Soru

Zorluk: OrtaRNA Sentezi (Transkripsiyon)

Ökaryotik hücrelerde RNA polimeraz II tarafından gerçekleştirilen transkripsiyon sürecinde, enzimin promotör bölgesinden uzaklaşarak uzama (elongasyon) fazına geçişini sağlayan ve aynı zamanda 55' şapka (capping) enzimlerinin sentezlenen RNA'ya dahil edilmesini koordine eden temel mekanizma aşağıdakilerden hangisidir?

  1. A
    Sigma (σ\sigma) faktörünün çekirdek enzim kompleksinden ayrılması
  2. RNA polimeraz II'nin karboksi-terminal domaini (CTD) üzerindeki serin kalıntılarının fosforillenmesiCevap
  3. C
    Sentezlenen RNA'nın 33' ucuna poli-A kuyruğunun eklenmesi
  4. D
    Rho (ρ\rho) proteininin sentezlenen RNA üzerindeki özgül dizilere bağlanması
  5. E
    DNA kalıp zinciri üzerindeki durdurucu (stop) kodon dizisinin tanınması

Cevap

RNA polimeraz II'nin karboksi-terminal domaini (CTD) üzerindeki serin kalıntılarının fosforillenmesi
RNA polimeraz II'nin karboksi-terminal domaini (CTD), enzimin en büyük alt biriminin uzantısıdır ve tekrarlayan yedi amino asitlik dizilerden oluşur. TFIIH tarafından bu domaindeki serin kalıntılarının fosforillenmesi, transkripsiyonun başlatılmasından uzama (elongasyon) fazına geçişi tetikler ve kepleme enzimlerini bölgeye çekerek sentezlenen RNA'nın korunmasını sağlar.

Adım Adım Çözüm

1
RNA polimeraz II'nin promotör bölgesine bağlanma mekanizmasını analiz edin.
RNA polimeraz II, genel transkripsiyon faktörleri (TFIIA-H) ile birlikte pre-inisiasyon kompleksini (PIC) oluşturur.
Enzimin transkripsiyona başlayabilmesi için önce doğru bölgeye konumlanması gerekir.
2
Başlangıçtan uzamaya geçiş aşamasını inceleyin.
TFIIH faktörünün kinaz aktivitesi, RNA polimeraz II'nin en büyük alt biriminin kuyruk kısmı olan CTD'yi fosforiller.
Bu fosforillenme, enzimin promotördeki faktörlerden kopmasını (promoter clearance) sağlar.
3
RNA işleme faktörlerinin nasıl dahil edildiğini değerlendirin.
Fosforillenmiş CTD kuyruğu, 55' kepleme (capping) enzimi ve daha sonra splicing faktörleri için bir bağlama platformu oluşturur.
Eş zamanlı (co-transcriptional) RNA işlemesi için CTD'nin modifikasyonu zorunludur.

Anahtar Kavram

RNA Polimeraz II Karboksi-Terminal Domain (CTD) Modifikasyonu

İpuçları

1
Transkripsiyonun başlamasından hemen sonra RNA'nın 55' ucuna bir 'şapka' takılması gerektiğini hatırlayın.
2
Ökaryotik RNA polimeraz II'nin, prokaryotik olandan farklı olarak çok uzun ve modifiye edilebilir bir 'kuyruk' yapısına sahip olduğunu düşünün.
3
Karboksi-terminal domain (CTD) fosforillenmesi, transkripsiyonun farklı aşamalarında farklı işleme faktörlerinin (kepleme, splicing) işe alınmasını sağlar.

Daha Fazla Pratik

RNA polimeraz I, II ve III'ün sentezlediği ürünleri ve her birinin alfa-amanitin duyarlılığını karşılaştıran tabloyu inceleyin.
Tahmini Süre:1m 15s
Bu soruyu puanla