Soru

Zorluk: ZorEnzimlerin Yapısal Özellikleri ve Sınıflandırma

Enzimlerin biyolojik aktivitelerini gösterebilmeleri için protein kısımlarına (apoenzim) ek olarak yardımcı bir gruba (kofaktör) ihtiyaç duyabildikleri ve bu yapının tamamına holoenzim dendiği bilinmektedir. Bu bağlamda; katalizlediği reaksiyon sırasında bir substratın yapısındaki çift bağa su (H2OH_2O) ekleyerek bağın doyurulmasını sağlayan, ancak bu işlem sırasında substratı iki farklı ürüne parçalamayan ve ATPATP tüketimi gerçekleştirmeyen bir enzim, IUBMB (International Union of Biochemistry and Molecular Biology) sınıflamasına göre aşağıdakilerden hangisinde yer alır?

  1. A
    Oksidoredüktaz
  2. B
    Transferaz
  3. C
    Hidrolaz
  4. LiyazCevap
  5. E
    Ligaz

Cevap

Doğru yanıt Liyaz sınıfıdır; çünkü bu enzimler su kullanarak bir bağı parçalamak (hidroliz) yerine, bir çift bağa su ekleyerek (hidrasyon) molekül bütünlüğünü bozmadan reaksiyonu gerçekleştirirler.
Liyaz sınıfı enzimler, substratın yapısındaki çift bağlara su, amonyak veya karbondioksit gibi moleküllerin eklenmesini (veya tersi yönde ayrılmasını) katalizlerler. Bu reaksiyonlarda substrat parçalanmaz ve ATPATP enerjisi harcanmaz. Karbonik anhidraz ve fumaraz gibi enzimler bu sınıfa örnektir.

Adım Adım Çözüm

1
Reaksiyonun temel mekanizmasını analiz etme
Çift bağa su eklenmesi (hidrasyon) veya çift bağ oluşturulması (dehidratasyon).
Bu mekanizma enzim sınıflarını ayırt etmek için anahtar kriterdir.
2
Hidroliz ve liyaz farkını değerlendirme
Molekülün ikiye bölünmemesi, işlemin bir 'hidroliz' değil 'hidrasyon' (katılma) olduğunu gösterir.
Hidrolazlar suyla bağ koparırken, liyazlar çift bağ üzerinden işlem yapar.
3
Enerji ve kofaktör ihtiyacını kontrol etme
ATP kullanılmaması ligaz sınıfını eler; metal iyonu kofaktörü ise birçok sınıfta bulunabilen yapısal bir özelliktir.
Ligazlar mutlaka yüksek enerjili fosfat bağı hidrolizi ile çalışır.

Anahtar Kavram

Liyazlar (EC 4), hidroliz veya oksidasyon dışında bir yöntemle bağları koparan veya çift bağlara grup ekleyen enzimlerdir; su kullanımı 'hidroliz' anlamına gelmek zorunda değildir.
Tahmini Süre:1m 30s
Bu soruyu puanla