Enzimler

Farmakolojik bir araştırmada, HMG-KoA redüktaz enzimi üzerinde iki farklı inhibitörün etkisi incelenmektedir. Birinci inhibitör olan statin molekülünün substrat ile yarışarak aktif bölgeye bağlandığı; ikinci inhibitör olan deneysel bir ajanın ise sadece enzim-substrat ($ES$) kompleksi oluştuğunda yapıya bağlandığı belirlenmiştir. Bu iki inhibitörün (statin ve deneysel ajan) kinetik etkileri Lineweaver-Burk grafiğinde karşılaştırıldığında; statin varlığındaki eğriden deneysel ajan varlığındaki eğriye geçildiğinde grafiksel parametrelerdeki değişimle ilgili aşağıdakilerden hangisi doğrudur?

Akut miyokard enfarktüsü (AMI) tanısıyla izlenen bir hastada, ilk semptomların başlamasından yaklaşık 96 saat (4 gün) sonra yeni bir göğüs ağrısı şikayeti gelişmiştir. Serum düzeyinin kısa sürede (48-72 saat) normale dönmesi nedeniyle, bu hastada gelişen olası bir re-infarktüsü (tekrarlayan enfarktüs) saptamada en duyarlı olan enzim aşağıdakilerden hangisidir?

Kollajen ve elastin liflerinin ekstraselüler matrikste yapısal bütünlüğünü sağlayan çapraz bağların (cross-link) oluşumunda; lizil ve hidroksilizil kalıntılarının oksidatif deaminasyonunu gerçekleştirerek alizil aldehitlerini oluşturan Lizil Oksidaz enziminin International Union of Biochemistry and Molecular Biology (IUBMB) sınıflandırması ve yapısal özellikleri ile ilgili aşağıdakilerden hangisi doğrudur?

Akut göğüs ağrısı şikayetiyle acil servise başvuran $60$ yaşındaki bir hastada yapılan laboratuvar incelemelerinde kardiyak troponin I ($cTnI$) düzeyi yüksek saptanmıştır. Miyokard enfarktüsü ($AMI$) tanısında $cTnI$ düzeyinin ölçülmesinin $CK-MB$ (Kreatin kinaz MB) izoenzimine göre en önemli klinik avantajı aşağıdakilerden hangisidir?

Halsizlik ve sarılık şikayeti ile başvuran bir hastada yapılan laboratuvar incelemelerinde; hemoglobin düzeyi düşük, indirekt bilirubin seviyesi yüksek ve haptoglobin düzeyi saptanamayacak kadar düşük bulunmuştur. Bu hastanın serum laktat dehidrogenaz ($LDH$) izoenzim analizi ile ilgili aşağıdaki ifadelerden hangisi doğrudur?

Alkali fosfataz ($ALP$) enziminin doku spesifik izoenzimleri, biyokimyasal özelliklerine göre çeşitli yöntemlerle ayırt edilebilir. Bu yöntemlerden biri olan ısıya duyarlılık testinde, $56^\circ C$'de ısıtılmaya en duyarlı olan (en kolay denatüre olan) $ALP$ izoenzimi aşağıdakilerden hangisidir?

Glikojen yıkımında anahtar rol oynayan glikojen fosforilaz enzimi; glikojen zincirindeki $\alpha(1\rightarrow4)$ bağlarını koparırken su yerine inorganik fosfat ($P_i$) kullanır ve kofaktör olarak piridoksal fosfata ($PLP$) ihtiyaç duyar. IUBMB (International Union of Biochemistry and Molecular Biology) sınıflandırması ve enzimin yapısal özellikleri dikkate alındığında, bu enzimle ilgili aşağıdakilerden hangisi doğrudur?

Bir laboratuvar çalışmasında, bir enzimin normal formu ile afinitesi azalmış mutant bir formunun kinetik özellikleri karşılaştırılmaktadır. Yapılan ölçümlerde mutant enzimin Michaelis sabiti ($K_m$), normal enzimin $K_m$ değerinin tam olarak $4$ katı ($K_{m,mutant} = 4 \times K_{m,normal}$) olarak saptanmıştır. Her iki enzimin maksimum hızı ($V_{max}$) ise birbirine eşittir. Ortamdaki substrat konsantrasyonu, normal enzimin $K_m$ değerine eşit ($[S] = K_{m,normal}$) tutulduğunda; normal enzimin reaksiyon hızı $V_1$, mutant enzimin reaksiyon hızı $V_2$ olarak ölçülmüştür. Buna göre, $V_1 / V_2$ oranı kaçtır?

$65$ yaşında, uzun süreli ağır sigara kullanım öyküsü olan bir erkek hasta; iştahsızlık, belirgin kilo kaybı ve inatçı öksürük şikayetleriyle başvuruyor. Yapılan görüntüleme tetkiklerinde akciğerde santral yerleşimli bir kitle saptanıyor. Laboratuvar analizlerinde serum total kreatin kinaz ($CK$) aktivitesi $380$ U/L ($N < 190$ U/L) olarak bulunurken, immunoinhibisyon yöntemiyle ölçülen $CK-MB$ aktivitesi $440$ U/L olarak saptanıyor.

Bu hastadaki laboratuvar bulgularının (ölçülen $CK-MB$ değerinin total $CK$ değerinden yüksek çıkması) en olası nedeni aşağıdakilerden hangisidir?

