Soru

Zorluk: Çok zorPirimidin Yıkımı

Hücre içi nükleotid döngüsünde pirimidin katabolizması ve bu süreçte oluşan ürünlerin ileri metabolik organizasyonu ile ilgili aşağıdaki ifadelerden hangisi doğrudur?

  1. Timin yıkımı sonucunda oluşan R−βR-\beta-aminoizobütirat, metilmalonat semialdehit üzerinden süksinil-KoA'ya dönüştürülerek glukoneogenetik bir substrat olarak kullanılabilir.Cevap
  2. B
    Pirimidin yıkımının hız kısıtlayıcı basamağı olan dihidropirimidin dehidrogenaz enzimi, NADPH kullanarak pirimidin halkasını açar ve β\beta-üreidopropiyonat oluşturur.
  3. C
    Urasil ve sitozinden köken alan β\beta-alanin, insan metabolizmasında sadece nükleotid yıkımıyla sentezlenebilen ve başka kaynağı olmayan bir moleküldür.
  4. D
    Pirimidin yıkım ürünlerinin pürinlerin aksine suda çözünürlükleri oldukça düşüktür ve idrarla atılmaları sırasında kristalüriye neden olurlar.
  5. E
    Sitozin ve urasilin yıkımından elde edilen karbon iskeleti, doğrudan dallı zincirli amino asitlerin sentezinde temel yapı taşı olarak kullanılır.

Cevap

Timin yıkımıyla oluşan R−βR-\beta-aminoizobütiratın metilmalonat semialdehit üzerinden süksinil-KoA'ya dönüşerek glukoneogenetik substrat olarak işlev görmesi doğrudur.
Timin katabolizması sonucunda oluşan β\beta-aminoizobütirat, amino grubunu kaybederek metilmalonat semialdehite dönüşür. Bu molekül daha sonra propiyonil-KoA ve metilmalonil-KoA üzerinden süksinil-KoA'ya dönüştürülür. Süksinil-KoA, TCA döngüsüne girerek oksaloasetat üzerinden glukoneogeneze katılabilir. Bu nedenle timin yıkım ürünleri glukoneogenetiktir.

Adım Adım Çözüm

1
Timin katabolizmasının son ürününü belirle.
β\beta-aminoizobütirat (RR formu).
Timin, urasilden farklı olarak metil grubu içerdiği için yıkım ürünü β\beta-alanin değil, β\beta-aminoizobütirattır.
2
β\beta-aminoizobütiratın ileri metabolik yolunu analiz et.
Metilmalonat semialdehit oluşumu.
β\beta-aminoizobütirat transaminasyon reaksiyonuna girer.
3
TCA döngüsüne giriş noktasını tespit et.
Süksinil-KoA.
Metilmalonat semialdehit →\rightarrow Propiyonil-KoA →\rightarrow Metilmalonil-KoA →\rightarrow Süksinil-KoA yolu izlenir.
4
Glukoneogenetik potansiyeli değerlendir.
Süksinil-KoA üzerinden glikoz sentezi mümkündür.
TCA döngüsü ara ürünleri glukoneogenez için substrat sağlayabilir.

Anahtar Kavram

Pirimidin katabolizması ürünlerinin (β\beta-alanin ve β\beta-aminoizobütirat) suda çözünürlüğü ve timin türevinin glukoneogenetik akıbeti.

İpuçları

1
Timin yıkım ürünü olan β\beta-aminoizobütiratın idrarda artışı, DNA döngüsünün (turnover) yüksek olduğu lösemi gibi durumlarda bir belirteçtir.
2
Timin yıkım ürününün karbon sayısı urasilden bir fazladır, bu yüzden süksinil-KoA yoluna girer.
3
Pirimidin halkası açıldıktan sonra oluşan ürünlerin TCA döngüsüne giriş noktalarını düşünün; timin propiyonat/metilmalonat yolunu izler.

Daha Fazla Pratik

Pirimidin yıkımının hız kısıtlayıcı enzimi olan dihidropirimidin dehidrogenaz (DPD) eksikliğinin 5-fluorourasil toksisitesi ile ilişkisini inceleyebilirsiniz.
Tahmini Süre:1m 30s
Bu soruyu puanla