Examkin

Soru

Zorluk: Çok zorRNA Sentezi (Transkripsiyon)

Hücresel transkripsiyon süreçleri; kullanılan polimeraz tipleri, promotör tanıma mekanizmaları ve spesifik inhibitörlere olan duyarlılıkları açısından yüksek düzeyde özelleşmiştir. Transkripsiyon inhibitörlerinin moleküler etki mekanizmaları ve seçicilikleri ile ilgili aşağıdaki ifadelerden hangisi doğrudur?

  1. A
    α\alpha-amanitin, RNA polimeraz II'nin 'bridge helix' (köprü heliks) bölgesine bağlanarak enzimin DNA kalıbına olan ilk bağlanma afinitesini (initiation) seçici olarak azaltır.
  2. Rifampisin, prokaryotik RNA polimerazın β\beta alt ünitesine bağlanarak, yeni sentezlenen RNA zincirinin polimerazdan çıkış kanalını sterik olarak bloke eder.Cevap
  3. C
    Aktinomisin D, düşük konsantrasyonlarda (0.040.04 μg/mL\mu g/mL) kullanıldığında nükleolusta gerçekleşen ve RNA polimeraz II tarafından yönetilen mRNAmRNA sentezini öncelikli olarak inhibe eder.
  4. D
    α\alpha-amanitin, yüksek konsantrasyonlarda bile RNA polimeraz III aktivitesini etkilemeyen, sadece RNA polimeraz II'ye özgü bir inhibitördür.
  5. E
    Rifampisin, transkripsiyonun uzama (elongation) evresinde nükleotid ekleme yönünü 3′→5′3' \rightarrow 5' olarak değiştirerek DNA-RNA hibridinin stabilitesini bozar.

Cevap

Rifampisin, prokaryotik RNA polimerazın β\beta alt ünitesine bağlanarak RNA çıkış kanalını sterik olarak bloke eder ve transkriptin uzamasını engeller.
Rifampisin, bakteriyel RNA polimerazın β\beta alt ünitesine bağlanarak RNA sentezinin başlangıcında (2-3 nükleotidlik aşamada) sterik bir engel oluşturur. Bu engel, büyüyen RNA zincirinin polimerazın içindeki çıkış kanalından geçmesini imkansız hale getirerek transkripsiyonu durdurur.

Adım Adım Çözüm

1
Prokaryotik RNA polimeraz inhibitörü olan rifampisinin bağlanma bölgesinin belirlenmesi.
Rifampisin, kor enzimin β\beta alt ünitesinde, aktif merkezin hemen yanındaki RNA çıkış kanalına bağlanır.
Bu bölge, sentezlenen RNA'nın enzimden ayrılma yoludur.
2
Rifampisinin sentez üzerindeki spesifik etkisinin analizi.
İlk fosfodiester bağlarının oluşumu engellenmez ancak RNA 2-3 nükleotide ulaştığında sterik engel nedeniyle daha fazla uzayamaz.
İlacın hacimli yapısı RNA zincirinin kanalda ilerlemesine izin vermez (sterik engel).
3
Ökaryotik inhibitörlerin (α\alpha-amanitin ve Aktinomisin D) seçiciliklerinin karşılaştırılması.
α\alpha-amanitin Pol II (yüksek duyarlılık) ve Pol III'ü (düşük duyarlılık) etkiler; Aktinomisin D düşük dozda Pol I'i etkiler.
Enzimlerin yapısal farklılıkları inhibitörlere olan afinitelerini belirler.

Anahtar Kavram

Transkripsiyon İnhibitörlerinin Mekanizmaları ve Polimeraz Özgüllüğü
Bu soruyu puanla

Konular

RNA Sentezi (Transkripsiyon)

Bu konudan daha fazla soru