Examkin

Soru

Zorluk: Çok zorDNA Replikasyonu

DNA replikasyonunda görev alan enzimlerin ve alt birimlerin isimlendirmeleri benzerlik gösterse de, bu bileşenlerin biyokimyasal fonksiyonları prokaryot ve ökaryot hücrelerde önemli farklılıklar sergileyebilir. Buna göre, **"Epsilon (ϵ\epsilon)"** simgesiyle tanımlanan replikasyon bileşenlerinin fonksiyonları ile ilgili aşağıdaki karşılaştırmalardan hangisi doğrudur?

  1. Prokaryotik DNA polimeraz III bünyesindeki ϵ\epsilon alt birimi 3′→5′3' \rightarrow 5' ekzonükleaz (kanıt okuma) aktivitesinden sorumluyken; ökaryotik DNA polimeraz ϵ\epsilon, kesintisiz (leading) zincirin sentezinden sorumlu temel polimerazdır.Cevap
  2. B
    Ökaryotik DNA polimeraz ϵ\epsilon, primer sentezi sonrası polimeraz 'switching' mekanizmasıyla görevi devralan ve RNA primeri uzaklaştırma (5′→3′5' \rightarrow 3' ekzonükleaz) yeteneğine sahip olan temel onarım enzimidir.
  3. C
    Prokaryotik ϵ\epsilon subüniti, helikaz (DnaBDnaB) aktivitesini tetikleyen bir primaz işlevi görürken; ökaryotik polimeraz ϵ\epsilon, süperkıvrımları gideren topoizomeraz benzeri bir aktivite sergiler.
  4. D
    Her iki sistemde de ϵ\epsilon bileşenleri, nükleik asit sentezini her zaman 3′→5′3' \rightarrow 5' yönünde gerçekleştirerek replikasyon hızını artıran yardımcı proteinlerdir.
  5. E
    Prokaryotlarda ϵ\epsilon alt birimi 'sliding clamp' (sürgülü kıskaç) yükleyicisi olarak görev yaparken; ökaryotik polimeraz ϵ\epsilon, telomerik bölgelerin kısalmasını engelleyen ters transkriptaz aktivitesine sahiptir.

Cevap

Prokaryotik DNA polimeraz III bünyesindeki epsilon alt birimi kanıt okuma aktivitesinden sorumluyken; ökaryotik DNA polimeraz epsilon, kesintisiz zincirin sentezinden sorumlu temel polimerazdır.
Doğru yanıt olan seçenek, biyokimyasal literatürdeki isimlendirme farklarını tam olarak karşılar. Prokaryotik (E.coliE. coli) DNA polimeraz III holoenziminin 'core' (çekirdek) yapısı üç alt birimden oluşur: α\alpha (polimerizasyon), ϵ\epsilon (3′→5′3' \rightarrow 5' ekzonükleaz/proofreading) ve θ\theta (aktivite artırıcı). Ökaryotlarda ise nükleer DNA replikasyonunda görev alan üç ana polimerazdan biri olan polimeraz ϵ\epsilon, özellikle kesintisiz (leading) zincirin yüksek hız ve ilerleyicilikle sentezlenmesinden sorumludur.

Adım Adım Çözüm

1
Prokaryotik DNA polimeraz III (Pol III) holoenziminin çekirdek yapısını analiz et.
Pol III core enzimi α\alpha (polimeraz), ϵ\epsilon (3'-5' ekzonükleaz) ve θ\theta (stabilizatör) alt birimlerinden oluşur.
Epsilon biriminin prokaryotlardaki spesifik görevini belirlemek için çekirdek enzim yapısını bilmek gerekir.
2
Ökaryotik nükleer DNA polimerazlarının (α,δ,ϵ\alpha, \delta, \epsilon) görevlerini tanımla.
DNA polimeraz α\alpha başlangıç (priming), δ\delta kesintili (lagging) zincir ve ϵ\epsilon kesintisiz (leading) zincir sentezinden sorumludur.
Ökaryotik sistemdeki 'epsilon' isimlendirmesinin fonksiyonel karşılığını bulmak gerekir.
3
İki sistemdeki 'epsilon' bileşenlerini karşılaştır ve sentez yönü/sadakat kurallarıyla doğrula.
Prokaryotik ϵ\epsilon alt birimdir, ökaryotik ϵ\epsilon ise bağımsız bir polimerazdır. Her ikisi de yüksek sadakatli sentez için gereklidir.
İsim benzerliğinden kaynaklanan kafa karışıklığını gidermek ve doğru fonksiyonel eşleşmeyi seçmek için gereklidir.

Anahtar Kavram

Prokaryotik ve ökaryotik replikasyon enzimlerinin alt birim düzeyinde fonksiyonel ayrımı ve isim benzerliklerinin yönetimi.

Daha Fazla Pratik

Replikasyon faktörü C (RFC) ve PCNA'nın prokaryotik karşılıkları ile polimeraz switching mekanizmasını gözden geçirmek konuyu pekiştirecektir.
Tahmini Süre:2m 30s
Bu soruyu puanla

Konular

DNA Replikasyonu

Bu konudan daha fazla soru