Soru

Zorluk: Çok zorRibozomlar ve Proteazomlar

Ökaryotik hücrelerde protein homeostazının (proteostaz) korunması, sentezden sorumlu ribozomlar ile degradasyondan sorumlu proteazomların koordineli çalışmasına bağlıdır. Bu iki makromoleküler kompleksin yapısal organizasyonu ve fonksiyonel mekanizmalarıyla ilgili aşağıdaki ifadelerden hangisi doğrudur?

  1. A
    Ökaryotik 80S80S ribozomunun küçük alt birimi (40S40S), 28S28S rRNA ve yaklaşık 33 protein içerirken; büyük alt birim (60S60S) ise 18S18S, 5.8S5.8S ve 5S5S rRNA moleküllerinden oluşur.
  2. B
    Sitozolde serbest halde bulunan poliribozomlar; temel olarak plazma membranına entegre olacak proteinlerin, lizozomal enzimlerin ve hücre dışına salgılanacak proteinlerin sentezinden sorumludur.
  3. C
    Proteazomlar tarafından gerçekleştirilen protein yıkımı, lizozomal asit hidrolazların aktivitesine benzer şekilde ATP gerektirmeyen ve asidik ortamda optimize olan pasif bir süreçtir.
  4. D
    Ribozomun peptidil transferaz aktivitesi, mRNA kodonları ile tRNA antikodonları arasındaki eşleşmenin doğruluğunu kontrol eden 40S40S küçük alt birimi tarafından yürütülür.
  5. 26S26S proteazomun 19S19S regülatör ünitesi; ubikuitinlenmiş proteinin tanınması, ubikuitin zincirinin ayrılması ve ATP bağımlı olarak proteinin açılıp 20S20S çekirdek ünitesine yönlendirilmesini sağlar.Cevap

Cevap

26S proteazomun 19S regülatör ünitesi, ubikuitinlenmiş proteinin tanınmasından, deubikuitinasyondan ve ATP harcayarak proteinin üçüncül yapısının bozularak (unfolding) 20S merkezine itilmesinden sorumludur.
Doğru ifade, 26S26S proteazom kompleksinin işleyişini açıklar. Proteazomun 19S19S ünitesi, ubikuitin etiketli proteini tanır, ubikuitini geri dönüşüm için ayırır ve ATP'deki enerjiyi kullanarak proteini iplik gibi açıp 20S20S merkezindeki proteolitik aktif bölgeye gönderir.

Adım Adım Çözüm

1
Ribozom alt birimlerinin rRNA içeriğini analiz et.
Ökaryotlarda 40S40S alt birimi 18S18S rRNA; 60S60S alt birimi ise 28S28S, 5.8S5.8S ve 5S5S rRNA içerir.
Ribozomların moleküler yapısını ayırt etmek için.
2
Serbest ve bağlı ribozomların sentezlediği proteinlerin hedeflerini karşılaştır.
Bağlı ribozomlar salgı/membran/lizozom proteinlerini; serbest ribozomlar sitozol/çekirdek/organel (mitokondri, peroksizom) proteinlerini sentezler.
Hücre içi protein trafiğini anlamak için.
3
Proteazom mekanizmasını lizozomal yıkım ile karşılaştır.
Proteazomlar ATP bağımlıdır ve sitozolde (nötr pH) işlev görür; lizozomlar ise ATP bağımsız (hidrolitik) ve asidik ortamda aktiftir.
Hücre içi yıkım yollarını ayırt etmek için.
4
26S proteazomun yapısal parçalarını (19S ve 20S) değerlendir.
19S tanıma ve hazırlama (ATP harcanan kısım), 20S ise proteolitik parçalama (silindirik merkez) işini yapar.
Ubikuitin-proteazom yolunun detaylarını netleştirmek için.

Anahtar Kavram

Ökaryotik protein homeostazında ribozomların rRNA/protein içeriği ile proteazomların ATP bağımlı çalışma mekanizması.
Tahmini Süre:2m 30s
Bu soruyu puanla