Soru

Zorluk: Çok zorEnzimlerin Yapısal Özellikleri ve Sınıflandırma

Enzimlerin yapısal organizasyonunda, katalitik aktivite için gerekli olan ve apoenzime kovalent veya koordinasyon bağlarıyla çok sıkı bir şekilde bağlanan protein dışı bileşenlere 'prostetik grup' adı verilir. Bazı enzimler, karmaşık reaksiyon mekanizmaları nedeniyle birden fazla tipte prostetik grubu aynı polipeptit zinciri üzerinde barındıran kompleks bir holoenzim yapısı sergiler.

Pürin katabolizmasında hipoksantin ve ksantinin oksidasyonunu katalizleyerek ürik asit oluşumunu sağlayan; yapısında prostetik grup olarak Molibden (Mo) içeren bir pterin kofaktörü (molibdopterin), iki adet [2Fe-2S] merkezi ve bir adet FAD molekülünü bir arada bulunduran, IUBMB (International Union of Biochemistry and Molecular Biology) sınıflandırmasına göre 'Oksidoredüktaz' (EC 1) sınıfında yer alan enzim aşağıdakilerden hangisidir?

  1. Ksantin oksidazCevap
  2. B
    Guanaz (Guanin deaminaz)
  3. C
    Hipoksantin-guanin fosforiboziltransferaz (HGPRT)
  4. D
    Adenozin deaminaz (ADA)
  5. E
    AMP deaminaz

Cevap

Pürin metabolizmasında hipoksantin ve ksantini okside ederek ürik asit oluşturan, yapısında Molibden (Mo), Fe-S merkezleri ve FAD bulunduran EC 1 sınıfı enzim Ksantin Oksidazdır.
Ksantin oksidaz enzimi, pürin katabolizmasının son basamaklarını katalizleyen bir oksidoredüktazdır. Yapısında molibdopterin (molibden içeren organik kofaktör), iki adet [2Fe-2S] kümesi ve bir adet FAD molekülü bulunur. Bu bileşenler enzimin apoenzim kısmına sıkıca bağlıdır ve elektronların substrattan terminal elektron alıcısına iletilmesini sağlayan bir internal zincir oluştururlar. Bu yapısal ve fonksiyonel özellikleri nedeniyle EC 1 sınıfında yer alır.

Adım Adım Çözüm

1
Enzimin katalizlediği reaksiyon tipini belirle.
Hipoksantin → Ksantin → Ürik asit dönüşümü bir oksidasyon reaksiyonudur, dolayısıyla enzim bir Oksidoredüktazdır (EC 1).
Sınıflandırma, reaksiyonun doğasına (elektron transferi) dayanır.
2
Yapısal bileşenleri analiz et.
Molibden (Mo), flavin (FAD) ve demir-kükürt (Fe-S) merkezlerinin varlığı tespit edildi.
Bu kombinasyon, elektronların substrattan oksijene veya NAD+'ye aktarılmasını sağlayan kompleks bir taşıma zinciri oluşturur.
3
Spesifik enzim ismini doğrula.
Ksantin oksidaz (veya dehidrogenaz formu), insan vücudunda molibden gerektiren az sayıdaki enzimden biridir.
Diğer pürin metabolizması enzimleri (ADA, Guanaz) genellikle hidrolaz sınıfındadır ve bu metal komplekslerini içermezler.

Anahtar Kavram

Ksantin oksidaz, pürin yıkımının hız kısıtlayıcı basamağında görev alan, yapısında Mo, Fe-S ve FAD bulunduran kompleks bir metalloflavoproteindir.
Bu soruyu puanla