Soru

Zorluk: Çok zorGenel Viroloji

Viroloji araştırmalarında, bazı pozitif polariteli tek iplikli RNA (+ssRNA+ssRNA) virüslerinin, konak hücrenin translasyon mekanizmasını sabote ederek kendi replikasyon avantajlarını sağladıkları bilinmektedir. Özellikle bir virüs ailesinde, viral genom tarafından kodlanan bir proteaz (örneğin 2A2A proteaz), ökaryotik başlatma faktörü 4G'yi (eIF−4GeIF-4G) spesifik olarak parçalayarak konak hücrenin cap-bağımlı protein sentezini hızla durdururken (host shut-off), viral RNA'nın 5′5' ucunda bulunan dahili ribozom giriş bölgesi (IRESIRES) sayesinde viral protein sentezinin devam etmesini sağlar.

Buna göre, saflaştırılmış genomu doğrudan enfektif özelliğe sahip olan ve yukarıda tanımlanan translasyon stratejisini kullanan virüs ailesi aşağıdakilerden hangisidir?

  1. PicornaviridaeCevap
  2. B
    Caliciviridae
  3. C
    Togaviridae
  4. D
    Flaviviridae
  5. E
    Orthomyxoviridae

Cevap

Picornaviridae ailesi, saflaştırılmış +ssRNA+ssRNA genomu enfektif olan, translasyonda IRESIRES kullanan ve konak hücre translasyonunu eIF−4GeIF-4G parçalanması yoluyla durduran gruptur.
Picornaviridae ailesi üyeleri (örneğin Poliovirus), pozitif polariteli tek iplikli RNA genomuna sahiptir ve bu genom saflaştırılmış halde hücreye verildiğinde enfektif özellik gösterir. Replikasyon döngüsünün erken evrelerinde viral 2A2A proteaz, konak hücrenin translasyonu için kritik olan eIF−4GeIF-4G faktörünü parçalar. Bu durum konak hücrenin kendi proteinlerini sentezlemesini engellerken, viral RNA'nın 5′5' ucundaki IRESIRES bölgesi sayesinde ribozomlar viral genomu tanımaya devam eder.

Adım Adım Çözüm

1
Genom polaritesini ve enfektiviteyi değerlendir
Saflaştırılmış genomun enfektif olması, virüsün pozitif polariteli tek iplikli RNA (+ssRNA+ssRNA) genomuna sahip olduğunu kanıtlar.
+ssRNA+ssRNA genomlar, hücre içinde doğrudan mRNAmRNA gibi davranarak viral proteinlerin sentezini başlatabilirler.
2
Translasyon başlangıç mekanizmasını analiz et
Dahili ribozom giriş bölgesi (IRESIRES) kullanımı, virüsün 5′5' cap-bağımlı translasyon mekanizmasına ihtiyaç duymadığını gösterir.
Bu özellik virüsün, konak hücrenin cap-bağımlı translasyonunu durdurduğu durumlarda bile kendi proteinlerini sentezlemesine olanak tanır.
3
Host shut-off mekanizmasını belirle
eIF−4GeIF-4G (ökaryotik başlatma faktörü 4G) proteininin viral proteazlar (örneğin Picornavirüslerdeki 2A2A proteaz) tarafından parçalanması, konak hücre translasyonunun durdurulmasında anahtar rol oynar.
eIF−4GeIF-4G, cap-bağlayıcı kompleks (eIF−4FeIF-4F) için bir iskelet görevi görür ve parçalandığında ribozomun cap yapılarına tutunması engellenir.

Anahtar Kavram

Picornavirüslerde viral proteazlar aracılığıyla konak hücre translasyon faktörlerinin (eIF−4GeIF-4G) hedef alınması ve IRESIRES üzerinden viral protein sentezi.
Bu soruyu puanla