Examkin

Soru

Zorluk: Çok zorDNA Replikasyonu

Ökaryotik DNADNA replikasyonu sırasında, kesintili zincirde (lagging strand) sentezlenen Okazaki fragmanlarının olgunlaşması sürecinde; RNARNA primeri ve DNADNA polimeraz α\alpha tarafından sentezlenen, hata oranı yüksek ilk deoksiribonükleotit dizilerinin uzaklaştırılması gerekir. Bu süreçte, bir sonraki Okazaki fragmanının sentezini gerçekleştiren polimeraz, önceki fragmanın 5′5' ucundaki primer bölgesini kalıptan ayırarak bir 'flap' (kanat) yapısı oluşturur.

Bu 'yer değiştirme sentezini' (displacement synthesis) gerçekleştiren polimeraz ve oluşan bu nükleotit kanadını uygun noktadan keserek uzaklaştıran 'flap endonükleaz' aşağıdakilerin hangisinde birlikte verilmiştir?

  1. DNADNA polimeraz δ\delta ve FEN1FEN1Cevap
  2. B
    DNADNA polimeraz ϵ\epsilon ve RNazRNaz HH
  3. C
    DNADNA polimeraz α\alpha ve DNADNA polimeraz II
  4. D
    DNADNA polimeraz β\beta ve APE1APE1
  5. E
    DNADNA polimeraz γ\gamma ve DNADNA Ligaz IIIIII

Cevap

DNADNA polimeraz δ\delta ve FEN1FEN1 çifti, ökaryotik Okazaki fragmanlarının olgunlaşmasında 'yer değiştirme sentezi' ve 'flap kesimi' basamaklarını gerçekleştirir.
Ökaryotlarda DNADNA polimeraz δ\delta, kesintili zincir sentezi sırasında bir önceki Okazaki fragmanına ulaştığında, o fragmanın 5′5' ucundaki primer ve hata oranı yüksek ilk DNADNA bölgesini kalıptan ayırarak bir 'flap' oluşturur. Bu nükleotit kanadı, FEN1FEN1 enzimi tarafından kesilerek uzaklaştırılır. Bu süreç, prokaryotlardaki DNADNA polimeraz II'ın yaptığı işin ökaryotik karşılığıdır.

Adım Adım Çözüm

1
Zincir özgüllüğünü belirle.
Okazaki fragmanları 'kesintili zincir' (lagging strand) üzerinde sentezlenir.
Replikasyon çatalı 5′→3′5' \rightarrow 3' yönünde ilerlerken, ters yönde kalan kalıp zincir parçalar halinde sentezlenmek zorundadır.
2
Sentezleyici polimerazı tanımla.
Ökaryotlarda kesintili zincirdeki uzama sentezi DNADNA polimeraz δ\delta tarafından yapılır.
DNADNA polimeraz ϵ\epsilon kesintisiz zinciri sentezlerken, δ\delta alt birimi Okazaki fragmanlarının sentezinden ve primer bölgesine ulaşıldığında 'yer değiştirme' sentezinden sorumludur.
3
Primer uzaklaştırma mekanizmasını analiz et.
DNADNA polimeraz δ\delta, önceki fragmanın 5′5' ucuna ulaştığında durmaz, senteze devam ederek primeri kalıptan ayırır ve bir 'kanat' (flap) oluşturur.
Ökaryotlarda prokaryotlardaki gibi 5′→3′5' \rightarrow 3' ekzonükleaz aktivitesine sahip bir polimeraz (Pol I gibi) yerine, bu mekanizma tercih edilir.
4
Endonükleazı belirle.
FEN1FEN1 (Flap Endonuclease 1) bu yapıyı keser.
FEN1FEN1, tek zincirli DNA/RNADNA/RNA kanatlarını (flap) kökünden keserek uzaklaştıran spesifik bir endonükleazdır.

Anahtar Kavram

Ökaryotik Okazaki Fragmanı Olgunlaşması (Pol δ\delta - FEN1 İşbirliği)

Daha Fazla Pratik

Eğer yerinden edilen kanat (flap) çok uzunsa, FEN1FEN1 tek başına yetersiz kalabilir. Bu durumda hangi nükleazın (DNA2DNA2) devreye girdiğini incelemek konuyu pekiştirecektir.
Tahmini Süre:2m 0s
Bu soruyu puanla

Konular

DNA Replikasyonu

Bu konudan daha fazla soru