTDCTD Serin 2 fosforilasyonunu gerçekleştiren temel kompleks PTEFbP-TEFb'dir.
PTEFbP-TEFb (Pozitif Transkripsiyonel Uzama Faktörü b), CDK9CDK9 ve siklin T1T1 alt birimlerinden oluşur. Transkripsiyonun başlangıcında RNARNA polimeraz IIII, NELFNELF ve DSIFDSIF faktörleri nedeniyle promotör yakınında duraksar. PTEFbP-TEFb, RNARNA polimeraz IIII’nin CTDCTD kuyruğundaki Serin 2 kalıntılarını fosforilleyerek bu duraksamayı çözer ve polimerazın üretken uzama fazına geçmesini sağlar. Ayrıca bu fosforilasyon kalıbı, splicingsplicing faktörlerinin polimeraza tutunması için gerekli olan kimyasal kodu oluşturur.

Step-by-Step Solution

1
RNARNA polimeraz IIII’nin transkripsiyon döngüsündeki konumunu analiz et.
Polimerazın promotör yakınında duraksadığı (pausingpausing) ve Serin 5 fosforilasyonundan Serin 2 fosforilasyonuna geçiş yapması gerektiği saptanır.
Farklı fosforilasyon durumları, polimerazın hangi mRNAmRNA işleme faktörlerini (kapak takma, ekleme, poliadenilasyon) taşıyacağını belirler.
2
Duraksamayı (pausingpausing) ortadan kaldıran kinazı belirle.
CDK9CDK9 içeren PTEFbP-TEFb kompleksinin bu aşamada kritik olduğu sonucuna varılır.
PTEFbP-TEFb, hem CTDCTD Serin 2'yi hem de baskılayıcı faktörler olan NELFNELF ve DSIFDSIF'i fosforilleyerek polimerazı serbest bırakır.
3
Serin 2 fosforilasyonunun fonksiyonel sonucunu onayla.
Serin 2 fosforilasyonu, splicingsplicing (ekleme) faktörlerinin enzime bağlanmasını sağlayarak sentezlenen RNARNA'nın işlenmesini koordine eder.
Bu koordinasyon, transkripsiyon ve mRNAmRNA işlemenin eş zamanlı (cotranscriptionalco-transcriptional) yürümesini sağlar.

Key Concept

RNARNA Polimeraz IIII CTDCTD fosforilasyon döngüsü ve PTEFbP-TEFb aracılı transkripsiyonel uzama kontrolü.
Rate this question