Soru

Zorluk: Çok zorDNA Replikasyonu

Ökaryotik DNADNA replikasyonu sırasında replikasyon çatalının stabilitesi ve ilerleyişi, prokaryotik sistemlerden farklı yapısal ve fonksiyonel özelliklere sahip protein kompleksleri tarafından kontrol edilir. Ökaryotik replikasyon çatalında görev alan proteinler ve özellikleri ile ilgili aşağıdaki ifadelerden hangisi yanlıştır?

  1. A
    MCM27MCM2-7 kompleksi, replikasyonun elongasyon fazında ATPATP hidrolizi kullanarak kalıp zincir üzerinde 353' \rightarrow 5' yönünde hareket eden fonksiyonel helikaz çekirdeğini oluşturur.
  2. B
    Replikasyon Faktörü C (RFCRFC), primer sentezi tamamlandıktan sonra 3OH3'-OH ucunu tanıyarak PCNAPCNA halkasını DNADNA üzerine yükler ve polimeraz değişimini (polymerase switchingpolymerase \ switching) tetikler.
  3. DNADNA Polimeraz α\alpha, bünyesinde barındırdığı primaz aktivitesiyle yaklaşık 10 nükleotitlik RNARNA sentezledikten sonra, 353' \rightarrow 5' ekzonükleaz aktivitesiyle bu dizinin doğruluğunu kontrol eder.Cevap
  4. D
    Topoizomeraz IIII, replikasyon çatalının önünde biriken pozitif süperkıvrımları, DNADNA çift ipliğinde geçici kopuşlar yaratarak ve ATPATP enerjisini kullanarak giderir.
  5. E
    Flap Endonükleaz 1 (FEN1FEN1), Okazaki fragmanlarının olgunlaşması sürecinde DNADNA Polimeraz δ\delta tarafından yerinden edilen RNA-DNA flap yapılarını uzaklaştıran temel enzimdir.

Cevap

DNADNA Polimeraz α\alpha'nın 353' \rightarrow 5' ekzonükleaz (proofreading) aktivitesine sahip olduğunu iddia eden ifade yanlıştır.
İfadedeki yanlışlık DNADNA Polimeraz α\alpha'nın (primaz kompleksi ile beraber) 353' \rightarrow 5' ekzonükleaz aktivitesine sahip olduğunun söylenmesidir. Gerçekte, ökaryotik nükleer polimerazlardan sadece Pol δPol \ \delta ve Pol ϵPol \ \epsilon bu düzeltme (proofreading) yeteneğine sahiptir. Pol αPol \ \alpha, başlattığı sentezde hata düzeltme yapamaz.

Adım Adım Çözüm

1
Ökaryotik replikasyon enzimlerinin fonksiyonlarını analiz et.
Ökaryotlarda DNADNA Polimeraz α\alpha, δ\delta ve ϵ\epsilon ana polimerazlardır; ancak hepsinin hata düzeltme yeteneği aynı değildir.
Replikasyonun doğruluğu, polimerazların proofreading kapasitesine bağlıdır.
2
DNADNA Polimeraz α\alpha'nın (ve primaz ünitesinin) özelliklerini değerlendir.
DNADNA Polimeraz α\alpha, primeri sentezler ancak 353' \rightarrow 5' ekzonükleaz aktivitesinden yoksundur.
Başlatıcı polimerazların genellikle prosesivitesi düşük ve proofreading yeteneği yoktur; bu görevleri daha sonra sürece dahil olan δ\delta ve ϵ\epsilon üstlenir.
3
Diğer yardımcı proteinlerin (helikaz, RFCRFC, FEN1FEN1, topoizomeraz) rollerini doğrula.
Ökaryotik helikazın (MCM27MCM2-7) 353' \rightarrow 5' yönünde ilerlediği, RFCRFC'nin PCNAPCNA yüklediği ve FEN1FEN1'in primer uzaklaştırdığı bilgileri doğrudur.
Ökaryotik replikasyon mekanizması, prokaryotik mekanizmadan bu spesifik yön ve protein etkileşimleri ile ayrılır.

Anahtar Kavram

Ökaryotik DNA polimerazlar arasında sadece Pol δ\delta ve Pol ϵ\epsilon düzeltme (proofreading) yeteneğine sahiptir; Pol α\alpha bu yeteneğe sahip değildir.
Tahmini Süre:2m 0s
Bu soruyu puanla