Soru

Zorluk: OrtaBakteri Genetiği

Bakterilerde antibiyotik direnç genlerinin yayılmasında ve mobil genetik elemanların genom içindeki hareketinde kritik rol oynayan transpozonların, hedef DNA molekülüne entegrasyonu sonrasında bu elemanın her iki yanında oluşan ve hedef DNA'daki baz dizisinin kısa bir kopyası niteliğindeki yapı aşağıdakilerden hangisidir?

  1. A
    Ters tekrarlar (Inverted repeats)
  2. Direkt tekrarlar (Direct repeats)Cevap
  3. C
    Palindromik diziler
  4. D
    Shine-Dalgarno dizisi
  5. E
    Okuma çerçevesi (Open reading frame)

Cevap

Direkt tekrarlar (Direct repeats), transpozonun hedef DNA'ya girmesi sonucunda hedef dizinin duplike olmasıyla oluşan yapılardır.
Doğru yanıt olan 'Direkt tekrarlar', transpozisyonun karakteristik bir özelliğidir. Transpozaz enzimi hedef DNA'yı basamaklı (staggered) bir şekilde kestiği için, transpozon araya girdiğinde oluşan boşluklar DNA polimeraz tarafından sentezlenerek doldurulur. Bu durum, transpozonun hemen dışında ve her iki yanında hedef bölgedeki dizinin özdeş kopyalarının oluşmasına neden olur.

Adım Adım Çözüm

1
Transpozisyon mekanizmasını analiz etme
Transpozonlar, transpozaz enzimi aracılığıyla hedef DNA'da belirli bir bölgeye girerler.
Mekanizmanın başlangıç aşamasını anlamak, oluşan yapısal sonuçları öngörmeyi sağlar.
2
Transpozaz enziminin kesim şeklini belirleme
Enzim, hedef DNA'nın iki zincirini aynı noktadan değil, basamaklı (staggered) bir şekilde keser.
Basamaklı kesim, tek zincirli yapışkan uçlar gibi boşluklar yaratır.
3
Entegrasyon ve onarım sürecini değerlendirme
Transpozon bu boşluğa yerleşir ve oluşan tek zincirli boşluklar DNA polimeraz tarafından doldurulur.
Boşlukların doldurulması, kesilen hedef dizinin her iki tarafta da kopyalanmasına yol açar.
4
Sonuç dizilerini isimlendirme
Transpozonun her iki yanında aynı yönde bulunan bu kısa diziler 'Direkt tekrarlar' olarak adlandırılır.
Bu yapı, bir DNA bölgesine transpozon girdiğinin moleküler kanıtıdır.

Anahtar Kavram

Hedef bölge duplikasyonu (Target site duplication)
Tahmini Süre:1m 15s
Bu soruyu puanla