Soru

Zorluk: Çok zorRNA Virüsleri

Arenavirüslerin (LassaLassa virüsü, Lenfositik koryomenenjit virüsü) genomik yapısı ve replikasyon stratejisi incelendiğinde; SS segmentinin 'ambisens' (çift anlamlı) kodlama özelliğine sahip olduğu görülür.

Bu replikasyon stratejisiyle ilgili aşağıdaki ifadelerden hangisi doğrudur?

  1. A
    Arenavirüsler genomlarını nükleusta replike ettikleri için, mRNAmRNA sentezi sırasında konak hücreye ait 'cap-snatching' (kep kapma) mekanizmasını sadece nükleus içinde gerçekleştirirler.
  2. B
    Glikoprotein (GPGP) geni genomik RNARNA'nın 5′5' ucunda pozitif polaritede bulunduğu için, virüs hücreye girdikten sonra bu bölge doğrudan konak ribozomları tarafından transle edilir.
  3. C
    Genomik RNARNA üzerindeki tüm genler, virüsün beraberinde taşıdığı RNARNA bağımlı DNADNA polimeraz enzimi ile DNADNA'ya aktarıldıktan sonra konak hücrenin RNARNA polimerazı tarafından transkribe edilir.
  4. Nükleokapsid (NN) proteini, genomik RNARNA'nın 3′3' yarısından sentezlenen bir mRNAmRNA aracılığıyla; glikoprotein (GPGP) ise replikasyon sırasında oluşan antijenomun 3′3' yarısından sentezlenen bir mRNAmRNA aracılığıyla eksprese edilir.Cevap
  5. E
    SS segmenti tek parça halinde (non-segmentli) olduğu için, replikasyon sırasında farklı virüs suşları arasında 'reassortment' (genetik yeniden düzenlenme) meydana gelmesi mümkün değildir.

Cevap

Arenavirüslerin ambisens S segmentinde; N proteini genomik RNA'dan, GP proteini ise replikasyon ara formu olan antijenomdan sentezlenen mRNA'lar aracılığıyla eksprese edilir.
Arenavirüslerin SS segmenti ambisens yapıdadır. Nükleokapsid (NN) geni genomik RNARNA'nın 3′3' yarısında negatif polaritede yer alır ve doğrudan mRNAmRNA'ya transkribe edilir. Glikoprotein (GPGP) geni ise genomik RNARNA'nın 5′5' yarısında pozitif polaritede yer almasına rağmen, konak ribozomları tarafından doğrudan tanınmaz. GPGP'nin ekspresyonu için önce tam boy bir antijenom (pozitif kopyası) sentezlenmeli, ardından bu antijenomun 3′3' ucundan (genomun 5′5' ucuna denk gelen yer) GPGP mRNAmRNA'sı transkribe edilmelidir. Bu çift yönlü transkripsiyon stratejisi ambisens genomların temel özelliğidir.

Adım Adım Çözüm

1
Genom yapısını analiz etme
Arenavirüs SS segmentinin ambisens olduğu, 3′3' ucunda negatif polariteli NN geninin, 5′5' ucunda ise pozitif polariteli GPGP geninin bulunduğu saptanır.
Ambisens stratejisinin temelini anlamak için genlerin yerleşimini bilmek gerekir.
2
Transkripsiyon basamaklarını değerlendirme
Viral RNARNA polimerazın 3′3' uçtan başlayarak NN mRNAmRNA'sını sentezlediği, ancak interjenik bölgedeki saç tokası (hairpin) yapısı nedeniyle GPGP genine geçemediği belirlenir.
Primer transkripsiyonun neden sadece bir geni kapsadığını açıklamak için.
3
Replikasyon ve ikincil transkripsiyonu inceleme
Tam boy antijenom sentezlendikten sonra, polimerazın antijenomun 3′3' ucundan (genomun 5′5' ucuna karşılık gelen bölge) başlayarak GPGP mRNAmRNA'sını sentezlediği görülür.
Pozitif polaritedeki GPGP geninin neden doğrudan değil de antijenom üzerinden eksprese edildiğini belirlemek için.

Anahtar Kavram

Ambisens RNA replikasyon stratejisi
Tahmini Süre:2m 0s
Bu soruyu puanla