Examkin

Soru

Zorluk: ZorGenel Viroloji

Segmentli, çift iplikli RNA (dsRNAdsRNA) genomuna sahip, ikozahedral simetrili ve zarfsız bir virüsün replikasyon stratejisi incelendiğinde; viral mRNA sentezi ve genom replikasyonu süreçleri ile ilgili aşağıdaki ifadelerden hangisi doğrudur?

  1. Virion yapısında paketlenmiş halde bulunan RNA bağımlı RNA polimeraz (RdRp) enzimi, çift iplikli genomun negatif ipliklerini kalıp kullanarak pozitif polariteli mRNA'ları sentezler.Cevap
  2. B
    Transkripsiyonun başlaması için viral nükleokapsidin tamamen soyularak (uncoatinguncoating) genomun sitoplazmaya serbest bırakılması zorunludur.
  3. C
    Viral replikasyon döngüsü sırasında sentezlenen mRNA'lar, çekirdeğe taşınarak konak hücrenin 'splicing' mekanizmasıyla modifiye edildikten sonra sitoplazmaya döner.
  4. D
    Pozitif polariteli genom iplikleri, nükleokapsid proteinlerinden ayrıldıktan sonra doğrudan ribozomlara bağlanarak translasyonu başlatır.
  5. E
    Viral genom, konak hücre sitoplazmasında bulunan revers transkriptaz enzimi tarafından önce DNA'ya kopyalanarak replike edilir.

Cevap

Virion içerisinde hazır bulunan RNA bağımlı RNA polimeraz (RdRp) enziminin, çift iplikli RNA'nın negatif ipliklerini kalıp alarak pozitif polariteli mRNA'ları sentezlemesi
Çift iplikli RNA (dsRNAdsRNA) genomuna sahip virüsler (örneğin Reoviridae/Rotavirüs), hücrenin translasyon mekanizması dsRNA'yı okuyamadığı ve hücrede RdRp bulunmadığı için, virion içinde kendi RdRp enzimlerini taşımak zorundadırlar. Bu enzim, nükleokapsit çekirdeği (corecore) içinde negatif iplikleri kalıp kullanarak mRNA sentezler ve bu mRNA'lar çekirdekteki gözeneklerden sitoplazmaya salınarak transle edilir.

Adım Adım Çözüm

1
Virüsün genomik yapısını analiz edin.
Virüs dsRNAdsRNA genomuna sahiptir. Hücrelerin bu genom tipini protein sentezi için doğrudan kullanma veya replike etme yeteneği yoktur.
Ökaryotik hücrelerde RNA bağımlı RNA polimeraz (RdRpRdRp) enzimi bulunmaz.
2
Enzim gereksinimini değerlendirin.
Virüs, transkripsiyonu başlatabilmek için RdRpRdRp enzimini virion yapısında (yapısal protein olarak) taşımak zorundadır.
Negatif polariteli RNA veya çift iplikli RNA virüsleri için bu enzim 'infectious genome' özelliğini ortadan kaldıran zorunlu bir bileşendir.
3
Soyulma (uncoatinguncoating) ve korunma mekanizmasını inceleyin.
Reovirüsler tamamen soyulmazlar (kısmi soyulma); dsRNAdsRNA genomu nükleokapsit çekirdeği içinde kalır.
Sitoplazmaya serbest bırakılan dsRNAdsRNA, PKRPKR (protein  kinase  R) ve TLR3TLR3 gibi antiviral yanıtları tetikleyerek replikasyonu durdurabilir.

Anahtar Kavram

dsRNA virüslerinde (Reoviridae) kısmi soyulma ve zorunlu virion RdRp kullanımı.
Bu soruyu puanla

Konular

Genel Viroloji

Bu konudan daha fazla soru