Soru

Zorluk: ZorRNA Sentezi (Transkripsiyon)

Ökaryotik hücrelerde RNARNA polimeraz IIII tarafından gerçekleştirilen transkripsiyon sürecinde, enzimin promotörden uzaklaşıp üretken uzama (productiveproductive elongationelongation) fazına geçişi sıkı bir şekilde düzenlenir. Transkripsiyonun başlatılmasından kısa bir süre sonra (206020-60 nükleotid), enzimin duraksamasına (promoterproximalpromoter-proximal pausingpausing) neden olan NELFNELF ve DSIFDSIF gibi faktörlerin inhibisyonunu kaldırarak transkripsiyonun devam etmesini sağlayan, RNARNA polimeraz IIII’nin karboksi terminal ucunu (CTDCTD) Serin2Serin-2 pozisyonundan fosforilleyen temel protein kompleksi aşağıdakilerden hangisidir?

  1. PTEFbP-TEFb kompleksiCevap
  2. B
    TFIIHTFIIH kompleksi
  3. C
    TFIIDTFIID kompleksi
  4. D
    FACTFACT kompleksi
  5. E
    TFIISTFIIS faktörü

Cevap

Ökaryotik transkripsiyonda duraksamayı (pausingpausing) çözen ve üretken uzamayı başlatan temel kompleks PTEFbP-TEFb (PositivePositive TranscriptionTranscription ElongationElongation FactorFactor bb)'dir.
Transkripsiyonun başlatılmasından sonra RNARNA polimeraz IIII, NELFNELF ve DSIFDSIF etkisiyle duraksar. PTEFbP-TEFb kompleksi (Cdk9Cdk9 kinaz birimi aracılığıyla), bu negatif faktörleri fosforilleyerek NELFNELF'i polimerazdan uzaklaştırır ve DSIFDSIF'i pozitif bir uzama faktörüne dönüştürür. Aynı zamanda RNARNA polimerazın CTDCTD kuyruğundaki Ser2Ser-2 kalıntılarını fosforilleyerek üretken uzama fazına geçişi sağlar.

Adım Adım Çözüm

1
Transkripsiyon evresinin belirlenmesi
Soru, başlatmadan hemen sonraki (206020-60 nükleotid) duraksama (pausingpausing) evresine odaklanmaktadır.
Bu evre, transkripsiyonun en kritik düzenleme basamaklarından biridir.
2
Düzenleyici proteinlerin analizi
Duraksamaya NELFNELF (NegativeNegative ElongationElongation FactorFactor) ve DSIFDSIF (DRBDRB SensitivitySensitivity InducingInducing FactorFactor) neden olur.
Bu proteinler polimerazın ilerlemesini fiziksel olarak engeller.
3
Enzim fosforilasyon paterninin incelenmesi
RNARNA polimeraz IIII’nin CTDCTD (CarboxyTerminalCarboxy-Terminal DomainDomain) bölgesinde Serin2Serin-2 fosforilasyonu üretken uzama için şarttır.
Serin5Serin-5 başlatma için, Serin2Serin-2 ise uzama ve mRNAmRNA işlenmesi için gereklidir.
4
Kinaz kompleksinin eşleştirilmesi
Cdk9Cdk9 ve SiklinSiklin TT birimlerinden oluşan PTEFbP-TEFb kompleksi bu işlemi gerçekleştirir.
PTEFbP-TEFb hem duraksama faktörlerini etkisiz hale getirir hem de polimerazı uzama moduna sokar.

Anahtar Kavram

Ökaryotik transkripsiyonel uzamanın regülasyonu ve P-TEFb kompleksinin rolü.

İpuçları

1
Bu protein kompleksi, Cdk9Cdk9 kinaz ve SiklinSiklin TT alt birimlerinden oluşur.
2
Transkripsiyonun duraksamasını (pausingpausing) çözmek için Serin2Serin-2 fosforilasyonu gereklidir.
3
HIVHIV virüsü, kendi genlerinin transkripsiyonunu artırmak için TatTat proteini aracılığıyla bu kompleksi doğrudan kullanır.

Daha Fazla Pratik

RNARNA polimeraz IIII'nin CTDCTD bölgesindeki Ser2Ser-2 ve Ser5Ser-5 fosforilasyonlarının mRNAmRNA işlenmesi (cappingcapping, splicingsplicing) üzerindeki etkilerini inceleyebilirsiniz.
Tahmini Süre:2m 0s
Bu soruyu puanla