Examkin

Soru

Zorluk: Çok zorBakteri Genetiği

Klinik bir izolatın moleküler analizinde, tetrasiklin direnç geninin (tetMtetM) yaklaşık 18 kb büyüklüğünde, hem konjugatif plazmidlerin hem de transpozonların özelliklerini birleştiren bir "İntegre Konjugatif Eleman" (ICE, örn. Tn916Tn916) üzerinde yer aldığı saptanmıştır. Bu genetik eleman kromozomdan ayrılıp dairesel bir ara form oluşturabilmekte ve başka bir bakteriye konjugasyonla aktarılabilmektedir. Buna göre, bahsi geçen bu genetik elemanın (ICE) özellikleri ile ilgili aşağıdaki ifadelerden hangisi yanlıştır?

  1. A
    Kromozomdan ayrılma (eksizyon) işlemi, eleman tarafından kodlanan integras ve eksizyonas proteinleri aracılığıyla gerçekleştirilir.
  2. Eksizyon sonrası oluşan dairesel ara form, hücre içinde konjugasyon gerçekleşene kadar otonom olarak çoğalabilen bir replikondur.Cevap
  3. C
    Aktarım sürecinde, verici hücreden alıcı hücreye tek iplikli DNA (ssDNAssDNA) formu Tip IV sekresyon sistemine benzer bir yapı ile transfer edilir.
  4. D
    Alıcı hücreye geçen genetik materyal, çift iplikli hale geldikten sonra bakteriyel kromozomdaki tercihli veya rastgele bölgelere entegre olur.
  5. E
    Klasik transpozonların aksine, hedef DNA'ya entegre olduklarında uç bölgelerde hedef dizi duplikasyonuna (targettarget sitesite duplicationduplication) neden olmazlar.

Cevap

Eksizyon sonrası oluşan dairesel ara formun hücre içinde otonom olarak çoğalabilen bir replikon olduğu ifadesi yanlıştır.
İntegre Konjugatif Elemanlar (ICE), kromozomdan ayrıldıklarında dairesel bir yapı oluştururlar fakat bu yapı bir replikon değildir. Yani kendi başına hücre içinde çoğalamazlar. Bu elemanlar ancak bir hücreden diğerine aktarılmak üzere bu dairesel forma geçerler ve alıcı hücrede tekrar kromozoma entegre olurlar.

Adım Adım Çözüm

1
Genetik elemanın tipini tanımlama
Soruda tanımlanan eleman bir İntegre Konjugatif Eleman (ICE) olan Tn916Tn916 benzeri bir yapıdır.
Hem kromozoma entegre olma (transpozon özelliği) hem de konjugatif aktarım (plazmid özelliği) göstermesi ICE'leri tanımlar.
2
Replikon kavramını sorgulama
ICE'ler dairesel ara yapı oluştursa da kendi replikasyon orijinleri yoktur.
Plazmidlerin aksine ICE'ler otonom replike olamazlar (replikon değildirler), bu yüzden sitoplazmada serbest ve kararlı bir şekilde çoğalarak kalamazlar.
3
Transfer ve entegrasyon mekanizmasını doğrulama
Aktarım ssDNAssDNA olarak yapılır ve entegrasyon sırasında hedef dizi duplikasyonu oluşmaz.
ICE'ler konjugasyon proteinlerini kodlar ve integras mekanizması transpozonlardan farklı olarak hedef bölgede tekrar dizileri oluşturmaz.

Anahtar Kavram

İntegre Konjugatif Elemanlar (ICE), plazmidlerin konjugasyon yeteneği ile transpozonların entegrasyon yeteneğini birleştiren, ancak otonom replikasyon yeteneği olmayan (replikon olmayan) mobil genetik elemanlardır.

Alternatif Yöntem

Plazmidler ile ICE'ler arasındaki en temel farkın 'otonom replikasyon' yeteneği (replikon olma durumu) olduğunu hatırlayarak seçenekleri eleyebilirsiniz.
Tahmini Süre:2m 0s
Bu soruyu puanla

Konular

Bakteri Genetiği

Bu konudan daha fazla soru