Soru

Zorluk: ZorRNA Sentezi (Transkripsiyon)

Ökaryotik transkripsiyon sürecinde RNA polimeraz II, sentezlenen RNA zincirine hatalı bir nükleotid eklendiğinde duraksar ve enzim kalıp üzerinde geriye doğru kayarak (backtracking) sentez ucunu aktif bölgeden dışarı çıkarır. Bu süreçte, hatalı RNA segmentinin hidrolitik olarak kesilmesini (cleavage) uyararak transkripsiyonun doğru şekilde yeniden başlamasını sağlayan faktör aşağıdakilerden hangisidir?

  1. TFIISCevap
  2. B
    TFIIH
  3. C
    TFIIF
  4. D
    Rho faktörü

Cevap

Hatalı RNA segmentinin hidrolitik kesimini uyararak RNA polimeraz II'nin hata düzeltme sürecini koordine eden faktör TFIIS'tir.
Doğru yanıt olan faktör, RNA polimeraz II'nin aktif bölgesiyle etkileşime girerek onun hidrolitik aktivitesini (RNA zincirini kesme yeteneği) uyarır. Bu işlem 'backtracking' sonrası dışarıda kalan hatalı RNA ucunun atılmasını ve enzimin hatasız bir şekilde senteze devam etmesini sağlar. Bu mekanizma, ökaryotik RNA sentezinin sadakatini (fidelity) artıran temel süreçlerden biridir.

Adım Adım Çözüm

1
Hatanın saptanması
RNA polimeraz II'nin duraklaması ve geriye kayması (backtracking).
Kalıp diziye uygun olmayan bir nükleotid eklenmesi baz eşleşmesini bozar ve enzimin ilerlemesini engeller.
2
Düzeltme faktörünün katılımı
TFIIS faktörünün RNA polimeraz II kompleksine bağlanması.
Duraklayan kompleksin tekrar aktif hale gelmesi için dışsal bir uyarıcıya ihtiyaç duyulur.
3
Hidrolitik aktivitenin uyarılması
Hatalı RNA ucunun RNA polimeraz II'nin içsel nükleaz aktivitesiyle kesilmesi.
TFIIS, polimerazın aktif bölgesini modifiye ederek hidrolitik bir enzim gibi davranmasını sağlar.
4
Transkripsiyonun yeniden başlatılması
Serbest kalan 3'-OH ucundan doğru sentezin devam etmesi.
Hatalı segment uzaklaştırıldıktan sonra aktif bölge tekrar kalıp diziyle uyumlu hale gelir.

Anahtar Kavram

RNA Polimeraz II Hata Düzeltme (Proofreading) ve TFIIS

İpuçları

1
Bu faktör transkripsiyonun 'elongasyon' (uzama) fazında, özellikle enzim durakladığında devreye girer.
2
RNA polimeraz II'nin kendi nükleaz aktivitesini stimüle eden bir uyarıcı protein arıyoruz.
3
İsmi 'Transcription Factor II Stimulatory' kelimelerinden türetilmiştir ve backtracking sürecinin anahtarıdır.

Daha Fazla Pratik

TFIIH'nin helikaz ve kinaz aktivitelerinin transkripsiyon ve DNA tamiri (NER) arasındaki bağlantısını inceleyiniz.
Tahmini Süre:1m 40s
Bu soruyu puanla