Examkin

Soru

Zorluk: OrtaRNA Sentezi (Transkripsiyon)

Prokaryotik hücrelerde transkripsiyonun sonlandırılması (terminasyon) sürecinde, yardımcı bir protein faktörüne (Rho gibi) ihtiyaç duymadan gerçekleşen "içsel sonlanma" (intrinsic termination) mekanizması için aşağıdakilerden hangisi karakteristiktir?

  1. Sentezlenen RNA üzerinde stabil bir G−CG-C zengin saç tokası (hairpin) yapısı ve ardından gelen urasilden zengin bir diziCevap
  2. B
    RNA üzerindeki UAAUAA, UAGUAG veya UGAUGA gibi durdurma kodonlarının tanınarak transkripsiyonun sonlandırılması
  3. C
    RNA polimerazın sentezlediği yeni nükleotid zincirini 3′→5′3' \rightarrow 5' yönünde uzatmasıyla oluşan sterik engel
  4. D
    RNA sentezinin başlatılması için kullanılan kısa RNA primer dizisinin tükenmesiyle polimerizasyonun durması

Cevap

İçsel sonlanma mekanizması, sentezlenen RNA üzerinde oluşan G-C zengin bir saç tokası yapısı ve bunu takip eden urasil dizisi ile karakterize edilir.
İçsel sonlanma (intrinsic termination) mekanizmasında, sentezlenen RNA üzerinde palindromik diziler sayesinde oluşan G−CG-C zengin 'saç tokası' yapısı RNA polimerazın duraklamasına neden olur. Bu yapının hemen ardından gelen urasil dizisi, DNA kalıbındaki adeninlerle zayıf A−UA-U etkileşimi kurduğu için RNA zinciri kalıptan kolayca ayrılır ve süreç sonlanır.

Adım Adım Çözüm

1
Sonlanma dizisinin transkripsiyonunu inceleyin.
RNA polimeraz, DNA üzerindeki palindromik diziyi okuyarak RNA'ya aktarır.
Saç tokası yapısının oluşması için RNA üzerindeki dizilerin kendi aralarında eşleşebilmesi gerekir.
2
Saç tokası (hairpin) yapısının etkisini değerlendirin.
G−CG-C baz çiftlerinden zengin bu yapı, RNA polimerazın DNA üzerindeki ilerleyişini fiziksel olarak durdurur.
G−CG-C arasındaki üçlü hidrojen bağları yapıyı oldukça stabil kılar ve enzimi yavaşlatır.
3
Poli-U dizisinin rolünü analiz edin.
RNA üzerindeki urasil (U) dizisi, DNA kalıbındaki adeninlerle (A) zayıf ikili hidrojen bağları kurar.
Zayıf A−UA-U bağları, RNA-DNA hibritinin kolayca çözülmesini ve RNA'nın kompleksten ayrılmasını sağlar.

Anahtar Kavram

Prokaryotik transkripsiyonda içsel sonlanma (Rho-bağımsız), RNA'nın ikincil yapısı ve baz eşleşme kuvvetindeki farklılıklara dayanır.

İpuçları

1
Bu mekanizma, RNA polimerazın hızını kesen fiziksel bir engel ve ardından gelen zayıf bir tutunma bölgesine dayanır.
2
RNA üzerindeki hangi baz eşleşmesi (G-C mi yoksa A-U mu) daha stabil bir yapı oluşturarak enzimi durdurabilir?
3
Sonlanma için RNA üzerinde bir 'saç tokası' yapısı oluşmalı ve ardından gelen bağların kopması kolay olmalıdır (poli-U dizisi gibi).

Daha Fazla Pratik

Ökaryotlardaki RNA polimeraz II sonlanma mekanizması (poliadenilasyon sinyali) ile karşılaştırma yapabilirsiniz.
Tahmini Süre:1m 15s
Bu soruyu puanla

Konular

RNA Sentezi (Transkripsiyon)

Bu konudan daha fazla soru