Soru

Zorluk: Çok zorBakteri Genetiği

Klinik izolatlarda çoklu antibiyotik direncinin yatay transferinde ve gen kasetlerinin bir araya getirilmesinde kritik rol oynayan 'Sınıf 1 integron' (Class 1 integron) yapıları incelendiğinde; gen kasetlerinin proksimalinde yer alan 5' korunmuş segment (5'-CS) ile distalinde yer alan 3' korunmuş segment (3'-CS) arasında belirgin fonksiyonel farklar olduğu görülür. Buna göre, tipik bir Sınıf 1 integronun 3' korunmuş segmentinde (3'-CS) aşağıdakilerden hangisinin bulunması beklenir?

  1. A
    Gen kasetlerinin site-spesifik rekombinasyonunu katalizleyen integras (intI1intI1) geni
  2. Sülfonamid grubu antibiyotiklere dirençten sorumlu olan sul1sul1 geniCevap
  3. C
    Gen kasetlerinin entegrasyonu için hedef bölge olan attIattI dizisi
  4. D
    Promotör içermeyen gen kasetlerinin ekspresyonunu sağlayan ortak PcP_c promotörü
  5. E
    Replikatif transpozisyonu sağlayan ve kointegrat yapısını çözen rezolvaz (tnpRtnpR) geni

Cevap

Sınıf 1 integronların 3' korunmuş segmentinde (3'-CS) sülfonamid direncini kodlayan sul1sul1 geni bulunur.
Sınıf 1 integronlar, genetik yapısı itibariyle üç ana kısımdan oluşur. En başta (5' ucu) bulunan 5'-CS, sistemin çalışması için gerekli olan integras enzimini (intI1intI1), kasetlerin bağlanma bölgesini (attIattI) ve kasetlerin okunmasını sağlayan ortak promotörü (PcP_c) içerir. Gen kasetleri bu bölgeye eklenir. Yapının sonunda bulunan 3'-CS ise klinik izolatların çoğunda korunmuş haldedir ve dezenfektan direncinden sorumlu qacEΔ1qacE\Delta1 ile sülfonamid direncinden sorumlu sul1sul1 genlerini barındırır. Bu nedenle sülfonamid direnç geninin bulunması beklenen bir özelliktir.

Adım Adım Çözüm

1
İntegron yapısının bölümlerini tanımla
İntegronlar; 5' korunmuş segment (5'-CS), gen kasetlerinin bulunduğu değişken bölge ve 3' korunmuş segmentten (3'-CS) oluşur.
Genetik elemanların lokasyonunu belirlemek için temel yapısal bilgi gereklidir.
2
5'-CS bileşenlerini hatırla
5'-CS bölgesinde intIintI (integraz), PcP_c (ortak promotör) ve attIattI (entegrasyon bölgesi) bulunur.
Seçeneklerdeki 5' bileşenlerini elemek için gereklidir.
3
3'-CS bileşenlerini belirle
Klinik Sınıf 1 integronlarda 3'-CS bölgesinde qacEΔ1qacE\Delta1 ve sul1sul1 genleri yer alır.
Doğru yanıt olan sülfonamid direnç geninin (sul1sul1) konumunu doğrular.

Anahtar Kavram

İntegronlar, promotörü olmayan gen kasetlerini yakalayıp eksprese edebilen genetik platformlardır; Sınıf 1 integronlar klinik dirençte en yaygın olan tip olup 3' ucunda sülfonamid direnç geni taşırlar.
Bu soruyu puanla