Enzimlerin katalitik döngülerini tamamlayabilmeleri için ihtiyaç duydukları kofaktörler; bağlanma afinitelerine, enzime entegrasyon sürelerine ve kovalent bağ içerip içermediklerine göre 'prostetik grup' veya 'ko-substrat' (ko-enzim) olarak sınıflandırılırlar. Bazı enzimler metal iyonlarını yapısal bir parça olarak sıkıca tutarken (metalloenzimler), bazıları ise reaksiyon sırasında geçici olarak etkileşime girer.

Buna göre, aşağıdaki enzim-kofaktör eşleşmelerinden hangisinde kofaktörün bağlanma özelliği veya fonksiyonel sınıflandırması yanlış verilmiştir?

Tıbbi bir araştırma laboratuvarında izole edilen bir enzimin katalizlediği reaksiyon hızı, bir inhibitör varlığında test edilmektedir. Yapılan kinetik analizlerde, inhibitörün enzimin substrata olan ilgisini (affinitesini) değiştirmediği, ancak reaksiyonun ulaşabileceği en yüksek hızı kısıtladığı saptanmıştır.

Bu bulgulara göre, söz konusu inhibisyon tipinde Michaelis sabiti ($K_m$) ve maksimum hız ($V_{max}$) değerlerinin değişimi aşağıdakilerin hangisinde doğru olarak verilmiştir?

Michaelis-Menten kinetiğine uyan bir enzimle yapılan çalışmada; ortama inhibitör eklenmesi sonucunda enzimin maksimum hız ($V_{max}$) değerinin %50 oranında azaldığı, aynı zamanda enzimin yarı-maksimal hıza ulaşması için gereken substrat konsantrasyonunun ($K_m$) da başlangıç değerinin tam yarısına düştüğü saptanmıştır. Bu inhibisyon tipi ve Lineweaver-Burk grafiğindeki görünümü ile ilgili aşağıdaki ifadelerden hangisi doğrudur?

Kreatin kinaz ($CK$), iki farklı alt birimden ($M$ ve $B$) oluşan dimerik bir enzimdir. Bu enzimin özellikle kalp kası (miyokard) dokusuna özgü olan ve miyokard hasarını belirlemede klinik önemi bulunan izoenzimi aşağıdakilerden hangisidir?

Üre döngüsünün başlangıç ve hız kısıtlayıcı basamağını katalizleyen Karbamoil Fosfat Sentetaz I (CPS-I) enziminin regülasyonu ile ilgili aşağıdaki ifadelerden hangisi doğrudur?

Deneysel bir ilaç araştırmasında, hedef enzimin aktif bölgesine bağlanan bir molekülün başlangıçta enzime karşı düşük bir afinitesi olduğu, ancak enzimin bu molekülü kimyasal olarak modifiye etmesi sonucunda oluşan ürünün, enzimin aktif bölgesindeki bir amino asit kalıntısı ile geri dönüşümsüz bir kovalent bağ oluşturduğu saptanmıştır. Bu süreçte enzimin kendi katalitik gücünü kullanarak kendi inaktivasyonuna yol açtığı gözlenmiştir. Buna göre, bahsedilen inhibisyon mekanizması aşağıdakilerden hangisidir?

Piruvat dehidrogenaz (PDH) kompleksinin aktivitesi, PDH kinaz ve PDH fosfataz enzimlerinin etkisiyle kovalent modifikasyon yoluyla sıkı bir şekilde düzenlenir. PDH kinazın aktivitesinin baskılanması, kompleksin defosforillenmiş (aktif) formda kalma eğilimini artırarak piruvatın asetil-KoA'ya dönüşümünü teşvik eder. Buna göre, aşağıdakilerden hangisi PDH kinazı allosterik olarak inhibe ederek PDH kompleksinin aktivasyonuna katkıda bulunan düzenleyici bir moleküldür?

Hücre içi sinyal iletim yollarında ve metabolik yolların kontrolünde protein kinazlar ile protein fosfatazlar tarafından gerçekleştirilen 'kovalent modifikasyon' mekanizması kritik bir öneme sahiptir. Bu düzenleme mekanizması ile ilgili aşağıdaki ifadelerden hangisi doğrudur?

Amino asit metabolizmasının temel basamaklarından biri olan transaminasyon reaksiyonlarını katalizleyen aminotransferazlar (transaminazlar), aktivite göstermek için özgün bir koenzime ihtiyaç duyarlar. Bu enzimlerin katalitik mekanizması ve koenzim ilişkisi düşünüldüğünde, aşağıdaki ifadelerden hangisi doğrudur?

Hücre içi metabolik yolların farklı kompartmanlar arasında entegrasyonu, aynı reaksiyonu katalizleyen ancak farklı genetik kökenlere ve kinetik özelliklere sahip izoenzimlerin koordineli çalışmasıyla sağlanır. Malat-aspartat mekiğinin temel bileşenlerinden olan malat dehidrogenaz ($MDH$) izoenzimleri ($cMDH$ ve $mMDH$) ve bu sistemin işleyişi ile ilgili aşağıdakilerden hangisi doğrudur?

Hücre içi metabolik reaksiyonlarda görev alan koenzimler ve bunların vitamin öncülleri (prekürsörleri) ile ilgili aşağıdaki ifadelerden hangisi yanlıştır?