Soru

Zorluk: ZorEnzimlerin Yapısal Özellikleri ve Sınıflandırma

Glikojen yıkımında anahtar rol oynayan glikojen fosforilaz enzimi; glikojen zincirindeki α(1→4)\alpha(1\rightarrow4) bağlarını koparırken su yerine inorganik fosfat (PiP_i) kullanır ve kofaktör olarak piridoksal fosfata (PLPPLP) ihtiyaç duyar. IUBMB (International Union of Biochemistry and Molecular Biology) sınıflandırması ve enzimin yapısal özellikleri dikkate alındığında, bu enzimle ilgili aşağıdakilerden hangisi doğrudur?

  1. Glikojen zincirinden bir glukozil ünitesini inorganik fosfata transfer ederek bağ kopardığı için 'Transferaz' (EC 2) sınıfında yer alır.Cevap
  2. B
    Bağ koparımı sırasında su yerine fosfat kullanmasına rağmen, büyük bir molekülden bir parçayı ayırdığı için 'Hidrolaz' (EC 3) sınıfına dahil edilir.
  3. C
    Yapısındaki piridoksal fosfat (PLPPLP), reaksiyon döngüsü sonunda enzimden serbest halde ayrılan bir 'koenzim'dir.
  4. D
    Glikoz birimleri arasında yeni bir bağ oluştururken ATPATP hidrolizinden sağlanan enerjiyi kullandığı için 'Ligaz' (EC 6) sınıfında sınıflandırılır.
  5. E
    Glukoz-1-fosfat molekülünü glukoz-6-fosfata çevirerek molekül içi yer değişikliği yaptığı için 'İzomeraz' (EC 5) sınıfında yer alır.

Cevap

Glikojen fosforilaz, glikojen zincirinden bir glukozil ünitesini inorganik fosfata transfer ederek bağ kopardığı için 'Transferaz' (EC 2) sınıfında yer alır.
Glikojen fosforilaz, glikojen zincirindeki glukozil birimlerini inorganik fosfata transfer ederek glukoz-1-fosfat açığa çıkarır. IUBMB sisteminde grup transferi yapan enzimler 'Transferaz' (EC 2) olarak sınıflandırılır. Ayrıca bu enzimin aktivitesi için elzem olan piridoksal fosfat (PLPPLP), enzimin protein kısmına kovalent olarak bağlı olduğu için bir 'prostetik grup' niteliğindedir.

Adım Adım Çözüm

1
Enzimin kullandığı substratları ve reaksiyon tipini analiz etmek.
Glikojen ve inorganik fosfat (PiP_i) kullanılarak glukoz-1-fosfat oluşur.
Reaksiyonun bir fosforoliz (fosfatla parçalanma) olduğu belirlenir.
2
Reaksiyonun IUBMB sınıflandırma kriterlerine göre eşleştirilmesi.
Bir glukozil grubunun transferi söz konusu olduğu için EC 2 (Transferaz) sınıfına girer.
Hidroliz (EC 3) su gerektirir, oysa burada fosfat transferi vardır.
3
Kofaktör olan piridoksal fosfatın (PLPPLP) bağlanma durumunu değerlendirmek.
PLPPLP, enzimdeki bir lizin kalıntısına kovalent olarak bağlıdır.
Sıkı ve kovalent bağlı yardımcı gruplar 'prostetik grup' olarak tanımlanır.

Anahtar Kavram

Glikojen fosforilaz, fosforoliz yoluyla bağ kopardığı için bir 'Transferaz'dır ve PLPPLP bu enzimde bir 'Prostetik Grup'tur.

Daha Fazla Pratik

İzomeraz sınıfına giren 'fosfoglukomutaz' ve hidrolaz sınıfına giren 'glukoz-6-fosfataz' enzimlerinin reaksiyon mekanizmalarını karşılaştırınız.
Tahmini Süre:1m 30s
Bu soruyu puanla