Soru

Zorluk: ZorRNA Sentezi (Transkripsiyon)

Ökaryotik hücrelerde RNARNA polimeraz IIIIII tarafından gerçekleştirilen transkripsiyon süreçleri ve bu enzimin promotör tanıma mekanizmaları ile ilgili aşağıdaki ifadelerden hangisi doğrudur?

  1. tRNAtRNA ve 5S5S rRNArRNA genlerinde promotör dizileri (KutuAKutu A ve KutuBKutu B gibi), tipik olarak transkripsiyon başlangıç noktasının mansabında (downstream) ve genin transkribe edilen bölgesi içinde yer alır.Cevap
  2. B
    Tüm ökaryotik RNARNA polimerazlar arasında α\alpha-amanitin inhibisyonuna karşı en yüksek duyarlılığı gösteren enzimdir.
  3. C
    Sentezlenen tRNAtRNA moleküllerinin 55' ucuna, transkripsiyonla eş zamanlı olarak 77-metilguanozin kep (cap) yapısı eklenmesi bu enzimin en karakteristik özelliğidir.
  4. D
    TATA-bağlayan protein (TBPTBP), sadece RNARNA polimeraz IIII bağımlı promotörlerin tanınmasında ve başlatma kompleksinin kurulmasında görev alan özgül bir faktördür.
  5. E
    Transkripsiyonun sonlanması için mutlaka özgül bir 'terminatör protein' (RhoRho faktörü benzeri) ile etkileşime girmesi ve GCG-C den zengin firkete yapısı oluşturması gerekir.

Cevap

tRNA ve 5S rRNA genlerinde promotör dizilerinin gen içinde (internal) yer alması
Doğru seçenek, RNARNA polimeraz IIIIII'ün en ayırıcı özelliklerinden birini ifade etmektedir. tRNAtRNA ve 5S5S rRNArRNA gibi küçük RNARNA genlerinin promotör dizileri (KutuAKutu A, KutuBKutu B veya CC), transkripsiyon başlangıç noktasının (+1+1) öncesinde değil, sentezlenen bölgenin içinde yer alır. Bu yapıya 'İç Kontrol Bölgesi' (ICRICR) denir.

Adım Adım Çözüm

1
Eukaryotik RNA polimeraz III'ün ürünlerini ve promotör yapılarını belirle.
RNA Pol III; tRNA, 5S rRNA ve bazı küçük nükleer RNA'ları sentezler. Promotörleri genellikle genin içindedir.
Pol III, diğer polimerazlardan farklı olarak 'internal control regions' (ICR) adı verilen gen içi dizileri tanır.
2
Enzimin inhibitör duyarlılığını ve modifikasyon yeteneklerini değerlendir.
Alfa-amanitine orta duyarlıdır (Pol II > Pol III > Pol I). 5' kepleme yapmaz.
Farklı RNA polimerazların yapısal farklılıkları, toksinlere duyarlılıklarını ve post-transkripsiyonel işleme kapasitelerini belirler.
3
Genel transkripsiyon faktörlerinin (TBP gibi) gerekliliğini kontrol et.
TBP, Pol III transkripsiyonu için gerekli olan TFIIIB kompleksinin bir parçasıdır.
TBP, ökaryotlarda bazal transkripsiyon mekanizmasının evrensel bir bileşenidir.

Anahtar Kavram

RNA Polimeraz III'ün İçsel (İnternal) Promotör Mekanizması

İpuçları

1
Promotör dizilerinin her zaman genin 'önünde' (upstream) yer alıp almadığını düşünün.
2
RNA Pol III tarafından sentezlenen tRNA genlerinin yapısal kontrol bölgelerinin (Kutu A ve B) kodlanan bölge içinde olduğunu hatırlayın.
3
TBP'nin sadece Pol II'ye mi özgü yoksa tüm polimerazlar için mi gerekli olduğunu değerlendirin.

Daha Fazla Pratik

RNA polimeraz II'nin CTD (karboksi-terminal domain) fosforilasyonunun transkripsiyon ve işleme süreçlerini nasıl koordine ettiğini inceleyin.

Alternatif Yöntem

RNA polimerazların ürün-promotör-inhibitör özelliklerini içeren bir tablo yaparak seçenekleri elemek en hızlı yoldur.
Tahmini Süre:1m 30s
Bu soruyu puanla