Examkin

Question

Difficulty: HardPeptid Bağı ve Biyolojik Aktif Peptidler

Proteinlerin primer yapısını oluşturan peptid bağının atomik organizasyonu ve fizyolojik önemi olan spesifik peptidler değerlendirildiğinde, aşağıdakilerden hangisi doğrudur?

  1. Peptid birimini oluşturan altı atom (CαC_\alpha, CC, OO, NN, HH ve komşu CαC_\alpha) koplanardır ve rezonans nedeniyle C−NC-N bağı etrafında serbest dönüş kısıtlanmıştır.Answer
  2. B
    Hücrenin en önemli antioksidanlarından biri olan glutatyon tripeptidi, glutamatın α\alpha-karboksil grubu ile sisteinin amino grubu arasındaki standart peptid bağı aracılığıyla sentezlenir.
  3. C
    Peptid bağındaki C−NC-N mesafesi, rezonans etkisiyle tipik bir C−NC-N tekli bağından (1.45 A˚1.45 \text{ \AA}) daha uzun bir değer kazanarak bağın kararlılığını artırır.
  4. D
    Fizyolojik proteinlerde peptid bağları, yan zincirler (R grupları) arasındaki sterik etkileşimleri minimize etmek amacıyla hemen hemen her zaman 'cis' konfigürasyonunda bulunur.
  5. E
    Birer nöropeptid olan oksitosin ve vazopressin, hipofiz arka lobunda sentezlenen ve C-terminalinde serbest karboksil grubu bulunduran lineer peptidledir.

Answer

Peptid birimini oluşturan altı atomun (CαC_\alpha, CC, OO, NN, HH ve komşu CαC_\alpha) aynı düzlemde yer alması ve C−NC-N bağının rezonans nedeniyle serbestçe dönememesi doğrudur.
Doğru olan ifade, peptid bağının rezonans hibrit yapısı nedeniyle C−NC-N bağı etrafında dönüşün kısıtlı olması ve bu bağ çevresindeki altı atomun (iki CαC_\alpha ve aradaki peptid grubu atomları) aynı düzlemde yer almasıdır. Bu rijit yapı protein katlanması için temel kısıtlayıcı faktördür.

Step-by-Step Solution

1
Peptid bağının rezonans yapısını incele.
Azot üzerindeki ortaklanmamış elektron çifti karbonil grubu ile rezonansa girerek C−NC-N bağına %40 oranında çift bağ karakteri kazandırır.
Bu durum C−NC-N bağının dönmesini engeller ve bağı rijit bir düzleme hapseder.
2
Düzlemdeki atomları belirle.
İki ardışık CαC_\alpha atomu ile aradaki C,O,N,HC, O, N, H atomları (toplam 6 atom) aynı düzlemde (koplanar) dizilir.
Peptid grubunun geometrisi bu altı atomun konumu ile tanımlanır.
3
Diğer biyolojik aktif peptidlerin yapısal özelliklerini kontrol et.
Glutatyonun atipik γ\gamma-bağına, hormonların sentez yerlerine ve C-terminal amidasyonuna dikkat et.
Bu detaylar standart protein yapısından sapmaları belirlemek için gereklidir.

Key Concept

Peptid bağının rezonans hibrit karakteri ve koplanar atomik dizilimi

Practice More

Peptid bağı düzlemleri arasındaki ϕ\phi (phi) ve ψ\psi (psi) açılarını ve Ramachandran grafiğini inceleyerek sekonder yapı oluşumunu pekiştirebilirsiniz.
Estimated Time:1m 40s
Rate this question

Topics

Peptid Bağı ve Biyolojik Aktif Peptidler

More questions from this topic