Soru

Zorluk: ZorEnzimlerin Yapısal Özellikleri ve Sınıflandırma

Enzimlerin yapısal organizasyonları (apoenzim, holoenzim, prostetik grup) ve International Union of Biochemistry (IUB) tarafından belirlenen altı ana sınıfın katalitik mekanizmaları birlikte değerlendirildiğinde, aşağıdaki ifadelerden hangisi biyokimyasal olarak doğrudur?

  1. A
    Pirüvat dekarboksilaz enzimi, pirüvattan CO2CO_2 çıkışını sağlarken ATP hidrolizinden sağlanan enerjiyi kullandığı için Ligaz (EC 6) sınıfında yer alır.
  2. Süksinat dehidrogenaz enziminde olduğu gibi, apoenzim kısmına kovalent veya çok sıkı bir şekilde bağlanmış olan ve katalitik süreçte proteinden ayrılmayan flavin adenin dinükleotid (FAD) gibi yapılar prostetik grup olarak tanımlanır.Cevap
  3. C
    Laktat dehidrogenaz, laktat ve pirüvat arasındaki dönüşümü katalizlerken elektron transferi gerçekleştirdiği için 'Transferaz' (EC 2) sınıfının tipik bir örneğidir.
  4. D
    Karbonik anhidraz enzimi, CO2CO_2 ve suyu birleştirerek H2CO3H_2CO_3 oluşturduğu tepkimede su molekülünü bir bağ koparmak amacıyla kullandığından 'Hidrolaz' (EC 3) sınıfında sınıflandırılır.
  5. E
    Bir enzimin katalitik aktivite göstermesi için gerekli olan tüm protein ve yardımcı kısımları içeren inaktif formuna 'apoenzim' denir.

Cevap

Apoenzime kovalent veya çok sıkı bağlanan ve ayrılmayan FAD gibi organik bileşenler prostetik grup olarak adlandırılır.
Doğru olan seçenek, prostetik grupların tanımını ve Süksinat dehidrogenazdaki FAD örneğini doğru bir şekilde açıklamaktadır. Prostetik gruplar, koenzimlerin aksine apoenzimden ayrılmazlar ve katalitik döngünün her aşamasında enzime bağlı kalırlar.

Adım Adım Çözüm

1
Enzim bileşenlerini ayırt et.
Protein kısmına 'apoenzim', yardımcı kısım (koenzim/kofaktör) eklenmiş aktif forma 'holoenzim' denir.
Yapısal tanımların doğru yapılması sorunun temelidir.
2
Yardımcı grupların bağlanma özelliklerini incele.
Eğer yardımcı grup enzimden ayrılmıyorsa (kovalent veya çok güçlü etkileşim), buna 'prostetik grup' denir.
Süksinat dehidrogenazdaki FAD, prostetik grubun en klasik örneğidir.
3
IUB sınıflarını mekanizmaya göre kontrol et.
Oksidoredüktaz (LDH), Liyaz (Karbonik anhidraz, Dekarboksilaz) ve Ligaz (Karboksilaz) farklarını belirle.
Liyazlar su katmadan bağ koparır veya çift bağa grup ekler; Ligazlar ise mutlaka ATP enerjisi kullanır.

Anahtar Kavram

Enzim Yapısı ve EC Sınıflandırma Mantığı
Bu soruyu puanla