Soru

Zorluk: ZorGenel Viroloji

Viroloji laboratuvarında yeni izole edilen bir virüsün; zarflı bir yapıya sahip olduğu, nükleokapsidinin helikal simetri sergilediği ve genomunun iki segmentli RNARNA’dan oluştuğu saptanmıştır. Yapılan ileri analizlerde, genomun hem pozitif hem de negatif polariteli gen bölgelerini aynı segment üzerinde bulunduran 'ambisense' nitelikte olduğu belirlenmiştir. Bu virüsün replikasyon stratejisi ve yapısal özellikleri dikkate alındığında, aşağıdakilerden hangisi doğrudur?

  1. Virion yapısında paketlenmiş halde RNARNA bağımlı RNARNA polimeraz enzimi bulundurur.Cevap
  2. B
    Saflaştırılmış genomik RNARNA’sı, konak hücreye transfekte edildiğinde doğrudan enfeksiyon başlatma yeteneğine sahiptir.
  3. C
    Nükleokapsid yapısı ikozahedral simetri prensiplerine göre paketlenmiştir.
  4. D
    Replikasyon döngüsünün tüm aşamaları konak hücre çekirdeğinde (nükleus) gerçekleşir.
  5. E
    Zarfsız bir virüs olduğu için eter ve kloroform gibi lipid çözücülere karşı dirençlidir.

Cevap

Virion yapısında paketlenmiş halde RNA bağımlı RNA polimeraz enzimi bulundurur.
Doğru seçenek, virüsün virion yapısında RNARNA bağımlı RNARNA polimeraz (RdRpRdRp) enzimi taşıdığını ifade eden açıklamadır. Ambisense genomlar, bazı genleri negatif polaritede taşıdıkları için, hücreye girdiklerinde ilk transkripsiyon basamağını gerçekleştirebilmek adına mutlaka hazır bir polimeraz enzimine ihtiyaç duyarlar. Bu durum Arenaviridae (Lassa ateşi virüsü, LCMV) ailesinin temel özelliğidir.

Adım Adım Çözüm

1
Virüsün genomik özelliklerini analiz et.
Virüsün 'ambisense' (karışık polariteli) ve segmentli RNARNA genomuna sahip olduğu belirlenir (Örn: Arenaviridae).
Ambisense yapısı, virüsün hem (−)(-) hem de (+)(+) polariteli genetik bölgeler içerdiğini gösterir.
2
Replikasyon için gerekli enzim ihtiyacını değerlendir.
Hücrede bu tip bir genomdan mRNAmRNA sentezleyecek hazır bir enzim bulunmadığı anlaşılır.
Konak hücre ribozomları (−)(-) polariteli kısımları transle edemez ve hücrede RNARNA bağımlı RNARNA polimeraz (RdRpRdRp) yoktur.
3
Sınıflandırma ve simetri özelliklerini kontrol et.
Zarflı ve helikal nükleokapsid yapısının ambisense stratejisi ile uyumu teyit edilir.
Arenavirüsler zarflı, helikal nükleokapsidli ve kendi RdRpRdRp enzimini paketleyen virüslerdir.

Anahtar Kavram

Ambisense RNA virüsleri (Arenaviridae ve bazı Bunyaviridae üyeleri), replikasyonu başlatabilmek için virion içerisinde fonksiyonel bir RNA bağımlı RNA polimeraz (RdRpRdRp) taşımak zorundadırlar; bu nedenle saflaştırılmış genomları enfeksiyöz değildir.

Daha Fazla Pratik

Farklı RNA virüs ailelerinin (Picornaviridae vs Orthomyxoviridae) genom polaritesi ve enfektivite özelliklerini karşılaştırınız.
Tahmini Süre:2m 30s
Bu soruyu puanla