Examkin

Question

Difficulty: HardPeptid Bağı ve Biyolojik Aktif Peptidler

Proteinlerin sekonder yapısının belirlenmesinde kısıtlayıcı bir rol oynayan peptid bağının biyokimyasal karakteristikleri ile vücutta önemli fizyolojik görevleri bulunan aktif peptidler birlikte değerlendirildiğinde, aşağıdakilerden hangisi doğrudur?

  1. Peptid bağı rezonans hibrit yapısı nedeniyle kısmi çift bağ karakteri taşır; bu durum C−NC-N bağı etrafındaki rotasyonu kısıtlarken, zincirin esnekliği sadece α\alpha-karbon atomuna komşu bağların ϕ\phi ve ψ\psi torsiyon açılarındaki dönmelerle sağlanır.Answer
  2. B
    Oksitosin ve vazopressin, hipotalamusta sentezlenip arka hipofizden salınan, yapısal olarak birbirine çok benzeyen ancak sistein kalıntıları arasında disülfid köprüsü içermeyen doğrusal nonapeptid yapısındaki hormonlardır.
  3. C
    Hücrenin en önemli antioksidanlarından biri olan glutatyon (γ\gamma-glutamil-sisteinil-glisin), glutamatın α\alpha-karboksil grubu ile sisteinin amino grubu arasında kurulan standart bir peptid bağına sahiptir.
  4. D
    Peptid bağındaki C−NC-N mesafesi, rezonans nedeniyle tipik bir tekli bağdan (1.491.49 Å) daha uzundur ve bu özellik polipeptid zincirine beklenenden daha fazla konformasyonel serbestlik kazandırır.
  5. E
    Amino asitlerin yan zincirleri (R grupları) arasındaki sterik etkileşimleri en aza indirmek amacıyla, doğal proteinlerdeki peptid bağları hemen hemen her zaman 'cis' konfigürasyonunda bulunur.

Answer

Peptid bağı rezonans nedeniyle sert ve düzlemseldir; rotasyon kısıtlıdır ve zincir esnekliği α\alpha-karbon etrafındaki ϕ\phi (fı) ve ψ\psi (psi) açılarından kaynaklanır.
Peptid bağı, karbonil karbonu ile azot atomu arasındaki elektron paylaşımı (rezonans) nedeniyle kısmi çift bağ karakterine sahiptir. Bu özellik bağı sert ve düzlemsel kılar, C−NC-N ekseni etrafında dönmeyi imkansız hale getirir. Polipeptid zinciri üzerindeki esneklik, bu düzlemlerin birbirine bağlandığı α\alpha-karbon atomu etrafındaki N−CαN-C_{\alpha} (ϕ\phi) ve Cα−CC_{\alpha}-C (ψ\psi) bağlarının dönmesiyle sağlanır.

Step-by-Step Solution

1
Peptid bağının atomik yapısını analiz et.
Peptid bağı (CONHCONH), karbonil karbonu üzerindeki elektronların azot atomuyla rezonansa girmesi sonucu oluşur.
Rezonans, C−NC-N bağına %40 oranında çift bağ karakteri kazandırır.
2
Bağın rotasyonel özelliklerini değerlendir.
C−NC-N bağı etrafındaki dönme engellenmiştir (rijit yapı).
Çift bağ karakteri atomların aynı düzlemde kalmasını zorunlu kılar.
3
Polipeptid zincirindeki hareketli noktaları belirle.
Rotasyon sadece N−CαN-C_{\alpha} (ϕϕ) ve Cα−CC_{\alpha}-C (ψψ) bağları etrafında gerçekleşebilir.
Bu bağlar saf tekli bağ karakterindedir ve protein katlanması bu açılar üzerinden yönetilir.
4
Biyolojik aktif peptidlerin (glutatyon, oksitosin) yapısal hatalarını ele.
Glutatyonun γγ bağı içermesi ve oksitosinin disülfid köprüsü taşıması gibi ayırt edici özellikleri doğrula.
Bu detaylar seçeneklerdeki yanlış ifadelerin elenmesini sağlar.

Key Concept

Peptid bağının rezonans hibrit karakteri ve polipeptid zinciri üzerindeki konformasyonel kısıtlamalar.

Practice More

Ramachandran diyagramı üzerinde ϕ\phi ve ψ\psi açılarının hangi bölgelerinin sekonder yapılarla (alfa-heliks, beta-tabaka) eşleştiğini inceleyiniz.
Estimated Time:1m 30s
Rate this question

Topics

Peptid Bağı ve Biyolojik Aktif Peptidler

More questions from this topic