Soru

Zorluk: ZorEnzimlerin Yapısal Özellikleri ve Sınıflandırma

Bir hücre içi metabolik yolakta görev alan bir enzimin, substratındaki C−CC-C bağını su kullanmadan (non-hidrolitik) kopararak yapıdan CO2CO_2 ayrılmasını sağladığı ve geride bir çift bağ bıraktığı saptanmıştır. Bu reaksiyon sırasında ATPATP hidrolizi gerçekleşmediği ve enzimin kofaktör olarak tiyamin pirofosfata (TPPTPP) gereksinim duyduğu bilindiğine göre, bahsi geçen enzim International Union of Biochemistry (IUB) sınıflamasına göre hangi grupta yer alır?

  1. A
    Oksidoredüktazlar
  2. B
    Transferazlar
  3. C
    Hidrolazlar
  4. LiyazlarCevap
  5. E
    Ligazlar

Cevap

Tanımlanan non-hidrolitik bağ koparma ve çift bağ oluşturma özellikleri Liyazlar (EC 4) sınıfına özgüdür.
Liyazlar, su (H2OH_2O) girişi olmadan veya oksidasyon içermeden bağ koparılmasını katalizleyen enzim sınıfıdır. Soruda belirtilen C−CC-C bağının koparılması, CO2CO_2 çıkışı ve çift bağ oluşumu özellikleri, pirüvat dekarboksilaz gibi TPPTPP bağımlı enzimlerin dahil olduğu bu sınıfın temel karakteristiğidir.

Adım Adım Çözüm

1
Reaksiyonun mekanizmasını analiz etmek
Bağ koparılması sırasında su kullanılmadığı (non-hidrolitik) ve ATPATP enerjisine başvurulmadığı saptanmıştır.
Bu özellikler enzimi Hidrolaz (EC 3) ve Ligaz (EC 6) sınıflarından ayırır.
2
Kofaktör ve ürün ilişkisini değerlendirmek
TPPTPP kofaktörü varlığında CO2CO_2 çıkışı (dekarboksilasyon) gerçekleşmektedir.
TPPTPP bağımlı dekarboksilazlar, substrattan CO2CO_2 ayırırken yeni bir çift bağ oluşumuna neden olan liyaz sınıfı enzimlerdir.
3
IUB sınıflamasıyla eşleştirmek
Grup ayrılması ile çift bağ oluşumunu katalizleyen enzim sınıfı belirlenmiştir.
Bu kriterler International Union of Biochemistry sınıflamasında EC 4 (Liyazlar) grubunu tanımlar.

Anahtar Kavram

Liyazlar (EC 4), hidroliz veya oksidasyon dışında bir yolla bağları koparan veya çift bağlara grup ekleyen enzimlerdir.

Daha Fazla Pratik

Pirüvat dehidrogenaz kompleksi ile pirüvat dekarboksilaz arasındaki kofaktör ve sınıf farklarını inceleyiniz.
Tahmini Süre:1m 30s
Bu soruyu puanla