Examkin

Soru

Zorluk: ZorGenel Viroloji

Yeni izole edilen bir hayvan virüsünün replikasyon stratejisini ve yapısal özelliklerini belirlemek amacıyla yürütülen çalışmalarda şu bulgular saptanmıştır:

I. Virüsten saflaştırılan genomik nükleik asidin duyarlı konak hücrelere tek başına aktarılması (transfeksiyon) sonucunda yeni virionların üretilmediği görülmüştür.
II. Replikasyon döngüsünün en erken evresinde, viral bir enzim tarafından gerçekleştirilen ve hücresel transkripsiyon inhibitörlerinden etkilenmeyen bir RNA sentezinin gerçekleştiği izlenmiştir.
III. Virüs partiküllerinin eter ve kloroform gibi lipid çözücü maddelerle muamele edildikten sonra infektivitelerini tamamen kaybettiği belirlenmiştir.

Bu verilere dayanarak, söz konusu virüsün yapısal organizasyonu ile ilgili aşağıdaki ifadelerden hangisi doğrudur?

  1. A
    Nükleokapsidi ikozahedral simetri sergilemektedir.
  2. B
    Genomu çift iplikli RNA (dsRNAdsRNA) yapısındadır.
  3. Nükleokapsidi helikal simetri sergilemektedir.Cevap
  4. D
    Replikasyon döngüsünde DNA ara formu (intermediate) kullanmaktadır.
  5. E
    Genomu konak hücre ribozomları tarafından doğrudan mRNA olarak tanınmaktadır.

Cevap

Söz konusu virüsün nükleokapsidi helikal simetri sergilemektedir.
Verilen laboratuvar bulguları adım adım analiz edildiğinde; genomun transfeksiyon ile infeksiyon oluşturmaması (non-infeksiyöz) ve ilk sentez basamağının RNA bağımlı RNA sentezi olması, virüsün bir negatif polariteli tek iplikli RNA ((−)(-) ssRNA) veya çift iplikli RNA (dsRNAdsRNA) virüsü olduğunu gösterir. Lipid çözücülere (eter, kloroform) duyarlı olması ise virüsün zarflı bir yapıya sahip olduğunu kanıtlar. dsRNAdsRNA genomuna sahip hayvan virüsleri (Reoviridae) zarfsız olduğundan, bu virüs kesinlikle bir (−)(-) ssRNA virüsüdür. Tıbbi mikrobiyoloji prensiplerine göre, (−)(-) ssRNA genomuna sahip tüm hayvan virüsleri helikal simetri sergileyen nükleokapsid yapılarına sahiptir.

Adım Adım Çözüm

1
Genomun infeksiyözlük durumunu değerlendir.
Genom non-infeksiyözdür.
Transfeksiyon sonucunda yeni virüs oluşmaması, genomun doğrudan mRNA olarak işlev göremediğini veya replikasyon için virionda hazır enzim taşınması gerektiğini gösterir ((−)(-) ssRNA, dsRNAdsRNA veya Retrovirüs).
2
İlksel nükleik asit sentez basamağını analiz et.
RNA bağımlı RNA polimeraz (RdRp) aktivitesi mevcuttur.
İlk basamağın RNA sentezi olması ve bunun transkripsiyon inhibitörlerinden (Aktinomisin D gibi) etkilenmemesi, kalıp olarak genomik RNA'yı kullanan viral bir RdRp'nin varlığını kanıtlar. Bu durum Retrovirüsleri eler.
3
Lipid çözücü duyarlılığını yorumla.
Virüs zarflıdır.
Eter ve kloroform gibi maddeler lipid membran yapısını bozarak zarflı virüsleri inaktive eder. Bu durum dsRNAdsRNA genomlu (zarfsız olan) Reovirüsleri eler.
4
Elde edilen verileri birleştirerek yapısal özelliği belirle.
Zarflı (−)(-) ssRNA virüsü -> Helikal simetri.
Veriler birleştiğinde virüsün zarflı (−)(-) ssRNA olduğu anlaşılır. Hayvan virüsleri içinde tüm (−)(-) ssRNA virüsleri helikal simetriye sahiptir.

Anahtar Kavram

Negatif polariteli RNA virüslerinin replikasyon stratejisi ve yapısal simetri kuralları.
Bu soruyu puanla

Konular

Genel Viroloji

Bu konudan daha fazla soru