Hücre içerisinde yeni sentezlenen polipeptid zincirlerinin agregasyonunu (çökelmesini) önl… — TUS - Tıpta Uzmanlık Sınavı

Hücre içerisinde yeni sentezlenen polipeptid zincirlerinin agregasyonunu (çökelmesini) önlemek ve uygun konformasyona katlanmalarına yardımcı olmak amacıyla görev yapan $Hsp70$ ( $DnaK$ ) şaperon sisteminin moleküler çalışma mekanizması ile ilgili aşağıdaki ifadelerden hangisi doğrudur?

$ATP$ hidrolizi, şaperonun substrat bağlama bölgesinde konformasyonel bir kapanmaya yol açarak polipeptid zincirine olan afiniteyi artırır.Cevap
B
$Hsp70$ proteininin $ATP$ bağlı formu, polipeptid zincirindeki hidrofobik bölgelere en yüksek afinite ile bağlanarak kompleksi stabilize eder.
C
$DnaJ$ ( $Hsp40$ ) ko-şaperonu, $Hsp70$ üzerindeki $ADP$ 'nin $ATP$ ile yer değiştirmesini sağlayarak polipeptidin şaperondan ayrılmasını katalizler.
D
Şaperonlar, proteinin katlanma hunisindeki serbest enerji düzeyini ( $G$ ) yükselterek kinetik tuzakların daha kolay aşılmasını sağlar.
E
Nükleotid değişim faktörleri ( $NEF$ ), şaperona yeni bir $ADP$ molekülü bağlayarak substratın kalıcı olarak hapsedilmesini sağlar.

Cevap

ATP hidrolizi, şaperonun konformasyonel bir değişikliğe uğrayarak polipeptid zincirine olan bağlama gücünü (afinitesini) artırması doğru mekanizmadır.

Doğru ifadeye göre,

Hsp70

şaperonunun nükleotid bağlama bölgesinde gerçekleşen

ATP

hidrolizi, proteinin 'kapak' bölgesinde konformasyonel bir değişikliğe yol açar. Bu değişim, polipeptid zincirindeki hidrofobik bölgelerin şaperon tarafından daha sıkı bir şekilde tutulmasını (yüksek afinite) sağlar. Bu süreç, proteinin yanlış katlanmasını veya diğer proteinlerle kümeleşmesini önlemek için kritiktir.

Adım Adım Çözüm

Hsp70

şaperonunun nükleotid bağlama durumlarını analiz et.

ATP

bağlı formun 'açık' (düşük afinite),

ADP

bağlı formun 'kapalı' (yüksek afinite) konformasyonda olduğu belirlenir.

Şaperonun polipeptidi yakalaması ve bırakması bu nükleotid döngüsüne bağlıdır.

ATP

hidrolizinin etkisini değerlendir.

ATP

'nin

ADP

'ye dönüşmesiyle şaperonun helikal kapak (lid) bölgesi kapanır.

Hidroliz, polipeptid zincirinin şaperon içinde hapsedilmesini sağlar.

Ko-şaperonların (

Hsp40

NEF

) rollerini netleştir.

Hsp40

(

DnaJ

) hidrolizi tetiklerken,

NEF

(

GrpE

) döngüyü tamamlamak için

ADP

çıkışını sağlar.

Bu proteinler döngünün hızını ve yönünü kontrol eder.

Anahtar Kavram

Hsp70 şaperon sistemi, ATP hidrolizi ile yüksek afiniteli (kapalı) konformasyona geçerek protein katlanmasını düzenler.

Soru

Cevap

Adım Adım Çözüm

Anahtar Kavram

Sık Yapılan Hatalar

Konular

Bu konudan daha fazla soru