Examkin

Soru

Zorluk: Çok zorPirimidin Yıkımı

Pirimidin nükleotidlerinin katabolizması; pürin yıkımının aksine halka yapısının açılması ve suda çözünürlüğü yüksek, trikarboksilik asit (TCA) döngüsüne girebilen son ürünlerin oluşumu ile karakterize bir süreçtir. İnsan metabolizmasında gerçekleşen pirimidin yıkım yolu ve bu yoldaki enzimlerin özellikleri dikkate alındığında, aşağıdakilerden hangisi yanlıştır?

  1. A
    Timin yıkımı sonucunda oluşan β\beta-aminoizobütirat, metilmalonat semialdehit ve metilmalonil-CoA üzerinden süksinil-CoA'ya dönüştürülerek metabolize edilir.
  2. Pirimidin yıkım hızını belirleyen ilk basamakta görev alan dihidropirimidin dehidrogenaz (DPD) enzimi, indirgeyici kofaktör olarak NADHNADH kullanır.Cevap
  3. C
    β\beta-üreidopropionaz enzimi tarafından gerçekleştirilen son basamakta açığa çıkan serbest CO2CO_2, pirimidin halkasının sentezi sırasında karbamoil fosfattan gelen C−2C-2 atomudur.
  4. D
    Dihidropirimidinaz enzimi, çinko içeren bir metaloenzim olup pirimidin halkasını su girişiyle hidrolitik olarak açarak ilgili NN-karbamoil türevlerini oluşturur.

Cevap

Dihidropirimidin dehidrogenaz (DPD) enziminin indirgeyici kofaktör olarak NADH değil, NADPH kullanması gerektiğini belirten seçenek yanlıştır.
Dihidropirimidin dehidrogenaz (DPD) enzimi, pirimidin katabolizmasının ilk ve hız kısıtlayıcı basamağını katalizler. Bu enzim, nükleobaz halkasındaki 5-6 çift bağını doyurmak için indirgeyici güç olarak NADPH kullanır. Seçenekte belirtilen NADH kullanımı bu nedenle biyokimyasal olarak hatalıdır.

Adım Adım Çözüm

1
Pirimidin yıkımının hız kısıtlayıcı basamağını belirle.
Dihidropirimidin dehidrogenaz (DPD) enzimi, urasil ve timin halkasındaki 5-6 çift bağını doyurur.
Bu basamak katabolizmanın ilk ve en önemli düzenleyici basamağıdır.
2
DPD enziminin kofaktör gereksinimini analiz et.
DPD enzimi indirgeyici güç olarak NADPH kullanır.
Biyokimyasal katabolik yolların aksine, bu spesifik basamak indirgeyici bir süreçtir ve NADPH bağımlıdır.
3
Halka açılması ve son ürünlerin oluşumunu değerlendir.
Dihidropirimidinaz halkayı açar, β\beta-üreidopropionaz ise CO2CO_2 (C-2'den) ve NH3NH_3 (N-3'ten) çıkararak β\beta-amino asitleri oluşturur.
Halka yapısının tamamen yıkılması suda çözünürlüğü sağlar.
4
Son ürünlerin TCA döngüsüne giriş noktalarını karşılaştır.
Urasil →\rightarrow Asetil-CoA; Timin →\rightarrow Süksinil-CoA.
Timin yapısındaki metil grubu, onun propionil-CoA/metilmalonil-CoA yolu üzerinden süksinil-CoA'ya girmesine neden olur.

Anahtar Kavram

Pirimidin katabolizması karaciğerde gerçekleşir, hız kısıtlayıcı basamağı NADPH bağımlı DPD'dir ve son ürünleri suda çözünür olan β\beta-alanin ile β\beta-aminoizobütirattır.

İpuçları

1
Pirimidin yıkımı, pürin yıkımının aksine 'indirgeyici' bir basamakla (halkayı doyurma) başlar.
2
Biyosentez yollarında olduğu gibi, bu katabolik yoldaki indirgenme basamağı da NADPH'a ihtiyaç duyar.
3
Hız kısıtlayıcı enzim olan DPD, elektron donörü olarak hücrenin temel indirgeyici gücü olan NADPH'ı tercih eder.

Daha Fazla Pratik

Pirimidin yıkım ürünlerinden olan β\beta-alaninin karnozin sentezindeki rolünü ve DPD eksikliğinin 5-fluorourasil toksisitesi ile ilişkisini inceleyebilirsiniz.
Tahmini Süre:2m 30s
Bu soruyu puanla

Konular

Pirimidin Yıkımı

Bu konudan daha fazla soru