Soru

Zorluk: OrtaRNA Sentezi (Transkripsiyon)

Prokaryotik ve ökaryotik transkripsiyon süreçleri arasındaki farklar ve ortak özellikler göz önüne alındığında, RNA sentezinin mekanizması ve inhibisyonu ile ilgili aşağıdaki ifadelerden hangisi doğrudur?

  1. Prokaryotik promotörlerde bulunan 10-10 dizisi (Pribnow box), ökaryotik promotörlerdeki TATA kutusunun fonksiyonel bir benzeridir.Cevap
  2. B
    Rifampisin, ökaryotik RNA polimeraz II enziminin transkripsiyonu başlatmasını engelleyerek etki gösteren bir antibiyotiktir.
  3. C
    RNA polimeraz enzimi, kalıp DNA zincirini 535' \rightarrow 3' yönünde okuyarak RNA zincirini sentezler.
  4. D
    Alfa-amanitin toksini, tüm RNA polimeraz tiplerini (I, II ve III) eşit düzeyde inhibe ederek mRNA, tRNA ve rRNA sentezini durdurur.
  5. E
    Aktinomisin D, yalnızca ökaryotik hücrelere özgü olan ve mRNA'nın nükleustan çıkışını engelleyen bir inhibitördür.

Cevap

Prokaryotik promotörlerde bulunan -10 dizisi (Pribnow box), ökaryotik promotörlerdeki TATA kutusunun fonksiyonel bir benzeridir.
Transkripsiyonun başlaması için RNA polimerazın bağlandığı özgül diziler (promotörler) evrimsel olarak korunmuştur. Prokaryotlardaki 10-10 bölgesi (Pribnow box) ile ökaryotlardaki TATA kutusu, DNA'nın kolayca açılmasını sağlayan (AT zengini) ve enzimi yönlendiren fonksiyonel analoglardır.

Adım Adım Çözüm

1
Promotör dizilerinin karşılaştırılması.
Prokaryotlarda -10 bölgesindeki Pribnow box (TATAAT) ile ökaryotlardaki TATA kutusunun (Hogness box) benzer işlev gördüğü belirlenir.
Her iki dizi de transkripsiyonun başlangıç noktasını belirleyen 'consensus' dizilerdir.
2
İnhibitör özgüllüğünün analizi.
Rifampisinin prokaryotlara özgü olduğu, Alfa-amanitinin ise ökaryotik polimerazlar arasında seçici davrandığı doğrulanır.
Klinik biyokimyada ilaçların ve toksinlerin hedef özgüllüğü ayırıcı tanıda önemlidir.
3
Sentez ve okuma yönünün kontrolü.
Sentezin 5' -> 3', okumanın ise 3' -> 5' olduğu kuralı hatırlanır.
Nükleik asit metabolizmasının temel termodinamiği bu yönelimi gerektirir.

Anahtar Kavram

Prokaryotik ve ökaryotik transkripsiyon promotörleri ve inhibitörlerinin karşılaştırmalı analizi.
Bu soruyu puanla