Examkin

Soru

Zorluk: ZorKoenzimler ve Kofaktörler

Enzimlerin biyolojik aktivitelerini sürdürebilmeleri için protein dışı bir bileşen olan kofaktöre ihtiyaç duymaları durumunda oluşan yapıya holoenzim denir. Bu yardımcı moleküller, enzime bağlanma kuvvetlerine ve reaksiyon döngüsündeki davranışlarına göre; apoenzime kovalent veya çok sıkı bağlanan "prostetik gruplar" ile reaksiyon sırasında enzime geçici olarak bağlanıp ayrılan "ko-substratlar" olarak iki temel grupta değerlendirilir. Buna göre, aşağıdaki enzim ve yardımcı molekül eşleştirmelerinden hangisinde kofaktör/koenzim, reaksiyon döngüsüne geçici olarak katılan ve yapıdan ayrılabilen bir "ko-substrat" özelliği gösterir?

  1. A
    Süksinat dehidrogenaz - FADFAD
  2. B
    Karbonik anhidraz - Zn2+Zn^{2+}
  3. C
    Piruvat karboksilaz - Biotin
  4. D
    Alanin aminotransferaz - Piridoksal fosfat (PLPPLP)
  5. Hekzokinaz - Mg2+Mg^{2+}Cevap

Cevap

Hekzokinaz ve Mg2+Mg^{2+} eşleşmesi, metal iyonunun enzime zayıf ve geçici bağlanması nedeniyle bir ko-substrat (veya metalle aktive olan enzim) örneğidir.
Hekzokinaz ve diğer kinazlar, metal iyonuna (genellikle Mg2+Mg^{2+}) zayıf ve geçici olarak ihtiyaç duyarlar. Bu tür enzimlere 'metalle aktive olan enzimler' denir ve metal iyonu reaksiyon sırasında yapıya girip çıktığı için fonksiyonel olarak bir ko-substrat gibi davranır.

Adım Adım Çözüm

1
Yardımcı moleküllerin bağlanma türlerini sınıflandır.
Prostetik gruplar (sıkı/kovalent) ve ko-substratlar (geçici/zayıf) olarak iki ana grup belirlenir.
Sorunun kökünde istenen ayrımı yapabilmek için temel biyokimyasal sınıflama gereklidir.
2
Seçeneklerdeki enzim-kofaktör ilişkilerini analiz et.
FADFAD (Süksinat dehidrogenazda), Biotin, PLPPLP ve metalloenzimlerdeki Zn2+Zn^{2+} sıkı bağlıdır; ancak kinazlardaki Mg2+Mg^{2+} geçicidir.
Her bir enzimin katalitik mekanizmasındaki kofaktör bağımlılığını belirlemek gerekir.
3
Ko-substrat özelliğini karşılayan seçeneği belirle.
Hekzokinazda Mg2+Mg^{2+} iyonu, ATPATP üzerindeki negatif yükleri maskelemek ve katalizi kolaylaştırmak için geçici olarak bağlanır.
Mg2+Mg^{2+} reaksiyon sonunda ürünle birlikte ayrıldığı için bir ko-substrat/metal aktivatör karakteri taşır.

Anahtar Kavram

Enzim kofaktörlerinin bağlanma kuvveti; prostetik gruplar (kalıcı) ve ko-substratlar (geçici) arasındaki fark.
Bu soruyu puanla

Konular

Koenzimler ve Kofaktörler

Bu konudan daha fazla soru