Soru

Zorluk: Çok zorBakteri Genetiği

Bakterilerde çoklu antibiyotik direncinin yatay yayılımında kritik öneme sahip olan Tn3Tn3 ailesi kompleks transpozonların gerçekleştirdiği "replikatif transpozisyon" sürecinde, donör ve alıcı DNA molekülleri geçici olarak birleşerek "kointegrat" adı verilen bir ara yapı oluştururlar. Bu ara yapının site-spesifik rekombinasyon yoluyla çözülerek transpozisyonun tamamlanmasını ve her iki replikonda da transpozonun birer kopyasının bulunmasını sağlayan protein ve tanıma dizisi aşağıdakilerden hangisidir?

  1. Rezolvaz - resres bölgesiCevap
  2. B
    Transpozaz - IRIR (Inverted Repeat) dizileri
  3. C
    İntegraz - attIattI bölgesi
  4. D
    RecARecA proteini - Homolog diziler
  5. E
    Relaksaz - oriToriT bölgesi

Cevap

Rezolvaz enziminin transpozon üzerindeki resres bölgesine etki ederek kointegrat yapısını çözmesi
Replikatif transpozisyon (Sınıf II transpozonlar, örn. Tn3Tn3) sırasında, donör DNA molekülü ile hedef DNA molekülü, her biri transpozonun bir kopyasını içeren bir 'kointegrat' yapısı oluşturmak üzere birleşir. Bu yapının çözülmesi (resolution), transpozon tarafından kodlanan rezolvaz enzimi (TnpR) tarafından gerçekleştirilir. Rezolvaz, transpozonun içindeki spesifik resres (resolution) bölgelerini tanır ve bu bölgeler arasında site-spesifik rekombinasyon yaparak iki bağımsız DNA molekülünün (her biri transpozon kopyasına sahip) oluşmasını sağlar.

Adım Adım Çözüm

1
Transpozisyon tipinin belirlenmesi
Replikatif transpozisyon (örn. Tn3Tn3)
Soruda belirtilen kointegrat (birleşik DNA) yapısı replikatif transpozisyonun karakteristik özelliğidir.
2
Kointegrat yapısının analizi
Donör ve hedef DNA'nın birleşmiş, iki kopya transpozon içeren hali
Transpozaz tarafından başlatılan süreçte DNA'lar birleşir ancak sürecin tamamlanması için bu yapının ayrılması gerekir.
3
Çözülme (Resolution) mekanizmasının tespiti
Site-spesifik rekombinasyon
Kointegratın çözülmesi, transpozon üzerindeki spesifik bölgeler arasında gerçekleşen bir rekombinasyon olayıdır.
4
Doğru enzim ve bölge eşleştirmesi
Rezolvaz - resres bölgesi
Tn3Tn3 transpozonu kendi rezolvazını (TnpRTnpR) kodlar ve bu enzim resres dizisinde etki gösterir.

Anahtar Kavram

Replikatif transpozisyonda kointegrat çözülmesi (Resolution of cointegrate)
Bu soruyu puanla